BMKCloud Log in
条形banner-03

Tin tức

bộ gen

Thiên nhiên_Truyền thông_Logo

Lắp ráp và phân tích quy mô nhiễm sắc thể của cây sinh khối bộ gen Miscanthus lutarioriparius

Giải trình tự Nanopore |Illumina |Hi-C |giải trình tự RNA |Phát sinh loài

Trong nghiên cứu này, Biomarker Technologies đã cung cấp hỗ trợ kỹ thuật về giải trình tự Nanopore, lắp ráp bộ gen de novo, lắp ráp có hỗ trợ Hi-C, v.v.

trừu tượng

Miscanthus, một loại cây thân rễ lâu năm, có tiềm năng lớn để sản xuất năng lượng sinh học nhờ sinh khối cao và khả năng chịu stress.Chúng tôi báo cáo một tập hợp quy mô nhiễm sắc thể củaMiscanthus lutarioripariusbộ gen bằng cách kết hợp công nghệ giải trình tự Oxford Nanopore và Hi-C.Tổ hợp 2,07 Gb bao phủ 96,64% bộ gen, với contig N50 là 1,71 Mb.Các trình tự tâm động và telomere được tập hợp tương ứng cho tất cả 19 nhiễm sắc thể và nhiễm sắc thể số 10.Nguồn gốc allotetraploid của M. lutarioriparius được xác nhận bằng cách sử dụng lặp lại vệ tinh trung tâm.Cấu trúc bộ gen tứ bội và một số sự sắp xếp lại nhiễm sắc thể liên quan đến lúa miến đã được thể hiện rõ ràng.Các gen nhân đôi song song củaM. lutarioripariusđược làm giàu chức năng không chỉ về mặt liên quan đến phản ứng căng thẳng mà còn về mặt sinh tổng hợp thành tế bào.Các họ gen liên quan đến khả năng kháng bệnh, sinh tổng hợp thành tế bào và vận chuyển ion kim loại được mở rộng và phát triển rất nhiều.Sự mở rộng của các họ này có thể là cơ sở di truyền quan trọng cho việc tăng cường các đặc điểm nổi bật củaM. lutarioriparius.

Số liệu thống kê chính về lắp ráp bộ gen

tin tức-1
tin tức-2

Nhân vật.Tổng quan về tập hợp bộ gen của M. lutarioriparius

Tin tức và điểm nổi bật nhằm mục đích chia sẻ những trường hợp thành công mới nhất với Biomarker Technologies, nắm bắt những thành tựu khoa học mới cũng như các kỹ thuật nổi bật được áp dụng trong quá trình nghiên cứu.


Thời gian đăng: Jan-05-2022

Gửi tin nhắn của bạn cho chúng tôi: