ГЕНОМ
Хромосома масштабында чогултуу жана биомассалык түшүмдүн анализи Miscanthus lutarioriparius геному
Nanopore sequencing |Illumina |Hi-C |РНК-секвенирлөө |Филогенез
Бул изилдөөдө, Biomarker Technologies Nanopore секвенирлөө боюнча техникалык колдоо көрсөттү, де novo геном жыйындысы, Hi-C жардам жыйындысы, ж.б.
Реферат
Miscanthus, ризоматоздуу көп жылдык өсүмдүк, анын жогорку биомассасы жана стресске туруктуулугу үчүн биоэнергия өндүрүү үчүн чоң потенциалга ээ.Биз хромосомалардын масштабдуу чогулушун кабарлайбызMiscanthus lutarioripariusOxford Nanopore секвенирлөө жана Hi-C технологияларын айкалыштыруу аркылуу геном.2,07 Гб жыйыны геномдун 96,64% камтыйт, контиг N50 1,71 Мб.Центромер жана теломер тизмеги бардык 19 хромосома жана 10-хромосома үчүн чогултулган.M. lutarioripariusтун аллотетраплоиддик келип чыгышы центромердик спутниктик кайталоо аркылуу тастыкталган.Тетраплоиддик геномдун түзүлүшү жана соргого салыштырмалуу бир нече хромосомалык кайра түзүлүшү так көрсөтүлгөн.Тандемдик дубликат гендерM. lutarioripariusСтресске жооп берүү жагынан гана эмес, клетка дубалынын биосинтези жагынан да функционалдык байытылган.Ооруга туруктуулук, клетка дубалынын биосинтези жана металл ионунун ташуу менен байланышкан ген үй-бүлөлөрү абдан кеңейип, эволюцияланган.Бул үй-бүлөлөрдүн кеңейиши геномикалык маанилүү негиз болушу мүмкүнM. lutarioriparius.
Геном жыйындысынын негизги статистикасы
Сүрөт.M. lutarioriparius геномунун жыйындысы
Жаңылыктар жана кызыктуу окуялар акыркы ийгиликтүү учурларды Biomarker Technologies менен бөлүшүүгө, жаңы илимий жетишкендиктерге, ошондой эле изилдөө учурунда колдонулган көрүнүктүү ыкмаларга ээ болууга багытталган.
Посттун убактысы: 05-январь 2022-жыл