Sarintany hafanana
Ny fitaovana Heatmap dia manaiky rakitra angona matrix ho fampidirana ary ahafahan'ny mpampiasa manivana, manara-dalàna ary manangona angona. Ny tranga fampiasa voalohany amin'ny heatmaps dia ny famakafakana cluster ny haavon'ny fanehoana fototarazo eo anelanelan'ny santionany samihafa.
Gene Annotation
Ny fitaovan'ny Gene Annotation dia manao fanamarihan'ny fototarazo mifototra amin'ny filaharan'ny filaharana fampidirana rakitra FASTA amin'ny angon-drakitra isan-karazany.
Fitaovana Fikarohana Fandrindrana eo an-toerana fototra (BLAST)
Ny fitaovana BLAST dia kinova BMKCloud tafiditra ao amin'ny NCBI BLAST ary azo ampiasaina hanatontosana ireo asa mitovy amin'ny fampiasana angona nampidirina tao amin'ny kaonty BMKCloud.
Faminaniana CDS_UTR
Ny fitaovana CDS_UTR Prediction dia natao haminavina ny faritra kaody (CDS) sy faritra tsy misy kaody (UTR) amin'ny filaharan'ny transcript nomena mifototra amin'ny valin'ny BLAST manohitra ny angon-drakitra proteinina fantatra sy ny vokatry ny faminaniana ORF.
Manhattan Plot
Ny fitaovana Manhattan Plot dia ahafahan'ny fampisehoana andrana santionany avo lenta ary matetika ampiasaina amin'ny fanadihadiana momba ny genome-wide association (GWAS).
Circos Diagram
Ny fitaovan'ny CIRCOS Diagram dia manome sary an-tsaina mahomby amin'ny fizarana ny endri-javatra génomika manerana ny fototarazo. Ny endri-javatra mahazatra dia ahitana loci quantitative, SNPs, InDels, variants structural ary kopia.
Gene Ontology (GO) Enrichment
Ny fitaovana GO Enrichment dia manome famakafakana fampitomboana miasa. Ny rindrambaiko voalohany amin'ity fitaovana ity dia ny fonosana TopGO-Bioconductor, izay ahitana ny famakafakana fanehoan-kevitra samihafa, famakafakana fanatsarana GO ary fijerena ny vokatra.
Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA)
Ny WGCNA dia fomba fitrandrahana angon-drakitra ampiasaina betsaka amin'ny fitadiavana ireo maody miaraka amin'ny fanehoana fototarazo. Izy io dia azo ampiharina amin'ny angon-drakitra fanehoana isan-karazany ao anatin'izany ny angon-drakitra fanehoana ny fototarazo microarray sy NGS.
InterProScan
Ny fitaovana InterProScan dia manome famakafakana sy fanasokajiana ny filaharan'ny proteinina InterPro.
GO KEGG Enrichment
Ny fitaovana GO KEGG Enrichment dia natao hamokatra histograma GO enrichment, histogram enrichment KEGG ary lalan'ny fananan'ny KEGG mifototra amin'ny fitambaran'ny fototarazo nomena sy ny fanamarihana mifanaraka amin'izany.