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BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
O tusitusiga fa'afanua o lo'o tu i luma ole fa'asaienisi fa'afouga, fa'amalosia tagata su'esu'e e su'esu'e i fa'ata'ita'iga lavelave fa'aaliga o kenera i totonu o masini a'o fa'asaoina a latou fa'afanua fa'afanua. I le lotolotoi o tulaga eseese, BMKGene ua atiina ae le BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, faʻamaualuga se faʻaleleia atili o le 3.5µm, oʻo atu i le subcellular range, ma faʻatagaina le tele-level resolution settings. O le S3000 chip, o lo'o fa'aalia ai le tusa ma le 4 miliona fa'ailoga, o lo'o fa'aaogaina microwells fa'apipi'iina i lopa ua tumu i va'a va'ava'a fa'ailoga pu'e su'ega. O se faletusi cDNA, fa'atamaoaigaina i fa'ailoga avanoa, ua saunia mai le S3000 chip ma mulimuli ane fa'asologa i luga o le Illumina NovaSeq platform. O le tu'ufa'atasiga o fa'ata'ita'iga fa'ailoga va'ava'ai ma UMI e fa'amautinoa ai le sa'o ma le fa'apitoa o fa'amaumauga na gaosia. O le BMKManu S3000 chip's e matua'i fa'apitoa, e ofoina atu le tele-tulaga fa'ai'uga fa'atulagaina e mafai ona fa'alogo lelei i masini eseese ma tulaga mana'omia o fa'amatalaga. O le fetuutuuna'i lea e fa'atūina ai le pu o se filifiliga mata'ina mo su'esu'ega transcriptomics fa'amanino eseese, fa'amautinoaina le fa'aputuina fa'amanino ma sina pisa. O le fa'aogaina o le fa'aogaina o tekonolosi fa'atasi ma le BMKManu S3000 e mafai ai ona fa'agataina fa'amaumauga fa'amaumauga i tua'oi o sela, ma maua ai se su'esu'ega e iai lona uiga fa'aola. E le gata i lea, o le faʻaleleia atili o le S3000 e maua ai le numera maualuga o genes ma UMI e maua i le sela, e mafai ai ona sili atu le saʻo o suʻesuʻega o mamanu faʻafanua ma le faʻapipiʻiina o sela.
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Fa'asologa o le RNA nuclei e tasi
O le atina'eina o le pu'e tasi-selau ma faiga masani fau faletusi, fa'atasi ai ma le fa'asologa maualuga, ua toe fa'afouina su'esu'ega fa'aaliga o kene i le tulaga sela. O lenei lavelave e mafai ai ona loloto ma sili atu le auiliiliga auiliili o le faitau aofaʻi o sela lavelave, faʻatoʻilaloina tapulaʻa e fesoʻotaʻi ma le averesi o faʻamatalaga o kenera i luga o sela uma ma faʻasaoina le eseesega moni i totonu o nei tagata. E ui o le fa'asologa o le RNA sela tasi (scRNA-seq) e le mafai ona fa'afitia, e feagai ma lu'itau i nisi o masini lea e fa'amaonia ai le faigata o le fa'atūina o se fa'amalologa e tasi ma mana'omia ni fa'ata'ita'iga fou. I le BMKGene, matou te faʻatalanoaina lenei faʻalavelave e ala i le ofoina atu o le faʻasologa o le RNA tasi-nucleus (snRNA-seq) e faʻaaoga ai le tekonolosi 10X Genomics Chromium. O lenei faiga e fa'alauteleina ai le alaleo o fa'ata'ita'iga e mafai ona fa'atatau ile su'esu'ega transcriptome ile tulaga tasi le sela.
O le fa'aesea o nuclei e fa'ataunu'uina e ala i le 10X Genomics Chromium chip fou, fa'aalia ai se masini microfluidics e valu-auala fa'atasi ai ma kolosi fa'alua. I totonu o lenei faiga, o loʻo faʻapipiʻi gel faʻapipiʻi faʻamaufaʻailoga, primers, enzymes, ma se nucleus e tasi o loʻo faʻapipiʻiina i mataua suauʻu nanoliter-sized, e fai ai Gel Bead-in-Emulsion (GEM). A maeʻa le faʻavaeina o le GEM, faʻamama le cell lysis ma faʻasalalauga faʻamaufaʻailoga e tupu i totonu o GEM taʻitasi. Mulimuli ane, o le mRNA moleki e toe faʻaliliuina i cDNAs, faʻatasi ai le 10X barcodes ma Unique Molecular Identifiers (UMIs). O nei cDNA o lo'o tu'uina atu i lalo o le fa'atulagaina o faletusi fa'asologa, fa'afaigofieina se su'esu'ega malosi ma fa'amalamalamaga o fa'amatalaga fa'amatalaga o kenera i le tulaga tasi le sela.
Fa'avae: 10× Genomics Chromium ma Illumina NovaSeq Platform
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10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Spatial transcriptomics ose tekonolosi fa'aonaponei e mafai ai e tagata su'esu'e ona su'esu'e fa'ata'ita'iga fa'aaliga o kenera i totonu o masini a'o fa'asaoina a latou fa'afanua fa'afanua. O le tasi tulaga mamana i lenei vaega o le 10x Genomics Visium faʻatasi ma le faʻasologa o le Illumina. O le mataupu faavae o le 10X Visium o loʻo taoto i luga o se vaʻa faʻapitoa faʻatasi ai ma se nofoaga e puʻeina e tuʻuina ai vaega o mea. O le vaega lea e pu'e ai o lo'o iai ni fa'ailoga fa'ailoga, e tutusa uma ma se nofoaga fa'apitoa fa'apitoa i totonu ole aano. O mole mole RNA na pu'eina mai le aano o lo'o fa'ailogaina i fa'amatalaga mole mole tulaga ese (UMIs) i le taimi o le fa'aliliuga fa'aliliuga. O nei fa'ailoga fa'ailoga ma UMI e mafai ai ona fa'ata'atia sa'o fa'afanua ma fa'atatauina o fa'amatalaga o kenera i se fa'ai'uga e tasi le sela. O le tu'ufa'atasiga o fa'ata'ita'iga fa'ailoga va'ava'ai ma UMI e fa'amautinoa ai le sa'o ma le fa'apitoa o fa'amaumauga na gaosia. I le faʻaaogaina o lenei Spatial Transcriptomics technology, e mafai ai e tagata suʻesuʻe ona maua se malamalama loloto atu i le faʻalapotopotoga faʻapitoa o sela ma fesoʻotaʻiga mole mole lavelave o loʻo tutupu i totonu o masini, e ofoina atu ai faʻamatalaga taua i le faʻaogaina o faiga faʻavae i le tele o vaega, e aofia ai le oncology, neuroscience, developmental biology, immunology. , ma su'esu'ega fa'ato'aga.
Fa'avae: 10X Genomics Visium ma Illumina NovaSeq
