BMKCloud Log in
条形 banner-03

Νέα

ΓΟΝΙΔΩΜΑ

Nature_Communications_Logo

Συναρμολόγηση σε κλίμακα χρωμοσώματος και ανάλυση της καλλιέργειας βιομάζας γονιδίωμα Miscanthus lutarioriparius

Αλληλουχία νανοπόρων |Illumina |Hi-C |Αλληλουχία RNA |Φιλογένεια

Σε αυτή τη μελέτη, η Biomarker Technologies παρείχε τεχνική υποστήριξη στον προσδιορισμό της αλληλουχίας Nanopore, στη de novo συγκρότηση γονιδιώματος, στη συναρμολόγηση με τη βοήθεια Hi-C κ.λπ.

Αφηρημένη

Μίσκανθος, ένα ριζωματώδες πολυετές φυτό, έχει μεγάλες δυνατότητες παραγωγής βιοενέργειας για την υψηλή βιομάζα και την αντοχή του στο στρες.Αναφέρουμε ένα συγκρότημα σε κλίμακα χρωμοσώματος τουMiscanthus lutarioripariusγονιδίωμα συνδυάζοντας την αλληλουχία Oxford Nanopore και τις τεχνολογίες Hi-C.Το συγκρότημα 2,07-Gb καλύπτει το 96,64% του γονιδιώματος, με contig N50 1,71 Mb.Οι αλληλουχίες κεντρομερούς και τελομερούς συναρμολογούνται και για τα 19 χρωμοσώματα και το χρωμόσωμα 10, αντίστοιχα.Η αλλοτετραπλοειδής προέλευση του M. lutarioriparius επιβεβαιώνεται χρησιμοποιώντας κεντρομερείς δορυφορικές επαναλήψεις.Η τετραπλοειδής δομή του γονιδιώματος και αρκετές χρωμοσωμικές αναδιατάξεις σε σχέση με το σόργο αποδεικνύονται ξεκάθαρα.Διαδοχικά διπλά γονίδια τουΜ. lutarioripariusείναι λειτουργικά εμπλουτισμένα όχι μόνο όσον αφορά την απόκριση στο στρες, αλλά και τη βιοσύνθεση του κυτταρικού τοιχώματος.Οι οικογένειες γονιδίων που σχετίζονται με την αντοχή σε ασθένειες, τη βιοσύνθεση του κυτταρικού τοιχώματος και τη μεταφορά μεταλλικών ιόντων διευρύνονται και εξελίσσονται σημαντικά.Η επέκταση αυτών των οικογενειών μπορεί να είναι μια σημαντική γονιδιωματική βάση για την ενίσχυση αξιοσημείωτων χαρακτηριστικών τουΜ. lutarioriparius.

Βασικά στατιστικά στοιχεία της συναρμολόγησης του γονιδιώματος

ειδήσεις-1
ειδήσεις-2

Εικόνα.Επισκόπηση του συγκροτήματος γονιδιώματος M. lutarioriparius

Νέα και Στιγμιότυπα στοχεύει στο να μοιράζεται τις πιο πρόσφατες επιτυχημένες περιπτώσεις με τη Biomarker Technologies, αποτυπώνοντας νέα επιστημονικά επιτεύγματα καθώς και εξέχουσες τεχνικές που εφαρμόστηκαν κατά τη διάρκεια της μελέτης.


Ώρα δημοσίευσης: Ιαν-05-2022

Στείλτε μας το μήνυμά σας: