Эукариоттық мРНҚ секвенирлеуі-NGS
Ерекше өзгешеліктері
● Тізбекке тән секвенирлеу деректерін алуға мүмкіндік беретін қосымша бағыттаушы мРНҚ кітапханасын дайындау
● Әртүрлі бизнес-талдау біздің клиенттеріміздің барлық қажеттіліктерін қанағаттандырады
Артықшылықтары
●Кең ауқымды сараптамаБіз жасуша дақылдары, тіндер және дене сұйықтықтары сияқты әртүрлі үлгі түрлерін қамтитын 600 000-нан астам үлгіні өңдедік. Біз әрбір жобаға мол тәжірибе ұсынамыз.
●Қатаң сапаны бақылауБіз үлгі дайындаудан бастап кітапхана дайындауға, секвенирлеуге және биоинформатикаға дейінгі барлық кезеңдерде негізгі бақылау нүктелерін енгіземіз. Біздің мұқият мониторингіміз үнемі жоғары сапалы нәтижелердің берілуін қамтамасыз етеді.
●Кешенді аннотацияБіз дифференциалды экспрессияланған гендерді (ДЭГ) функционалды түрде аннотациялау және тиісті байыту талдауларын жүргізу үшін бірнеше дерекқорды пайдаланамыз. Бұл кешенді тәсіл транскриптом реакциясының негізінде жатқан жасушалық және молекулалық процестерге түсінік береді, бұл сіздің эксперимент деректеріңіз туралы барлық ақпаратты алуыңызды қамтамасыз етеді.
●Сатудан кейінгі қолдауБіз қатысудың қаншалықты маңызды екенін түсінеміз, сондықтан біздің міндеттемеміз жобаны аяқтаудан тысқары, сатудан кейінгі 3 айлық қызмет көрсету мерзімін қамтиды. Осы уақыт ішінде біз жобаны бақылау, ақаулықтарды жою бойынша көмек және нәтижелерге қатысты кез келген сұрақтарға жауап беру үшін сұрақ-жауап сессияларын ұсынамыз.
Үлгі талаптары және жеткізу
| Кітапхана | Реттік стратегия | Ұсынылатын деректер | Сапаны бақылау |
| Поли А байытылған | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 ГБ | Q30≥85% |
Үлгі талаптары:
Нуклеотидтер:
Ең төменгі үлгі талаптары:
| Конц. (нг/мкл) | Мөлшері (мкг) | Тазалық | Тұтастық | |
| Стандартты кітапхана | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Гельде ақуыз немесе ДНҚ ластануы шектеулі немесе мүлдем жоқ. | Өсімдіктер үшін: RIN≥4.0; Жануарлар үшін: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; базалық биіктік шектеулі немесе мүлдем жоқ |
| Бағыттау кітапханасы | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Гельде ақуыз немесе ДНҚ ластануы шектеулі немесе мүлдем жоқ. | Өсімдіктер үшін: RIN≥4.0; Жануарлар үшін: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; базалық биіктік шектеулі немесе мүлдем жоқ |
| Өсімдіктер | Жануар | Буынаяқтылар | Тұтас қан | Жасушалар |
| Тамыр, сабақ немесе гүлшоғыр: 450 мг Жапырақ немесе тұқым: 300 мг Жеміс: 1,2 г | Жүрек немесе ішек: 300 мг Ішкі мүшелер немесе ми: 240 мг Бұлшықет: 450 мг Сүйектер, шаш немесе тері: 1 г | Жәндіктер: 6 г Шаян тәрізділер: 300 мг | 1 түтік | 106 ұяшық |
Ұсынылған үлгі жеткізу
Контейнер: 2 мл центрифуга түтігі (қалайы фольга ұсынылмайды)
Үлгі таңбалау: Топ+көшірме, мысалы, A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Жеткізу:
1. Құрғақ мұз: Үлгілерді пакеттерге салып, құрғақ мұзға көму керек.
2. РНҚ үстел түтікшелері: РНҚ үлгілерін РНҚ тұрақтандыру түтігінде (мысалы, RNAstable®) кептіріп, бөлме температурасында жеткізуге болады.
Үлгі талаптары және жеткізу
Тәжірибелік дизайн
Үлгіні жеткізу
РНҚ экстракциясы
Кітапхана құрылысы
Реттік реттеу
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
Биоинформатика
Қолжетімді анықтамалық геномы бар үлгілер үшін BI талдауы келесідей:
ØШикі деректердің сапасын бақылау
ØАнықтамалық геномды туралау
ØТранскрипт құрылымын талдау
ØӨрнекті сандық бағалау
ØДифференциалды экспрессияны талдау
ØФункцияны аннотациялау және байыту
Анықтамалық геномы жоқ үлгілер үшін мына опция қолжетімді:
• Шикі деректердің сапасын бақылау
•Құрылымды оңтайландырумен құрастыру
•Дифференциалды экспрессияны талдау
•Функцияны аннотациялау және байыту
Анықтамалық геномды туралау
Деректердің қанығуы
Биологиялық қайталанулардың үлгі корреляциясы және бағалауы
Дифференциалды экспрессияланған гендер (ДЭГ)
DEG функционалдық аннотациясы
ДЭГ-тердің функционалдық байытуы
BMKGene компаниясының эукариоттық NGS мРНҚ секвенирлеу қызметтерінің жетістіктерін басылымдардың жинақталған жиынтығы арқылы зерттеңіз.
Хуан, Л. және т.б. (2023) «Триклозан мен триклокарбан иістерді тануды шектеу, иіс сигналдарының берілуін бұзу және иіс ақпаратын өңдеуді бұзу арқылы алтын балықтардың иіс сезу қабілетін әлсіретеді»,Суды зерттеу, 233, 119736 бет. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ және т.б. (2023) «Aspergillus fumigatus саңырауқұлақтарды қамтитын фагосомаларды ыдырамайтын жолға бағыттау үшін адамның p11 генін басып алады»,Жасуша иесі және микроб, 31(3), 373-388.e10 беттер. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Джин, К. және т.б. (2022) 'Ма бамбуктың (Dendrocalamus latiflorus Munro) өскінінің дамуына қатысатын TCP транскрипция факторлары',Өсімдіктанудағы шекаралар, 13, 884443-бет. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. және т.б. (2022) «Chrysanthemum lavandulifolium геномы және әртүрлі капитулум түрлерінің негізінде жатқан молекулалық механизм»,Бау-бақша шаруашылығын зерттеу, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Чжан, Юцзе және т.б. (2023) «Синергетикалық ROS күшейтуі және аутофагияны блоктау арқылы тоқ ішек қатерлі ісігін емдеудегі сонодинамикалық терапияны күшейтуге арналған каскадты нанореактор»,Нано бүгін, 49, б. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
