Sarintany hafanana
Ny rakitra data matrix dia ampiasaina amin'ny sary sarintany hafanana, izay afaka manivana, manara-dalàna ary angona matrix cluster.Ampiasaina matetika izy io amin'ny famakafakana cluster ny haavon'ny fanehoana fototarazo eo anelanelan'ny santionany samihafa.
Gene Annotation
Ny fanamarihan'ny asan'ny fototarazo dia atao amin'ny alàlan'ny fanaovana sari-tany amin'ny rakitra FASTA amin'ny angon-drakitra isan-karazany.
Gene Annotation
Fitaovan'ny Fikarohana Fandrindrana eo an-toerana fototra
CDS_UTR_Prediction
Ity fitaovana ity dia natao haminavina ny faritra kaody (CDS) sy ny faritra tsy misy kaody (UTR) amin'ny filaharan'ny transcript nomena mifototra amin'ny fipoahana manohitra ny angon-drakitra proteinina fantatra sy ny faminaniana ORF.
Manhattan Plot
Ny plot Manhattan dia ahafahan'ny fampisehoana angon-drakitra miaraka amin'ny teboka angon-drakitra marobe.Matetika izy io no ampiasaina amin'ny fanadihadiana momba ny génomé-wide association (GWAS).
Circos
Ny sarin'ny CIRCOS dia mamela ny fampisehoana mivantana ny fizarana SNP, InDeL, SV, CNV amin'ny génome.
GO_Enrichment
TopGO dia fitaovana natao hanatsarana ny fiasa.Ny fonosana TopGO-Bioconductor dia misy famakafakana fanehoan-kevitra samihafa, famakafakana fanatsarana GO ary fijerena ny valiny.Izy io dia hamokatra lahatahiry misy vokatra antsoina hoe "Graph", izay misy valiny ho an'ny topGO_BP, topGO_CC ary topGO_MF.
WGCNA
Ny WGCNA dia fomba fitrandrahana angon-drakitra ampiasaina betsaka amin'ny fitadiavana ireo maody miaraka amin'ny fanehoana fototarazo.Izy io dia azo ampiharina amin'ny angona fitenenana isan-karazany ao anatin'izany ny angona microarray sy ny angona fanehoana fototarazo niainga avy amin'ny filaharan'ny taranaka manaraka.
InterProScan
Famakafakana sy fanasokajiana ny filaharana proteinina InterPro
GO_KEGG_enrichment
Ity fitaovana ity dia natao hamoronana histograma fanatsarana GO, histograma fanatsarana KEGG ary lalan'ny fanatsarana KEGG mifototra amin'ny fitambaran'ny fototarazo nomena sy ny fanamarihana mifanaraka amin'izany.