GENOOM
Miscanthus lutarioripariuse genoomi kromosoomide kokkupanek ja analüüs
Nanopooride järjestamine |Illumina |Hi-C |RNA sekveneerimine |Fülogeneesia
Selles uuringus pakkus Biomarker Technologies tehnilist tuge Nanopore'i sekveneerimise, de novo genoomi kokkupaneku, Hi-C abiga kokkupaneku jms osas.
Abstraktne
Miscanthusrisomatoosne mitmeaastane taim omab suurt bioenergia tootmise potentsiaali oma suure biomassi ja stressitaluvuse tõttu.Teatame kromosoomi mastaabis koosnemisestMiscanthus lutarioripariusgenoom, kombineerides Oxford Nanopore sekveneerimise ja Hi-C tehnoloogiad.2,07-Gb koost katab 96,64% genoomist ja N50 on 1,71 Mb.Tsentromeeri ja telomeeri järjestused on kokku pandud vastavalt kõigi 19 kromosoomi ja 10 kromosoomi jaoks.M. lutarioripariuse allotetraploidset päritolu kinnitatakse tsentromeerse satelliidi korduste abil.Tetraploidse genoomi struktuur ja mitmed kromosomaalsed ümberkorraldused sorgo suhtes on selgelt näidatud.Tandem dubleerivad geenidM. lutarioripariuson funktsionaalselt rikastatud mitte ainult stressireaktsiooni, vaid ka rakuseina biosünteesi osas.Haigusresistentsuse, rakuseina biosünteesi ja metalliioonide transpordiga seotud geeniperekonnad on oluliselt laienenud ja arenenud.Nende perekondade laienemine võib olla oluline genoomne alus nende märkimisväärsete tunnuste tugevdamiseksM. lutarioriparius.
Genoomi kokkupaneku põhistatistika
Joonis.M. lutarioripariuse genoomikoostu ülevaade
Uudised ja tipphetked eesmärk on jagada uusimaid edukaid juhtumeid ettevõttega Biomarker Technologies, jäädvustada nii uudseid teadussaavutusi kui ka uuringu käigus kasutatud silmapaistvaid tehnikaid.
Postitusaeg: jaanuar 05-2022