Metagenomics (NGS)

Shotgun metagenomics ma Illumina o se meafaigaluega lauiloa mo le suʻesuʻeina o microbiome e ala i le faʻasologa saʻo o le DNA mai faʻataʻitaʻiga lavelave, e mafai ai ona suʻesuʻeina uma le taxonomic ma galuega eseese. O le BMKCloud metagenomic (NGS) pipeline e amata ile pulea lelei ma le metagenome faʻapotopotoga, lea e vaʻaia ai kenera ma faʻapipiʻi i totonu o faʻamaumauga e le toe faʻaaogaina o loʻo faʻamatalaina mo galuega ma taxonomy e faʻaaoga ai le tele o faʻamaumauga. O lenei fa'amatalaga e fa'aoga e au'ili'ili ai i totonu-fa'ata'ita'iga le eseesega o lafoga (alpha diversity) ma le va-sample diversity (beta diversity). O su'esu'ega eseese i le va o vaega o lo'o maua ai OTU ma galuega fa'ale-ola e 'ese'ese i le va o vaega e lua e fa'aaoga uma ai su'ega parametric ma su'ega e le o parametric, a'o su'esu'ega fa'amaopoopo e feso'ota'i nei eseesega i mea tau si'osi'omaga.