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バイオマス作物Miscanthus lutarioripariusゲノムの染色体スケールアセンブリと解析

ナノポアシーケンス |イルミナ |ハイシー |RNA シーケンス |系統発生

本研究では、Biomarker Technologies がナノポアシーケンシング、de novo ゲノムアセンブリ、Hi-C 支援アセンブリなどの技術支援を提供しました。

抽象的な

ススキ根茎性の多年草植物であり、その高いバイオマスとストレス耐性により、バイオエネルギー生産の大きな可能性を秘めています。私たちは、染色体スケールのアセンブリを報告します。ススキオックスフォード ナノポア シーケンスと Hi-C テクノロジーを組み合わせてゲノムを解析します。2.07 Gb アセンブリはゲノムの 96.64% をカバーし、コンティグ N50 は 1.71 Mb です。セントロメア配列とテロメア配列は、それぞれ 19 染色体すべてと 10 番染色体について組み立てられます。M. lutarioriparius の異質四倍体の起源は、セントロメア サテライト リピートを使用して確認されます。ソルガムと比較して、四倍体のゲノム構造といくつかの染色体再構成が明確に実証されています。タンデム重複遺伝子M.ルタリオリパリウスストレス応答だけでなく細胞壁生合成に関連する点でも機能が豊富です。耐病性、細胞壁生合成、金属イオン輸送に関連する遺伝子ファミリーは大幅に拡大、進化しています。これらの家族の拡大は、顕著な形質を強化するための重要なゲノム基盤である可能性があります。M.ルタリオリパリウス。

ゲノム構築に関する主要な統計

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形。M. ルタリオリパリウスのゲノムアセンブリの概要

ニュースとハイライト この研究は、最新の成功事例をバイオマーカー テクノロジーズと共有し、新たな科学的成果や研究中に適用された著名な技術を把握することを目的としています。


投稿時刻: 2022 年 1 月 5 日

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