BMKCloud Log in
条形banner-03

Nuus

GENOME

Nature_Communications_Logo

Chromosoom-skaal samestelling en ontleding van biomassa gewas Miscanthus lutarioriparius genoom

Nanopore-volgordebepaling |Illumina |Hi-C |RNA-volgordebepaling |Filogenie

In hierdie studie het Biomarker Technologies tegniese ondersteuning verskaf oor Nanopore-volgordebepaling, de novo genoomsamestelling, Hi-C bygestaan ​​samestelling, ens.

Abstrak

Miscanthus, 'n risoomagtige meerjarige plant, het groot potensiaal vir bio-energieproduksie vir sy hoë biomassa en stresverdraagsaamheid.Ons rapporteer 'n chromosoom-skaal samestelling vanMiscanthus lutarioripariusgenoom deur Oxford Nanopore-volgordebepaling en Hi-C-tegnologie te kombineer.Die 2.07-Gb-samestelling dek 96.64% van die genoom, met aaneenlopende N50 van 1.71 Mb.Die sentromeer- en telomeervolgordes word onderskeidelik vir al 19 chromosome en chromosoom 10 saamgestel.Allotetraploïede oorsprong van die M. lutarioriparius word bevestig met behulp van sentromeriese satellietherhalings.Die tetraploïede genoomstruktuur en verskeie chromosomale herrangskikkings relatief tot sorghum word duidelik gedemonstreer.Tandem duplikaat gene vanM. lutarioripariusis funksioneel verryk nie net in terme wat verband hou met stresreaksie nie, maar selwandbiosintese.Geenfamilies wat verband hou met siekteweerstand, selwandbiosintese en metaalioonvervoer word grootliks uitgebrei en ontwikkel.Die uitbreiding van hierdie families kan 'n belangrike genomiese basis wees vir die verbetering van merkwaardige eienskappe vanM. lutarioriparius.

Sleutelstatistieke van genoomsamestelling

nuus-1
nuus-2

Figuur.Oorsig van die M. lutarioriparius genoomsamestelling

Nuus en hoogtepunte poog om die nuutste suksesvolle gevalle met Biomarker Technologies te deel, nuwe wetenskaplike prestasies vas te lê sowel as prominente tegnieke wat tydens die studie toegepas is.


Postyd: Jan-05-2022

Stuur jou boodskap aan ons: