FA'A'OGA FA'ATA'U
O le malosi o fa'ato'aga e fa'aitiitia ai le lavelave o feso'ota'iga microbial ma le tele o lafoga ma'a 'au'au i a'a
Fa'asologa o Amplicon Sequencing (ITS) |PacBio HIFI
Fa'ailoga
AO le fa'atupuina o fa'ato'aga ua fa'atupula'ia fa'afitauli ona o a'afiaga leaga o le si'osi'omaga e aofia ai le le lelei o le fa'aogaina o mea'ai, fa'amama vai, fa'aleagaina le lelei o le palapala, ma isi.Ole microbial community e iai sona sao taua ile gaosiga ma le fa'atumauina ole agroecosystem.Peita'i, e le'o manino pe fa'afefea ona a'afia a'a microbiota faiga fa'ato'aga.
Fuafuaga Fa'ata'ita'i
Fa'ata'ita'iga
Ssuau'u ma a'a (DNA) fa'ata'ita'iga sa mai fa'ato'aga saito mai le 60 fa'ato'aga fa'ato'aga (20 ta'itasi)
Grouping: 1. Feagaiga (faatasi ai ma le galueaina);2. Feagaiga (leai se galueaina);3. Fa'ato'aga fa'akomepiuta
Sfuafuaga fa'ata'ita'i: Fa'asologa o le amplicon sequencing atoa (ITS)
Primers: ITS1F-ITS4 (fa'atatau ile ITS itulagi atoa ~630 bp)
Stulaga fa'atusa: PacBio RS II
Bioinformatic Iloiloga
I'uga
On averesi e 357 OTU na fa'ailoa ile nofoaga ma le aofa'i e 837 OTU mai nofoaga uma e 60.E le'i fa'aalia se eseesega tele i faiga fa'ato'aga e tolu o le fa'avasegaina o fa'ato'aga.Peita'i, e tolu fuifui ma'oti na fa'atūina ile su'esu'ega o le 'ese'ese o le beta, e fa'ailoa mai ai le malosi o a'afiaga ole faiga fa'ato'aga ile fa'alapotopotoga ole a'a.
Ata 1. Alfa diversity (Shannon index and community composition) and beta diversity analysis (canonical analysis of principal coordinates) on root fungal community
Ti le ma'a'au'au lafoga na fa'amatalaina e fa'atatau i feso'ota'iga lautele o nu'u fa'alaua'itele i faiga fa'ato'aga se tolu: pito i luga 10 pito i luga e maualuga lona tikeri, pito sili ona vavalalata vavalalata ma pito i lalo ole vaeluagalemu na filifilia.O le fitu oi latou na auai i le mycorrhizal orders.
Ata 2. O feso'ota'iga lautele i nu'u fa'ato'aga e tolu
FO feso'ota'iga fa'apitoa e fa'aauupegaina na fa'ailoa mai ai le maualuga tele o feso'ota'iga i feso'ota'iga fa'aola fa'alua fa'alua pito ma sili atu nodes feso'ota'i nai lo feso'ota'iga leai ma masani.E le gata i lea, o le fesoʻotaʻiga faʻatoʻaga faʻatoʻaga o loʻo teuina ai le tele o lafoga maʻa (taimane) faʻatusatusa i isi, lea na lagolagoina lona lavelave ma fesoʻotaʻiga.
Ata 3. Fa'ato'aga fa'apitoa fa'ato'aga a'a fa'a'a'a
Amalosi le sootaga i le va o fa'ato'aga malosi ma a'a feso'ota'iga fungal sa matauina.O su'esu'ega fa'afuase'i o le vaomatua na fa'ailoa mai ai le fa'auluuluga o le lafoga ma'a 'au'au: phosphorus o le eleele, tele le mamafa, pH ma le mycorrhizal colonization.
Ata 4. Fa'ato'aga malosi ma feso'ota'iga feso'ota'iga i faiga fa'ato'aga se tolu (A ma le B);Su'esu'ega fa'afuase'i o vaomatua(C) ma So'otaga i le va o le malosi o fa'ato'aga ma le nofoia o le AMF (D)
Tekinolosi
Fa'asologa o amplicon umi atoa
As "Tolu Generation Sequencing" o loʻo oʻo mai i luga o le tulaga, o tapulaʻa i itulagi faʻatatau ma faʻalavelave i le fono a le novo ua faatoilaloina.Pacific Bioscience (PacBio) ua fa'alauteleina le faitau o fa'asologa i le sefulu o kilobases, lea e mafai ai ona tatou maua le faitau atoa o le 16s rRNA (1,000 bp-1,500 bp) i siama po'o le 18S rRNA (1,500 bp-2,000 bp) ma le ITS itulagi (400 bp-900 bp) i eukaryotics.O le fa'alauteleina o le va'aiga o mea tau kenera na matua fa'aleleia atili ai le fofoina o fa'amatalaga o ituaiga ma kenera galue.O le fa'afitauli ua leva ona popole i le sa'o sa'o ua fo'ia e le PacBio CCS fa'asa'oga a le tagata lava ia, lea e maua ai le faitau a le HIFI ma le sili atu i le 99% le sa'o o le faitau.
Fa'atinoga ile fa'amatalaga OTU
TO le lelei o le faitau umi ma le maualuga, o le sa'o o fa'amatalaga e mafai ona fa'atupula'ia tele ma 'ausia se fa'ai'uga "tulaga fa'apitoa" ile fa'ailoaina ole microbial.
Fa'asinomaga
Banerjee, Samiran, et al."O le faʻamalosia o faʻatoʻaga e faʻaitiitia ai le lavelave o fesoʻotaʻiga microbial ma le tele o lafoga maʻa autu i aʻa."Le ISME Journal (2019).
Tekinolosi ma Fa'ailoga e fa'atatau i le fa'asoaina o fa'aoga manuia lata mai o fa'atekonolosi fa'asologa fa'asolosolo maualuga i malae su'esu'e 'ese'ese fa'apea fo'i ma manatu fa'ata'ita'i ile fa'ata'ita'iga fa'ata'ita'iga ma su'esu'ega fa'amaumauga.
Taimi meli: Ian-08-2022