Eukaryotich MRNA талдауы (Анықтама негізіндегі және De Novo нұсқалары)
Бұл құбыр NGS RNA-SEQ деректерін кіріс ретінде пайдаланады және бірнеше төменгі ағындардан нәтиже береді, бірақ олармен шектелмейді, бірақ олармен шектелмейді: Деректердің сапасын бағалау,de novoТранскрипция сайтының аннотациясы, ауыспалы бөлшектеу, дифференциалды өрнектерді талдау, функцияны аннотация және байыту талдауы.
Coding Coding RNA талдауы
Ұзын кодталмау RNAS (LNCRNA) - бұл 200 NT-дан ұзындығымен кодталмаған транскрипттер болып табылады және хроматинді ұйымдастыру мен реттеудегі рөлдерді ойнайды. Жоғары өткізу қабілеттілігі мен биоинформация біздің Lncrna тізбегін түсінуімізге және ақпарат құралдарын маңызды реттеу функцияларымен таныстыру үшін ақпарат беруге мүмкіндік берді. Бұл құбыр ЛНККНА-ны Эукариотр МРНҚ талдау құбырында көрсетілген талдауларға қосымша ұсынады.
16S / 18S / оның ампликонның реттілігі
Микробтық әртүрлілікті талдау құбырының ампликоны микробтық әртүрлілік жобаларын талдаудағы жылдар негізінде жасалды. Құбырдың құрамында стандартталған негізгі талдау бар, ол қазіргі микробты зерттеулер мен жеке талдаудың негізгі талдау мазмұнын қамтиды. Талдау есебі әр түрлі жеке талдауды орындау мүмкіндігі бар, талдау есебі. Сонымен қатар, үлгілер мен топтарды қосымша теңшеу және басқару үшін шыбында өзгертуге болады.
Мылтық Метагеномикасын талдау
Мылтықты метағанда метагеномдық талдау құбыры NGS деректерін қоршаған орта үлгілерінен алынған аралас геномдық материалдардан пайдаланады. Талқыланған талдаулар түрлердің әртүрлілігі мен көптігі, халықтың құрылымы, филогенетикалық байланыс, функционалды қарым-қатынас, функционалды гендер және қоршаған орта факторлары туралы егжей-тегжейлі ақпарат береді.
NGS-WGS Variant талдауы
NGS-WGS Variant Analynation - бұл деректердің сапасын бақылауды, дәйектілікті туралауды, аннотацияны және гендік мутацияны жүзеге асыратын интегралды анықтау құбыры. Құбыр газеті SNP және Indel анықтаудың ең жақсы тәжірибелерін ұстанады және Manta-ны құрылымдық нұсқаға шақырады.
Genome Кең ассоциация бойынша зерттеу (GWAS)
GWAS құбыры - бұл бұрын жасалған VCF файлдарын және жеке тұлғалардың когортына сәйкес фенотиптік мәліметтерді алатын төменгі ағындық талдау. Белгілі бір статистикалық әдістемелерді қолдана отырып, ГВА-ның геномдық кең нуклеотидтің өзгеруін ашуға бағытталған, фенотиптік айырмашылықтармен байланысты. Ол өсімдіктер мен жануарлардағы күрделі адамдармен байланысты функционалды гендерді және өсімдіктермен байланысты функционалды гендерді зерттеуде шешуші рөл атқарады.
Жаппай сегрегацияны талдау (BSA)
BSA талдауы жеке тұлғаларды бөліп алуды қамтиды, олар бөлетін популяциядан экстремалды қасиеттері бар адамдарды бөлуді қамтиды. Бассейндік үлгілер арасындағы дифференциалды локомиканы салыстыра отырып, бұл тәсіл мақсатты гендермен байланысты тығыз байланысты молекулалық маркерлерді тез анықтайды. Өсімдіктер мен жануарлардың генетикалық картографиясында кеңінен қолданылады, бұл маркерге көмекші селекцияның маңызды құралы болып табылады.
Эволюциялық генетиканы талдау
Эволюциялық генетикалық талдау жұмыс ағыны Б.К.Кгеннің генетикалық эволюция жобаларында мол тәжірибеге ие және филогенетикалық ағаштың құрылысына, байланыстырудың диминалды талдауын, генетикалық әртүрлілікті бағалауды, селективті сыпыруды, туыстық талдауды, негізгі компоненттерді талдау және халықтың құрылымын сипаттайды.
