De Novoo bacterlial connedine
Matou te tuʻuina atu le atoa o le faʻaaogaina o le faʻaaogaina o le aoina o le auʻaunaga. E mafai lea tulaga ile tuʻufaʻatasia o tekonolosi faʻasologa o tekonolosi, pei o le Nanopoi ma le Panabio mo le faʻatulagaina ma le puʻupuʻu-faitau ma le Mustamlia. O la matou tautua e maua ai galuega faʻaolepau o le bioniniclow mai le faʻapotopotoga, pulea lelei, ma alualu i luma bivinicitatic aʻoaʻoga, faʻataunuuina o sini faʻapitoa. O lenei auaunaga e mafai ai ona atiaʻe le atinaʻeina o manatu faʻapitoa mo ituaiga eseese mo eseese ituaiga o kenera ma aʻoga. Ma le isi, e fausia le faavae mo talosaga e pei o le faʻaauauina o le ola aʻe, afi eletise, ma le milimiomic-tekonolosi fou.
Tautua o foliga
● O filifiliga e lua e mafai ona filifili e fuafua mai le faʻalagolago i le tulaga manaʻomia o le atoatoa atoatoa.
● Faʻasalaga le filifiliga a le Actime: Faʻamalosi-faitau sequening ma imoturi novaseq pe150.
● Faatumu le 0 Gap Pranome.
● Vasega umi-faitau sequeding i le nanopore promethore 48 pe scbio revio mo le lautele lautele.
● O le puʻupuʻu-faitau sequeding i Yimumuna NOVASIQ mo le moni faʻamaonia ma sese faʻasaʻoga (Nanopore) pe faia se ata mataga.
Tulaga lelei
●Zero-gap geneti o mautinoa: E mafua mai i le tuʻufaʻatasia o le maʻi o le oso i lalo ma le umi faitau o le faasologa (nanopoi poʻo le palauvale).
●Faʻatumu le BIININSICATICTS Workflow:E aofia ai ma le tele o mea taua ma le fuafuaina o le tele o elemene, o le galuega faʻatino, ma vaʻaia manatu o faʻaaliga e pei o circos palu.
●Lautele tomai faapitoa: Ma le silia ma le 20,000 microBal conmemes e faʻafitu i le atoa o le tonu o le poto masani, o se aʻoaʻoga sili ona aʻoaʻoina, o mea lautele, ma sili atu le lagolagoina
●Lagolago lagolago:O la matou tautinoga na sosoʻo atu i tua atu o le poloketi na maeʻa le 3-masina ina ua faʻatau atu auaunaga. I le taimi lea, matou te ofoina atu ai le faʻagaioiga e mulimulitaʻia, faʻafitauli fesoasoani, ma Q & ma ni sauniga e faʻailoa ai soʻo se fesili e fesoʻotaʻi ma faʻaiuga.
●Tele ni fuafuaga a leisi avanoa:Mo eseese suʻesuʻega sini ma manaʻoga o le atoatoa atoatoa.
Auaunaga Mataupu Faavae
| Tautua | SUʻESUʻEGA FAʻATASI |
| Ata ata | Issumina P150 100x |
| 0 Gap Preyome | Nanopore 100x + Imumina P150 100x Or Pacbio HifI 30x + Imumina P150 100x (filifiliga) |
Faʻataʻitaʻiga Manaʻoga:
| Manatu (ng / μl) | Aofai aofaiga (μg) | Voluma (μl) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
| Pasebio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Immumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
: ≥ o le ≥3.5x1010 sela
Auaunaga galue
Faataʻitaʻiga Faafou
Fausiaina o le Faletusi
Liu
Faamatalaga o faamatalaga
A maeʻa-faʻatau auaunaga
E aofia ai le auiliiliga lenei:
● O le faʻasologa o faʻamatalaga lelei
● Faifai o le Fono Aoao
● O le auiliiliga o le vaega o le vaega: Valoaga o CDS ma le tele o elemene o elemene
● Faʻalauiloaina o faʻamatalaga ma le tele o ata lautele (alu, kegg, etc) ma alualu i luma datably (card, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, vfdb, visa
● Atalii Valivali
Matou te avatua le lanu i se auala vave e mafai ai ona maua se mea fou ma o le numera o le ata.
Grea gunotation - alu
Gra gunotions - cazy carbohydrated
Centane Shiplization - Circos paketi
Saili vave alualu i luma e faauigaina e Bmkgene's backned chinery tautua i se faalumaina aoina o lomiga.
Dai, W.t al. (2023) 'Mauaina o Bacteromides Uniside F18-22 o se saogalemu ma رور hadiovedium bacteraim mo le togafitiga o le Ulceotis Cololis',Faavaomalo Faavaomalo o Molecular Saienisi, 24 (19), i. 14669. Doi: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
Kang, q. et al. (2021) 'O le multidrugrrgrress Ruratus Miralis Isolates o Blooxa-1 ma Blandm-1 mai Wildlife Soifua Maloloina lamatia',Tuufaatasia o le zoology, 16 (6), pp. 798-809. DoI: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Wang, tt et al. (2017) 'Faʻamaeʻaina o le faʻasologa o le tumau o le Premophyte Bacils Flexus Klbmp 4941 faʻaalia lona laau toto tuputupu ma o le Corpocards mo le Corporam Molconam ma Generaina Malos learctionsTusi o talaaga o le biotechnology, 260, i. 38-41. DoI: 10.1016 / J.JBIODEC.2017.09.001.
Wang, x. et al. (2021) 'O le tele-faʻailoga o loʻo teteʻe atu i le GleBeland o le Klebiella Faʻasalalauga Extramation o le Atimeicroobal Geneticroobal GeneticicroolLuma i le microbiologyO LE A LE EM I. 754931. DOI: 10.3389 / FOCAMB.2021.754931 / Bibtex.
