条形banner-03

Өнімдер

Адамның толық экзома реттілігі

Адамның бүкіл экзомасын секвенирлеу (hWES) ауру тудыратын мутацияларды анықтау үшін үнемді және қуатты секвенирлеу әдісі ретінде кеңінен танылды. Бүкіл геномның шамамен 1,7% құрағанына қарамастан, экзондар жалпы ақуыз функцияларының профилін тікелей көрсету арқылы шешуші рөл атқарады. Атап айтқанда, адам геномында ауруларға байланысты мутациялардың 85% -дан астамы ақуызды кодтау аймақтарында көрінеді. BMKGENE әртүрлі зерттеу мақсаттарына жету үшін қол жетімді екі түрлі экзонды түсіру стратегиясы бар адамның толық және икемді экзомасын секвенирлеу қызметін ұсынады.


Қызмет мәліметтері

Демо нәтижелері

Қызмет мүмкіндіктері

● Зондтармен мақсатты байытуға негізделген екі экзома тақтасы қолжетімді: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) және xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Illumina NovaSeq жүйесінде секвенирлеу.

● Ауруларды немесе ісіктерді талдауға бағытталған биоинформатикалық құбыр.

Қызметтің артықшылықтары

Протеинді кодтау аймағына бағытталған: Протеинді кодтау аймақтарын басып алу және секвенирлеу арқылы hWES ақуыз құрылымына қатысты нұсқаларды ашу үшін пайдаланылады.

Тиімді шығындар:hWES адам геномының 1% адам ауруымен байланысты мутациялардың шамамен 85% береді.

Жоғары дәлдік: Жоғары реттілік тереңдігімен hWES жалпы нұсқаларды да, жиілігі 1%-дан төмен сирек нұсқаларды да анықтауды жеңілдетеді.

Қатаң сапаны бақылау: Біз үлгіні және кітапхананы дайындаудан бастап реттілік пен биоинформатикаға дейінгі барлық кезеңдерде бес негізгі бақылау нүктесін енгіземіз. Бұл мұқият бақылау тұрақты жоғары сапалы нәтижелерді жеткізуді қамтамасыз етеді.

Кешенді биоинформатика талдауы: біздің құбырымыз анықтамалық геномның вариацияларын анықтаумен шектелмейді, өйткені ол аурулардың генетикалық аспектілеріне немесе ісіктерді талдауға қатысты зерттеу сұрақтарын шешуге арналған кеңейтілген талдауды қамтиды.

Сатудан кейінгі қолдау:Біздің міндеттеме сатылымнан кейінгі 3 айлық қызмет көрсету мерзімімен жобаны аяқтағаннан кейін де кеңейеді. Осы уақыт ішінде біз нәтижелерге қатысты кез келген сұрауларды шешу үшін жобаны бақылауды, ақаулықтарды жою бойынша көмекті және сұрақ-жауап сессияларын ұсынамыз.

Үлгі Техникалық сипаттамалар

Экзонды түсіру стратегиясы

Тізбектеу стратегиясы

Ұсынылатын деректер шығысы

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

немесе xGen Exome гибридизация тақтасы v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5 -10 Гб

Мендельдік бұзылулар/сирек аурулар үшін: > 50x

Ісік үлгілері үшін: ≥ 100x

Үлгіге қойылатын талаптар

Үлгі түрі

 

 Сома(Qubit®)

 

Шоғырлану 

Көлемі

 

 

 Тазалық(NanoDrop™)

 

Геномдық ДНҚ

 

≥ 50 нг
≥ 6 нг/мкл
≥ 15 мкл
 
OD260/280=1,8-2,0
 
деградация, ластану жоқ

 

Биоинформатика

WES_BI жұмыс ағыны_Disease-01

hWES-ауру үлгілерінің биоинформатикалық талдауы мыналарды қамтиды:

● Деректерді реттілік QC

● Анықтамалық геномды туралау

● SNP және InDels идентификациясы

● SNP және InDels функционалдық аннотациялары

WES_BI жұмыс ағыны_Tumor-01

Ісік үлгілерінің биоинформатикалық талдауы мыналарды қамтиды:

● Деректерді реттілік QC

● Анықтамалық геномды туралау

● SNP, InDels және соматикалық вариацияларды анықтау

● Жыныс жолдарының нұсқаларын анықтау

● Мутация белгілерін талдау

● Функцияны күшейтетін мутациялар негізінде жетек гендерін анықтау

● Дәріге сезімталдық деңгейіндегі мутация аннотациясы

● Гетерогендік талдау – тазалық пен плоидтылықты есептеу

Қызметтің жұмыс ағыны

үлгіні жеткізу

Үлгіні жеткізу

Пилоттық эксперимент

ДНҚ экстракциясы

Кітапханаға дайындық

Кітапхана құрылысы

Тізбектеу

Тізбектеу

Деректерді талдау

Деректерді талдау

数据上传-01

Деректерді жеткізу

Сатудан кейінгі қызметтер

Сатудан кейінгі қызметтер


  • Алдыңғы:
  • Келесі:

  • Деректер QC – Exome түсіру статистикасы

     

    wps_doc_22

     

    Вариантты сәйкестендіру – InDels

    图片36

    Жетілдірілген талдау: зиянды SNP/InDels анықтау және тарату – Circos сюжеті

     

    图片37

    Ісіктерді талдау: соматикалық мутацияларды анықтау және тарату – Циркос сюжеті

     

    图片38

     

    Ісіктерді талдау: клондық тектер

     

    图片39

     

    дәйексөз алыңыз

    Хабарламаңызды осы жерге жазып, бізге жіберіңіз

    Хабарламаңызды бізге жіберіңіз: