Қысқартылған өкілдік бисульфит реттілігі (RRBS)
Қызмет сипаттамалары
Платформа: NovaSeq платформасы, PE150
Кітапхана түрі: 200-400bp енгізу бисульфитпен өңделген ДНҚ кітапханасы
Тізбектеу стратегиясы: жұптастырылған соңы 150 бит
Ұсынылатын деректер шығысы: 10 Гб бастапқы деректер/үлгі
Үлгіге қойылатын талаптар
ДНҚ саны: ≥ 2г
ДНҚ концентрациясы: ≥ 20нг/мкл.
Тазалық: OD260/280 = 1,8 - 2,0 деградациясыз немесе РНҚ ластануынсыз
Биоинформатикалық талдау
Қызметтің жұмыс ағыны
Үлгіні жеткізу
Кітапхана құрылысы
Тізбектеу
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
a.Анықтамалық геномды туралау статистикасы
Карталау статистикасы оқылады
SС учаскесінің секвенирлеу тереңдігі мен қамту статистикасы
Aжинақталған қамту
Dәрбір үлгінің сіңіру тиімділігі
b.Метилдену орнын анықтау
C сайтындағы метилдену деңгейлерінің тізімі
BS түрлендіру
Mэтилденген цитозин
Метилдену деңгейінің таралуы
c.Метилдену картасы
Gкең ауқымды
Gэном элементі
d.Үлгілер арасындағы метилдену деңгейлерін салыстыру
Pairwise CG метилденуінің корреляциясы
PCA-CG метилденуі
CCG метилденуінің жылтырлығы
d.Дифференциалды метилдену анализі
SDMR статистикасы
DMR ұзындығының таралуы
Hкартасын жеу
DМақсатты аймақта MR таралуы
