GENOMAS
Miscanthus lutarioriparius genomo chromosomų masto surinkimas ir biomasės pasėlių analizė
Nanoporų sekos nustatymas |Iliumina |Hi-C |RNR sekos nustatymas |Filogenija
Šiame tyrime „Biomarker Technologies“ teikė techninę pagalbą „Nanopore“ sekos nustatymui, de novo genomo surinkimui, Hi-C pagalbiniam surinkimui ir kt.
Abstraktus
Miskantas, šakniastiebinis daugiametis augalas, turi didelį bioenergijos gamybos potencialą dėl didelės biomasės ir atsparumo stresui.Pranešame apie chromosomų masto surinkimąMiscanthus lutarioripariusgenomą, derinant Oxford Nanopore sekos nustatymą ir Hi-C technologijas.2,07 Gb rinkinys apima 96,64% genomo, o N50 yra 1,71 Mb.Centromerų ir telomerų sekos surenkamos atitinkamai visoms 19 chromosomų ir 10 chromosomoms.Allotetraploidinė M. lutarioriparius kilmė patvirtinta naudojant centromerinius palydovinius pasikartojimus.Aiškiai parodyta tetraploidinė genomo struktūra ir keli chromosomų pertvarkymai, palyginti su sorgais.Tandemas pasikartoja genaiM. lutarioripariusyra funkcionaliai praturtinti ne tik atsaku į stresą, bet ir ląstelių sienelių biosinteze.Genų šeimos, susijusios su atsparumu ligoms, ląstelių sienelių biosinteze ir metalo jonų transportavimu, labai išsiplėtė ir vystosi.Šių šeimų išplėtimas gali būti svarbus genominis pagrindas, padedantis sustiprinti puikius bruožusM. lutarioriparius.
Pagrindinė genomo surinkimo statistika
Paveikslas.M. lutarioriparius genomo surinkimo apžvalga
Naujienos ir svarbiausi dalykai siekia pasidalyti naujausiais sėkmingais atvejais su „Biomarker Technologies“, užfiksuoti naujus mokslo laimėjimus ir svarbius tyrimo metu taikytus metodus.
Paskelbimo laikas: 2022-01-05