16s / 18s / оның ампликонның реттілігі-ngs
Қызмет көрсету ерекшеліктері
● Кезекшіл тұғырнама: Иллюминина Новоақ.
● 16С, 18-ші, 18-ші және одан да, одан да, одан да көп күш-жігердің қысқаруы.
● Amplicon икемді таңдауы.
● Бірнеше күшейту мақсаттары бар алдыңғы жоба тәжірибесі.
Қызметтің артықшылықтары
●Оқшаулаусыз:Экологиялық үлгілерде микробты композицияны тез анықтау.
●Жоғары ажыратымдылық: Қоршаған ортаға түсетін түтіктерде аз құрамдас бөліктерде.
●Кеңінен қолданылатын: Микробтық қауымдастық алуан түрлі зерттеулер.
●Жалпы биоинформатикалық талдау: Qiime2-дің соңғы2 пакеті (микробты экологиямен сандық түсінік) Деректер базасы, аннотация, ОТУ / ASV тұрғысынан әр түрлі талдаулармен.
●Кең сараптама: Жыл сайын 150 мың ампликонның реттелетін жобасы бар, BMKGENE онжылдық тәжірибе, жоғары білікті талдау тобы, жан-жақты мазмұн және сатудан кейінгі керемет қолдау.
Қызмет көрсету ерекшеліктері
| Кітапхана | САЯСАТ САЯСАТЫ | Деректер ұсынылады |
| Ампликон | Иллюминина PE250 | 50/100 / 300K тегтер (жұптарды оқыңыз) |
Қызметке қойылатын талаптар
| Концентрация (NG / мкл) | Жалпы сома (NG) | Көлемі (мкл) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Топырақ / шлам: 1-2g
● ішек-қарсылық-жануар: 0,5-2г
● ішек мазмұны-жәшік: 0.1-0.25г
● Өсімдік беті (байытылған тұнбаны): 0.1-0.5g
● ашыту сүнделуі Сорылған тұнбаны байытылған): 0.1-0.5г
● нәжістер (ірі жануарлар): 0,5--2г
● нәжістер (тінтуір): 3-5 граждар
● Өкпе альвеолярлы ара сұйық сұйықтығы: сүзгі қағазы
● Вагинальды тампон: 5-6 тампон
● Тері / Жыныс-түйек тампон / сілекей / Ауызша жұмсақ тіндер / Фарингальды тампон / Тікал тампоны: 2-3 тампон
● Беттік микроорганизмдер: сүзгі қағаздары
● Waterbod / Air / Biofilm: Сүзгі қағазы
● Эндофиттер: 1-2g
● Стоматологиялық тақта: 0.5-1g
Қызмет көрсету ағымы
Үлгіні жеткізу
Кітапхана құрылысы
Жүйелі кідіріс
Деректерді талдау
Сатудан кейінгі қызметтер
Келесі талдауды қамтиды:
- Деректердің сапасын бақылау
- OTU кластерлері / шу (ASV)
- OTU аннотациясы
- Альфа әртүрлілігін талдау: бірнеше индекстер, соның ішінде Шеннон, Симпсон және Эйс.
- Бета әртүрлілігін талдау
- Топтық талдау
- Корреляциялық талдау: қоршаған орта факторлары мен композиция мен әртүрлілік арасында
- 16s функционалды генді болжау
Таксономиялық таралу гистограммасы
Таксономиялық молшылықты кластерлеу жылу картасы
Альфа әртүрлілігін талдау: Сафакстің қисығы
Бета әртүрлілікті талдау: NMDS
Топтағы талдау: Leffe биомаркерді табу
Жарияланған жарияланымдар жинағы арқылы Иллюминамен Б.Р.Сеннің Amplicon Systance Services қызметтері жеңілдетілген жетістіктерді зерттеңіз.
Донг, C. және Al. (2022) «Юкоммалық ұлт және қабықша, юкоммалық топырақ және қабық микроэлемотио, микробиологиядағы», микробиологияның, 13. DOI: 10.3389 / FMICB.2022.855317 / толық.
Ли, Ю.Т. (2023) 'Тышқандағы гарддолеллес-вагинальды бакалинальды вагинозды емдеуге арналған синтетикалық бактериалды консорциация трансплантациясы', Microbiome, 11 (1), 11-14 бет. Doi: 10.1186 / S40168-023-01497-y
Ян, Ж., ФУ, Е. және Лю, Х. (2022) H. (2022) «Lunar Palace 365» өмірді қолдайтын эксперимент кезінде жиналған ауа шаңының микробиомалары, «Ай сарайы», Экологиялық микробиомалар, 17 (1), б. 1-20. Doi: 10.1186 / S40793-022-00399-0 / 0 / суреттер / 8.
Юн, S. және Al. (2022) 'Азотты түрлендіруге байланысты функционалды гендердің көптігі, компосттағы азоттың жоғалуы', Bieresource технологиясы, 361, б. 127678. Doi: 10.1016 / j.biortech.202222227678.
