mRNA-seq (NGS) miaraka amin'ny genome fanondroana

Fitaovana mahazatra amin'ny siansa momba ny fiainana sy ny voly ny RNA-seq, izay mampifandray ny elanelana misy eo amin'ny genome sy ny proteome. Ny tanjany dia ny fahitana transcripts vaovao sy ny fandrefesana ny fanehoana azy ireo amin'ny alalan'ny assay iray. Ampiasaina betsaka amin'ny fandalinana transcriptomic mampitaha izy io, manazava ny fototarazo mifandraika amin'ny toetra na phenotype isan-karazany, toy ny fampitahana ny mutants amin'ny karazana wild-types na ny fanehoana ny fanehoana ny fototarazo amin'ny toe-javatra manokana. Ny BMKCloud mRNA (Reference) APP dia mampiditra ny fandrefesana ny fanehoana, ny famakafakana ny fanehoana samihafa (DEG), ary ny famakafakana ny firafitry ny filaharana ao amin'ny fantsona bioinformatika mRNA-seq (NGS) ary mampifangaro ny tanjaky ny rindrambaiko mitovy, miantoka ny fahamoran'ny fampiasana sy ny fahamoran'ny fampiasana azy. Afaka mampiditra ny angon-drakitra RNA-seq any amin'ny rahona ny mpampiasa, izay anoloran'ny App vahaolana feno sy tokana amin'ny famakafakana bioinformatika. Fanampin'izany, manome laharam-pahamehana ny traikefan'ny mpanjifa izy io, manolotra asa manokana mifanaraka amin'ny filàn'ny mpampiasa manokana. Afaka mametraka masontsivana ny mpampiasa ary manolotra ny iraka fantsona samirery, manamarina ny tatitra ifanakalozan-kevitra, mijery angon-drakitra/diagram ary mamita ny fitrandrahana angon-drakitra, toy ny: fisafidianana fototarazo kendrena, clustering functional, diagram, sns.