-
Fanadihadiana momba ny fikambanana Genome-wide
Ny fandalinana ny fikambanan'ny genome-wide (GWAS) dia mikendry ny hamantatra ireo karazana fototarazo (genotype) izay mifandray amin'ny toetra manokana (phenotype).Ny fandalinana GWAS dia manadihady ireo marika fototarazo mamakivaky ny génome iray manontolo amin'ny olona marobe ary maminavina ny fikambanan'ny genotype-phenotype amin'ny alàlan'ny famakafakana statistika amin'ny haavon'ny mponina.Nampiasaina be dia be izy io tamin'ny fikarohana momba ny aretin'olombelona sy ny fitrandrahana fototarazo miasa amin'ny toetra sarotra amin'ny biby na zavamaniry.
-
Fizarana RNA nokleary tokana
Ny fandrosoana amin'ny fakana sela tokana sy ny teknikan'ny fananganana tranomboky tsirairay miaraka amin'ny filaharana avo lenta dia ahafahan'ny fandalinana fanehoana ny fototarazo amin'ny cell-by-cell.Izy io dia manome famakafakana rafitra lalindalina kokoa sy feno momba ny isan'ny sela saro-takarina, izay misoroka ny fisaronana ny maha-samihafa azy amin'ny alàlan'ny fakana salan'isa ny sela rehetra.
Na izany aza, ny sela sasany dia tsy mety atao amin'ny fampiatoana sela tokana, noho izany dia ilaina ny fomba fanomanana santionany hafa - ny fitrandrahana nucleus avy amin'ny tavy, izany hoe ny nucleus dia alaina mivantana avy amin'ny sela na sela ary voaomana ho fampiatoana ny nucleus tokana ho an'ny tokana- filaharan'ny sela.
Ny BMK dia manome serivisy 10× Genomics ChromiumTM mifototra amin'ny sequence RNA sela tokana.Ity serivisy ity dia nampiasaina betsaka tamin'ny fandalinana momba ny fandalinana mifandraika amin'ny aretina, toy ny fanavahana ny sela immune, ny heterogeneity tumor, ny fivoaran'ny sela, sns.
Spatial transcriptome chip: 10 × Genomika
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Fandrindrana Genome manontolo ny zava-maniry/biby
Ny famerimberenan'ny genome manontolo, fantatra ihany koa amin'ny hoe WGS, dia mamela ny fanehoana ireo fiovana mahazatra sy tsy fahita firy amin'ny génome manontolo ao anatin'izany ny Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), ary Copy Number Variation (CNV). ).Ny SV dia mahaforona ampahany lehibe kokoa amin'ny fototra miovaova noho ny SNP ary misy fiantraikany lehibe kokoa amin'ny génome, izay misy fiantraikany lehibe amin'ny zavamananaina.Ny famerimberenan'ny famakiana lava dia ahafahana mamantatra tsara kokoa ny sombintsombiny lehibe sy ny fiovaovana sarotra satria ny famakiana lava dia manamora kokoa ny fiampitana krômôzôma amin'ny faritra sarotra toy ny famerenana tandem, faritra manankarena GC/AT, ary faritra hypervariable.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Manana anjara toerana lehibe amin'ny fizotry ny biolojika isan-karazany ny fandaminana ny sela, toy ny fidiran'ny hery fiarovana, ny fivoaran'ny embryon, sns.Miaraka amin'ny fivoaran'ny teknôlôjia, mila ianarana miaraka amin'ny fanapahan-kevitra ambony kokoa ny firafitry ny tavy faran'izay mazava sy ny fahasamihafan'ny firafitry ny molekiola spatial.Ny BMKGENE dia manome serivisy filaharana transcriptome spatial iray miato avy amin'ny santionany mankany amin'ny fahitana biolojika.
Ny teknolojian'ny transcriptomic spatial dia nanome hery ny fomba fijery vaovao amin'ny sehatry ny fikarohana isan-karazany amin'ny alàlan'ny famahana ny mombamomba ny fanehoana fototarazo miaraka amin'ny votoaty spatial amin'ny santionany heterogène.
Spatial transcriptome chip: BMKMANU S1000
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression dia teknôlôjia transcriptome transcriptome mahazatra mahazatra amin'ny fanasokajiana ny tavy mifototra amin'ny mRNA total.Soraty amin'ny sarintany ny transcriptome manontolo miaraka amin'ny toe-javatra morphologique mba hahitana fomba fijery vaovao momba ny fivoarana ara-dalàna, ny patolojia amin'ny aretina ary ny fikarohana fandikana klinika.Ny BMKGENE dia manome serivisy filaharana transcriptome spatial iray miato avy amin'ny santionany mankany amin'ny fahitana biolojika.
Ny teknolojian'ny transcriptomic spatial dia nanome hery ny fomba fijery vaovao amin'ny sehatry ny fikarohana isan-karazany amin'ny alàlan'ny famahana ny mombamomba ny fanehoana fototarazo miaraka amin'ny votoaty spatial amin'ny santionany heterogène..
Spatial transcriptome chip: 10x Genomics Visium
Sehatra:Illumina NovaSeq 6000
-
MRNA Sequencing-Nanopore feno
Ny sequencing RNA dia fitaovana tena sarobidy ho an'ny famakafakana transcriptome feno.Tsy isalasalana fa ny filaharan'ny famakiana fohy nentim-paharazana dia nahavita fivoarana lehibe maro teto.Na izany aza, matetika izy io dia misy fetrany amin'ny famantarana isoforma feno, ny quantification, ny fitongilanana PCR.
Ny filaharan'ny nanopore dia manavaka ny tenany amin'ny sehatra filaharan'ny hafa, satria ny nucleotides dia vakiana mivantana tsy misy ADN ary miteraka vakiana lava amin'ny kilobazy am-polony.Izany dia manome hery ny famakiana mivantana amin'ny alàlan'ny fandikana feno sy ny famahana ireo fanamby amin'ny fianarana ambaratonga isoform.
Platform：Nanopore PromethION
Tranomboky:cDNA-PCR
-
Fizarana mRNA feno -PacBio
De novofilaharan'ny transcriptome manontolo, fantatra ihany koa amin'ny hoeDe novoNy Iso-Seq dia mandray ny tombony amin'ny sequencer PacBio amin'ny halavan'ny famakiana, izay ahafahan'ny sequence ny molekiola cDNA feno tsy misy fiatoana.Misoroka tanteraka ny hadisoana ateraky ny dingan'ny fivorian'ny transcript izany ary manangana andiany unigene miaraka amin'ny famahana isoform-level.Ity seta unigene ity dia manome fampahalalana fototarazo mahery ho "genome reference" amin'ny ambaratonga transcriptome.Ho fanampin'izany, miaraka amin'ny angon-drakitra filaharana amin'ny taranaka manaraka, ity serivisy ity dia manome hery ny fandrefesana marina ny fitenenana isoforme.
Platform: PacBio Sequel IITranomboky: tranomboky lakolosy SMRT -
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
Ny filaharana mRNA dia ahafahan'ny mombamomba ny mRNA rehetra nadika avy amin'ny sela ao anatin'ny fepetra manokana.Izy io dia teknolojia mahery vaika hanehoana ny mombamomba ny fanehoana ny fototarazo, ny firafitry ny fototarazo ary ny mekanika molekiola amin'ny dingana biolojika sasany.Hatramin'izao, ny filaharana mRNA dia nampiasaina betsaka amin'ny fikarohana fototra, diagnostika klinika, fampivoarana zava-mahadomelina, sns.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
MRNA Sequencing-Illumina tsy mifototra amin'ny fanondro
Ny fizotry ny mRNA dia mampiasa teknika fandrindrana taranaka manaraka (NGS) mba hisambotra ny RNA (mRNA) iraka Eukaryote amin'ny vanim-potoana manokana izay miasa manokana.Nantsoina hoe 'Unigene' ny transcript lava indrindra natambatra ary nampiasaina ho filaharan'ny fanondroana ho an'ny famakafakana manaraka, izay fomba mahomby handinihana ny mekanika molekiola sy tambajotra mifehy ny karazana tsy misy fanondroana.
Taorian'ny fivorian'ny angon-drakitra transcriptome sy ny fanamarihan'ny unigene functional
(1) Ny famakafakana SSR, ny faminaniana CDS ary ny firafitry ny fototarazo dia hamboarina mialoha.
(2) Ny fampitomboana ny fitenenana unigene amin'ny santionany tsirairay dia hatao.
(3) Ny unigenes aseho amin'ny fomba samihafa eo amin'ny santionany (na vondrona) dia ho hita mifototra amin'ny fitenenana unigene
(4) Ny fivondronana, ny fanamarihan'ny asa ary ny famakafakana ny fanamafisam-peo amin'ny unigenes tsy mitovy dia hatao
-
Lava tsy misy coding sequencing-Illumina
Ny RNA tsy misy kaody lava (lncRNAs) dia karazana molekiolan'ny RNA manana halavany mihoatra ny 200 nt, izay mampiavaka azy amin'ny mety ho fanovàna tena ambany.Ny LncRNA, amin'ny maha-mpikambana fototra amin'ny RNA tsy misy kaody, dia hita indrindra ao amin'ny nucleus sy plasma.Ny fivoarana amin'ny teknôlôjian'ny filaharana sy ny bioinformatika dia ahafahana mamantatra ireo lncRNA vaovao maro ary mampifandray ireo manana fiasa biolojika.Ny porofo mitambatra dia milaza fa ny lncRNA dia tafiditra betsaka amin'ny regulation epigenetic, ny transcription sy ny post-transcription.
