ØТәжірибесі жоғары: BMK-да әртүрлі үлгі түрлерін, соның ішінде жасуша мәдениетін, ұлпаны, дене сұйықтығын және т.б. қамтитын 200 000-нан астам үлгі өңделді және әртүрлі зерттеу аймағын қамтитын 7 000-нан астам mRNA-Seq жобалары жабылды.
ØҚатаң сапаны бақылау жүйесі: сынамаларды дайындау, кітапхананы дайындау, реттілік және биоинформатиканы қоса алғанда, барлық қадамдар арқылы негізгі сапаны бақылау нүктелері жоғары сапалы нәтижелерге қол жеткізу үшін мұқият бақылауда болады.
ØӘртүрлі зерттеу мақсаттарын орындау үшін функция аннотациялары мен байыту зерттеулері үшін қол жетімді бірнеше дерекқор.
ØСатудан кейінгі қызметтер: Жоба аяқталғаннан кейін 3 айға жарамды сатудан кейінгі қызметтер, соның ішінде жобаларды бақылау, ақаулықтарды жою, нәтижелерге қатысты сұрақ-жауап және т.б.
Кітапхана | Тізбектеу стратегиясы | Деректер ұсынылады | Сапа бақылауы |
Poly A байытылған | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
Нуклеотидтер:
Тазалық | Тұтастық | Сома |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Гельде ақуыз немесе ДНҚ ластануы шектеулі немесе жоқ. | Өсімдіктер үшін: RIN≥6,5;Жануарлар үшін: RIN≥7;28S/18S≥1,0;базалық биіктігі шектеулі немесе жоқ | Конц.≥30 нг/мкл;Көлемі ≥ 10 мкл;Барлығы ≥ 1,5 мкг |
Тін: Салмағы (құрғақ):≥1 г
*Мөлшері 5 мг-ден аз тіндер үшін біз мұздатылған (сұйық азотта) тін үлгісін жіберуді ұсынамыз.
Жасуша суспензиясы:Ұяшықтар саны = 3×106- 1×107
*Мұздатылған жасуша лизатын жөнелтуді ұсынамыз.Ұяшықтар саны 5×105-тен аз болса, сұйық азотта мұздатылған жарқыл ұсынылады, бұл микро экстракция үшін қолайлы.
Қан үлгілері:Көлемі≥1 мл
Микроорганизм:Массасы ≥ 1 г
Контейнер: 2 мл центрифуга түтігі (қаңылтыр фольга ұсынылмайды)
Үлгі таңбалау: Топ+қайталау, мысалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
жөнелту:
Биоинформатика
Эукариоттық мРНҚ секвенирлеу талдауының жұмыс процесі
Биоинформатика
ØШикізат деректер сапасын бақылау
ØАнықтамалық геномды теңестіру
ØТранскрипт құрылымын талдау
ØӨрнектерді сандық анықтау
ØДифференциалды өрнектерді талдау
ØФункцияға аннотация және байыту
1.мРНҚ деректерінің қанықтылығы қисығы
2.Дифференциалды өрнек талдауы-Вулкан сюжеті
3.DEG бойынша KEGG аннотациясы
4.DEG бойынша GO классификациясы