-
Метагеномикалық реттілік -NGS
Метагеном организмдердің аралас қауымдастығының жалпы генетикалық материалдарының жиынтығын білдіреді, мысалы, қоршаған орта метагеномы, адам метагеномы және т.б. Онда өсірілетін және өсірілмейтін микроорганизмдердің геномдары бар.Метагеномдық секвенирлеу – түрлердің әртүрлілігі мен көптігі, популяция құрылымы, филогенетикалық байланысы, функционалды гендер және қоршаған орта факторларымен корреляциялық желісі туралы толық ақпарат беретін қоршаған орта үлгілерінен алынған аралас геномдық материалдарды талдау үшін қолданылатын молекулалық құрал.
Платформа:Illumina NovaSeq платформасы
-
Метагеномикалық реттілік-нанопора
Метагеномика – қоршаған орта үлгілерінен алынған аралас геномдық материалдарды талдау үшін қолданылатын молекулалық құрал, ол түрлердің әртүрлілігі мен көптігі, популяция құрылымы, филогенетикалық қарым-қатынас, функционалды гендер және қоршаған орта факторларымен корреляциялық желі және т.б. туралы толық ақпарат береді. Нанопораларды секвенирлеу платформалары жақында енгізілген. метагеномдық зерттеулерге.Оның оқу ұзақтығы бойынша тамаша өнімділігі төмен ағынды метагеномдық талдауды, әсіресе метагеномды құрастыруды едәуір жақсартты.Оқу ұзақтығының артықшылықтарын пайдалана отырып, нанопора негізіндегі метагеномикалық зерттеу атыс қаруының метагеномикасымен салыстырғанда үздіксіз жинақтауға қол жеткізе алады.Нанопора негізіндегі метагеномика микробиомалардан толық және жабық бактериялық геномдарды сәтті жасағаны жарияланды (Moss, EL, т.б.,Табиғат биотехнологиясы, 2020)
Платформа:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S және 18S рРНҚ-дағы жоғары сақталған және гипер-айнымалы аймақтарды қамтитын суббірлік прокариоттық және эукариоттық организмдерді сәйкестендіру үшін тамаша молекулалық саусақ ізі болып табылады.Секвенирлеудің артықшылығын пайдалана отырып, бұл ампликондар сақталған бөліктерге негізделуі мүмкін және гипер-айнымалы аймақтар микробтардың әртүрлілігін талдауды, таксономияны, филогенезді және т.б. қамтитын зерттеулерге ықпал ететін микробтық идентификация үшін толық сипатталуы мүмкін. Бір молекулалы нақты уақыт режимі (SMRT) ) PacBio платформасының реттілігі толық ұзындықтағы ампликондарды (шамамен 1,5 Кб) қамтуы мүмкін жоғары дәлдіктегі ұзақ оқуларды алуға мүмкіндік береді.Генетикалық өрісті кеңейту бактериялар немесе саңырауқұлақтар қауымдастығындағы түрлердің аннотациясының ажыратымдылығын айтарлықтай жақсартты.
Платформа:PacBio жалғасы II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS ампликонды секвенирлеу микробтар қауымдастығындағы филогенезді, таксономияны және түрлердің көптігін анықтауға бағытталған, оларда жоғары ауыспалы және гипервариативтік бөліктерді қамтитын шаруашылық генетикалық маркерлерінің ПТР өнімдерін зерттеу арқылы.Woeses және басқалары (1977) жасаған осы тамаша молекулалық саусақ ізін енгізу микробиомаларды оқшаулаусыз профильдеуге мүмкіндік береді.16S (бактериялар), 18S (саңырауқұлақтар) және ішкі транскрипцияланған аралық (ITS, саңырауқұлақтар) секвенциясы мол түрлерді де, сирек кездесетін және анықталмаған түрлерді де анықтауға мүмкіндік береді.Бұл технология адамның аузы, ішектері, нәжістері және т.
Платформа:Illumina NovaSeq платформасы
-
Бактериялық және саңырауқұлақтардың толық геномын қайта секвенирлеу
Бактериялар мен саңырауқұлақтардың тұтас геномын қайта секвенирлеу белгілі бактериялар мен саңырауқұлақтардың геномдарын аяқтау, сондай-ақ бірнеше геномдарды салыстыру немесе жаңа организмдердің геномдарын картаға түсіру үшін маңызды құрал болып табылады.Нақты анықтамалық геномдарды жасау, микробтық идентификацияны және басқа да салыстырмалы геномдық зерттеулерді жүргізу үшін бактериялар мен саңырауқұлақтардың бүкіл геномдарын ретке келтірудің үлкен маңызы бар.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Метатранскриптомды реттілік
Метатранскриптомды секвенирлеу микробтардың (эукариоттардың да, прокариоттардың да) табиғи ортадағы (яғни, топырақ, су, теңіз, нәжіс және ішек.) ген экспрессиясын анықтайды. Атап айтқанда, бұл қызметтер күрделі микробтық қауымдастықтың гендік экспрессия профилін алуға, таксономиялық талдауға мүмкіндік береді. түрлердің, әр түрлі экспрессияланған гендердің функционалдық байыту талдауы және т.б.
Платформа: Illumina NovaSeq платформасы
-
Саңырауқұлақ геномы
Biomarker Technologies нақты зерттеу мақсатына байланысты геномды зерттеуді, жұқа геномды және саңырауқұлақтардың толық геномын қамтамасыз етеді.Геномды секвенирлеуге, құрастыруға және функционалдық аннотацияға геномдардың жоғары деңгейіне қол жеткізу үшін Келесі ұрпақ секвенциясы + Үшінші ұрпақ секвенциясын біріктіру арқылы қол жеткізуге болады.Hi-C технологиясын хромосома деңгейінде геномды жинақтауды жеңілдету үшін де қолдануға болады.
Платформа:PacBio жалғасы II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq платформасы
-
Бактериялардың толық геномы
Biomarker Technologies нөлдік аралығы бар бактериялардың толық геномын құру бойынша секвенирлеу қызметін ұсынады.Бактериялардың негізгі жұмыс ағымы толық геном құрылысына үшінші ұрпақ секвенциясы, құрастыру, функционалдық аннотация және нақты зерттеу мақсаттарына жауап беретін кеңейтілген биоинформатикалық талдау кіреді.Бактериялардың геномының жан-жақты профилі олардың биологиялық процестерінің негізінде жатқан іргелі механизмдерді ашуға мүмкіндік береді, бұл сонымен қатар жоғары эукариоттық түрлердегі геномдық зерттеулер үшін құнды анықтама бола алады.
Платформа:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq платформасы
PacBio жалғасы II
