Метагеномика (NGS)

Illumina көмегімен шолақ мылтық метагеномикасы күрделі үлгілерден ДНҚ-ны тікелей секвенирлеу арқылы микробиомаларды зерттеуге арналған танымал құрал болып табылады, бұл таксономиялық және функционалды әртүрлілікті зерттеуге мүмкіндік береді. BMKCloud метагеномдық (NGS) құбыры сапаны бақылаудан және метагеномды құрастырудан басталады, оның ішінен гендер болжанып, бірнеше дерекқорды пайдалана отырып, функция мен таксономияға түсініктеме берілген артық емес деректер жиынына кластерленген. Бұл ақпарат үлгі ішіндегі таксономиялық әртүрлілікті (альфа әртүрлілігі) және үлгі арасындағы әртүрлілікті (бета әртүрлілігі) талдау үшін пайдаланылады. Топтар арасындағы дифференциалды талдау параметрлік және параметрлік емес сынақтарды қолдана отырып, екі топ арасында ерекшеленетін OTU және биологиялық функцияларды табады, ал корреляциялық талдау бұл айырмашылықтарды қоршаған орта факторларымен байланыстырады.