GENOME
Assemblage à l'échelle chromosomique et analyse du génome de la culture de biomasse Miscanthus lutarioriparius
Nanopori sequencing |Illumina |Salute-C |RNA-sequencing |Filogenia
In questu studiu, Biomarker Technologies hà furnitu supportu tecnicu nantu à a sequenza di Nanopore, l'assemblea di genoma de novo, l'assemblea assistita Hi-C, etc.
Astrattu
Miscanthus, una pianta perenne rizomatosa, hà un grande potenziale per a produzzione di bioenergia per a so alta biomassa è a tolleranza di stress.Riportemu una assemblea à scala cromusomica diMiscanthus lutarioripariusgenoma cumminendu a sequenza di Oxford Nanopore è e tecnulugia Hi-C.L'assemblea 2.07-Gb copre 96.64% di u genoma, cù contig N50 di 1.71 Mb.E sequenze di centromeri è telomeri sò assemblati per tutti i 19 cromusomi è u cromusomu 10, rispettivamente.L'origine allotetraploide di M. lutarioriparius hè cunfirmata cù ripetizioni di satelliti centromerichi.A struttura di u genoma tetraploide è parechji riarrangiamenti cromosomiali relative à u sorgo sò chjaramente dimustrati.Tandem geni duplicati diM. lutarioripariussò arricchiti funziunali micca solu in termini ligati à a risposta di stress, ma a biosintesi di a parete cellulare.E famiglie di geni ligati à a resistenza à e malatie, a biosintesi di a parete cellulare è u trasportu di ioni metallichi sò assai sviluppati è evoluti.L'espansione di queste famiglie pò esse una basa genomica impurtante per u rinfurzà di e caratteristiche notevuli diM. lutarioriparius.
Statistiche chjave di l'assemblea di u genoma
Figura.Panoramica di u M. lutarioriparius genome assembly
Notizie è Highlights hà u scopu di sparta l'ultimi casi di successu cù Biomarker Technologies, catturà novi successi scientifichi è tecniche prominenti applicate durante u studiu.
Tempu di Postu: 05-Jan-2022