Fa'asologa Umi e Le Fa'ailogaina-Illumina
Fa'amanuiaga o Auaunaga
●Su'esu'ega fa'atasi o le mRNA ma le lncRNAE ala i le tuufaatasia o le fuaina o tusitusiga o le mRNA ma le suʻesuʻeina o le lncRNA ma a latou sini, e mafai ona maua se aotelega loloto o le faiga faatonutonu o loo i lalo o le tali atu o le sela.
●Tomai Faapitoa TeleUa matou fa'agasoloina le silia ma le 230,000 fa'ata'ita'iga, e aofia ai fa'ata'ita'iga eseese ma sini o galuega faatino. Matou te aumaia le tele o tomai fa'apitoa i galuega faatino ta'itasi.
●Su'esu'ega fa'atasi o le mRNA ma le lncRNAMatou te tuʻufaʻatasia le fuaina o tusitusiga o le mRNA ma le suʻesuʻeina o le lncRNA ma a latou sini, ma mafai ai ona maua se aotelega loloto o le faiga faʻatonutonu o loʻo i lalo o le tali atu o sela.
●Pulea Lelei o le Tulaga LeleiMatou te faʻatinoina vaega autu o le pulea i laʻasaga uma, mai le sauniuniga o faʻataʻitaʻiga i le sauniuniga o le faletusi, faʻasologa o suʻesuʻega ma faʻamatalaga faʻapitoa. O la matou mataʻituina ma le faʻaeteete e faʻamautinoa ai le tuʻuina atu o taunuuga maualuga le tulaga lelei.
●Fa'amatalaga AtoaMatou te faʻaaogaina le tele o faʻamaumauga e faʻailoa ai galuega a Differentially Expressed Genes (DEGs) ma faʻatino ai auʻiliʻiliga faʻamauoa talafeagai. O lenei auala atoatoa e maua ai ni malamalamaaga i faiga faʻaselula ma molecular o loʻo faʻavae i luga o le tali atu o le transcriptome, ma ia mautinoa e te mauaina faʻamatalaga uma e mafai e uiga i faʻamaumauga o lau faʻataʻitaʻiga.
●Lagolago pe a uma le fa'ataugaMatou te malamalama i le tāua o le auai, o le mafuaʻaga lea e sili atu ai la matou tautinoga nai lo le maeʻa o le galuega faatino ma se vaitaimi e 3 masina pe a uma le faʻatau atu. I le taimi lea, matou te ofoina atu le faʻaauauina o le galuega faatino, fesoasoani i le foia o faʻafitauli, ma sauniga Fesili ma Tali e tali ai soʻo se fesili e fesoʻotaʻi ma iʻuga.
Mana'oga Fa'ata'ita'i ma le Tu'uina Atu
| Faletusi | Fa'avae | Fa'amaumauga fautuaina | Fa'amaumauga o Fa'amaumauga |
| Faletusi fa'asino ua fa'aitiitia le rRNA | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nukleotida:
| Fa'aputuga (ng/μl) | Aofa'i (μg) | Mama | Fa'amaoni |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 E fa'atapula'aina pe leai fo'i se fa'aleagaina o le porotini po'o le DNA o lo'o fa'aalia i le gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; fa'atapula'aina pe leai fo'i se si'itia fa'avae |
● La'au:
A'a, Ogālaau po'o le Petal: 450 mg
Lau po'o le fatu: 300 mg
Fua: 1.2 kalama
● Manu:
Fatu po'o le Ga'au: 450 mg
Togavao po'o le Fai'ai: 240 mg
Masele: 600 mg
Ponaivi, Lauulu po'o le Pa'u: 1.5g
● O Arthropods:
Iniseti: 9g
Mea'ai Fa'asusu: 450 mg
● Toto atoa:2 paipa
● Sela: 106 sela
● Suau'u ma le Plasma6 mL
Fa'ata'ita'iga Fautuaina mo le Tu'uina Atu
Pusa: Paipa fa'aputu 2 ml (E le fautuaina le fa'aaogaina o le pepa apamemea)
Fa'ailoga fa'ata'ita'i: Vaega+fa'ata'ita'i e pei o le A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Felauaiga:
1. Aisa mago: E manaʻomia ona teuina faʻataʻitaʻiga i totonu o taga ma tanu i le aisa mago.
2. Paipa RNAstable: E mafai ona fa'amago fa'ata'ita'iga RNA i totonu o le paipa fa'amautu RNA (e pei o le RNAstable®) ma lafo i le vevela o le potu.
Tafega o Galuega Auaunaga
Fuafuaga o fa'ata'ita'iga
Fa'ata'ita'iga o le tu'uina atu
Aveeseina o le RNA
Fausiaina o le faletusi
Fa'asologa
Su'esu'ega o fa'amaumauga
Auaunaga pe a uma le fa'atau atu
Fa'amatalaga Fa'a-Bio
- Fa'amaumauga mata
- Fa'amaumauga o Fa'amaumauga
- Fa'atulagaina o le genome
- Fausaga o kene (Fa'asologa o isi mea, fa'aleleia atili o fausaga o kene ma le vavalo fou o kene)
- Fuainumera o le fa'aalia o kene
- Su'esu'ega o fa'aaliga eseese
- Fa'amatalaga ma fa'atamaoaigaina o le DEG + Eseesega o le lncRNA target genes
- Fa'ailoaina o le tusitusiga
- Fa'ailoaina o le lncRNA (puipuiga o le lncRNA ma le lncRNA ua iloa)
- Vavalo o kenera fa'atatau o le lncRNA
- Fuainumera o le fa'aalia o le lncRNA
- Su'esu'ega fa'atasi ma fa'amaumauga mRNA
Su'esu'ega o le Fa'aalia o Gene (DEGs)
Fuainumera o le fa'aalia o le lncRNA - fa'aputuga
Fa'aleleia atili o kenera fa'atatau lncRNA
Su'esu'ega o le tulaga o le mRNA ma le lncRNA – Circos plot (o le li'o ogatotonu o le mRNA ma le li'o i totonu o le lncRNA)
Su'esu'e ia alualu i luma na fa'afaigofieina e auaunaga fa'asologa o le lncRNA a le BMKGene e ala i se fa'aputuga o lomiga ua filifilia.
Ji, H. et al. (2020) 'Fa'ailoaina, vavaloina o galuega, ma le fa'amaoniga autu o le lncRNA o lncRNA e feso'ota'i ma le atuatuvale malulu i le ate o isumu',Lipoti Faasaienisi2020 10:1, 10(1), itulau 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'O le Su'esu'ega Fa'atasi o le Transcriptomic e Fa'aalia ai le Faiga o le Puipuiga o le Tino mo se CyHV-3-Resistant Common Carp Strain',Tuaoi i le Immunology, 12, itulau. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ ma isi. (2022) 'Fa'amuamua e Fa'avae i le Tu'ufa'atasia o le Multi-Omics o Feso'ota'iga Fa'atonutonu RNA Endogenous Tauva i le Kanesa o le Mama Laiti: Uiga Fa'a-molekula ma Sui Tauva mo Vaila'au',Tuaoi i le Oncology, 12, itulau. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'O le vaevaeina o kenera o le feso'ota'iga fa'atasi o kenera o lo'o i lalo o le photosynthesis i Populus',Tusi Fa'amaumauga o Tekonolosi o La'au, 18(4), itulau 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'O se Feso'ota'iga Fa'atonutonu Fa'alelalolagi mo le Fa'aalia o Gene e le'i Fa'atonutonuina ma Fa'ailoga Metabolic e le Masani i totonu o Sela Puipuiga i le Siosiomaga Laiti o le Fa'ama'i o Graves ma le Thyroiditis o Hashimoto',Tuaoi i le Immunology, 13, itulau. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
