GENOME
Kwomozòm-echèl asanble ak analiz de rekòt byomass Miscanthus lutarioriparius genomic
Nanopore sekans |Ilumina |Hi-C |RNA-sekans |Filojeni
Nan etid sa a, Biomarker Technologies te bay sipò teknik sou sekans Nanopore, asanble genomic de novo, asanble asiste Hi-C, elatriye.
Résumé
Miscanthus, yon plant perennial rhizomatous, gen gwo potansyèl pou pwodiksyon byoenèji pou segondè byomass li yo ak tolerans estrès.Nou rapòte yon asanble kwomozòm-echèl nanMiscanthus lutarioripariusgenòm nan konbine sekans Oxford Nanopore ak teknoloji Hi-C.Asanble a 2.07-Gb kouvri 96.64% nan genomic a, ak kontig N50 nan 1.71 Mb.Sekans santòmè ak telomè yo rasanble pou tout 19 kwomozòm ak kwomozòm 10, respektivman.Orijin allotetraploid M. lutarioriparius konfime lè l sèvi avèk repetisyon satelit santomère.Estrikti genòm tetraploid la ak plizyè aranjman kwomozòm parapò ak sorgo yo montre klèman.Tandem kopi jèn nanM. lutarioripariusyo fonksyonèl rich pa sèlman an tèm ki gen rapò ak repons estrès, men selil mi byosentèz.Fanmi jèn ki gen rapò ak rezistans maladi, biosentèz mi selil ak transpò iyon metal yo anpil elaji ak evolye.Ekspansyon nan fanmi sa yo ka yon baz enpòtan jenomik pou amelyorasyon nan karakteristik remakab nanM. lutarioriparius.
Estatistik kle nan asanble genomic
Figi.Apèsi sou asanble genomic M. lutarioriparius
Nouvèl ak Pwen esansyèl vize pou pataje dènye ka siksè yo ak Biomarker Technologies, kaptire nouvo reyalizasyon syantifik ak teknik enpòtan aplike pandan etid la.
Lè poste: Jan-05-2022