BMKCloud Log in
条形banner-03

Новости

ГЕНОМ

Nature_Communications_Logo

Хромосомная сборка и анализ генома биомассы урожая Miscanthus lutarioriparius

Нанопоровое секвенирование |Иллюмина |Привет-С |РНК-секвенирование |Филогения

В этом исследовании Biomarker Technologies предоставила техническую поддержку по секвенированию нанопор, сборке генома de novo, сборке с помощью Hi-C и т. д.

Абстрактный

Мискантус, корневищное многолетнее растение, имеет большой потенциал для производства биоэнергии благодаря своей высокой биомассе и устойчивости к стрессу.Мы сообщаем о сборке хромосомного масштабаМискантус лутарорипариусгенома путем объединения секвенирования Oxford Nanopore и технологий Hi-C.Сборка размером 2,07 Гб покрывает 96,64% генома, контиг N50 составляет 1,71 Мб.Последовательности центромеры и теломер собраны для всех 19 хромосом и хромосомы 10 соответственно.Аллотетраплоидное происхождение M. lutarioriparius подтверждено с помощью центромерных сателлитных повторов.Отчетливо продемонстрирована тетраплоидная структура генома и несколько хромосомных перестроек по сравнению с сорго.Тандемные дубликаты геновМ. lutarioripariusфункционально обогащены не только с точки зрения реакции на стресс, но и биосинтеза клеточной стенки.Семейства генов, связанные с устойчивостью к болезням, биосинтезом клеточной стенки и транспортом ионов металлов, значительно расширились и эволюционировали.Расширение этих семейств может стать важной геномной основой для улучшения замечательных признаковМ. лутарорипариус.

Основная статистика сборки генома

новости-1
новости-2

Фигура.Обзор сборки генома M. lutarioriparius

Новости и основные моменты цель – поделиться последними успешными случаями с Biomarker Technologies, фиксируя новые научные достижения, а также выдающиеся методы, примененные в ходе исследования.


Время публикации: 05 января 2022 г.

Отправьте нам сообщение: