Nouvelles

Miscanthus, une plante vivace rhizomateuse, présente un grand potentiel de production de bioénergie en raison de sa biomasse élevée et de sa tolérance au stress.Nous rapportons un assemblage à l'échelle chromosomique deMiscanthus lutarioripariusgénome en combinant le séquençage Oxford Nanopore et les technologies Hi-C.L'assemblage de 2,07 Go couvre 96,64 % du génome, avec un contig N50 de 1,71 Mo.Les séquences du centromère et du télomère sont assemblées respectivement pour les 19 chromosomes et le chromosome 10.L'origine allotétraploïde de M. lutarioriparius est confirmée à l'aide de répétitions satellites centromériques.La structure tétraploïde du génome et plusieurs réarrangements chromosomiques par rapport au sorgho sont clairement démontrés.Gènes en double duplication en tandem deM. lutarioripariussont enrichis fonctionnellement non seulement en termes liés à la réponse au stress, mais aussi à la biosynthèse de la paroi cellulaire.Les familles de gènes liées à la résistance aux maladies, à la biosynthèse de la paroi cellulaire et au transport des ions métalliques sont considérablement élargies et évoluées.L'expansion de ces familles peut constituer une base génomique importante pour l'amélioration de caractères remarquables deM. lutarioriparius.