Eukaryotic mRNA Suʻesuʻega (faʻavae faʻamatalaga ma filifiliga de novo avanoa)
O lenei paipa e faʻaaogaina faʻamaumauga NGS RNA-Seq e fai ma faʻaoga ma maua ai faʻaiʻuga mai le tele o suʻesuʻega i lalo e aofia ai ae le gata i: faʻasologa o suʻesuʻega lelei o faʻamaumauga,o le foufa'amatalaga nofoaga fa'aliliu, su'esu'ega fesuia'i feso'ota'iga, su'esu'ega fa'aaliga eseese, fa'amatalaga galuega ma su'esu'ega fa'atamaoaigaina.
Su'esu'ega RNA umi e le fa'ailoga
O RNA e le fa'ailoga umi (lncRNA) o fa'amaumauga e le o fa'ailoga ma umi umi nai lo le 200 nt ma e iloa e fa'atino matafaioi i le fa'alapotopotoga ma le fa'atonuga o le chromatin. O tekonolosi fa'asologa maualuga ma le bioinformatic ua fa'amalosia ai lo matou malamalama i fa'asologa o le lncRNA ma le fa'atulagaina o fa'amatalaga e iloa ai lncRNA ma galuega fa'atonutonu taua. O lenei paipa e maua ai le lncRNA su'esu'ega fa'aopoopo i au'ili'iliga o lo'o ta'ua i le Eukaryotic mRNA Analysis pipeline.
16S/18S/ITS amplicon sequencing
O le Amplicon Sequencing microbial diversity analysis pipeline na atia'e e fa'atatau i tausaga o le poto masani ile su'esu'ega ole poloketi ole microbial diversity. O le paipa o lo'o i ai su'esu'ega fa'avae fa'ata'atia, lea e aofia ai fa'amatalaga au'ili'ili fa'apitoa o su'esu'ega fa'aola o lo'o iai nei ma su'esu'ega fa'apitoa. O le lipoti o au'ili'iliga e 'oloa ma atoatoa, ma le filifiliga e fa'atino ai su'esu'ega fa'apitoa a le tagata lava ia. E le gata i lea, o faʻataʻitaʻiga ma vaega e mafai ona faʻaleleia i luga o le lele mo faʻaopoopoga faʻapitoa ma pulea.
Su'esu'ega Metagenomics fana
Ole laina ole Shotgun Metagenomic Analysis pipeline e fa'aogaina ai fa'amaumauga NGS mai mea fa'afefiloi genomic na maua mai fa'ata'ita'iga o le si'osi'omaga. O su'esu'ega fa'aaofia e maua ai fa'amatalaga au'ili'ili e uiga i ituaiga eseese ma le tele, fausaga o le faitau aofa'i, feso'ota'iga phylogenetic, genes galue, ma feso'ota'iga feso'ota'iga ma mea tau le si'osi'omaga.
NGS-WGS Su'esu'ega Va'aiga
O le NGS-WGS Variant Analysis o se paipa faʻafesoʻotaʻi faʻafesoʻotaʻi e faʻatino ai le faʻatonutonuina o faʻamaumauga, faʻasologa faʻasologa, faʻamatalaga, ma suʻesuʻega faʻasologa o gene. O le paipa e mulimulitaia GATK faiga sili mo le SNP ma InDel suʻesuʻeina ma faʻaaoga Manta mo le faʻatulagaina o valaʻau eseese.
Genome Wide Association Study (GWAS)
Ole paipa ole GWAS ose au'ili'iliga i lalo e ave ai faila VCF na faia muamua ma fa'amaumauga phenotype tutusa mo se vaega o tagata ta'ito'atasi e fai ma fa'aoga. I le fa'aaogaina o metotia fa'afuainumera fa'apitoa, e fa'amoemoe le GWAS e fa'ailoa suiga o le nucleotide genome-lautele e feso'ota'i ma eseesega o phenotypic. E iai sona sao taua i le su'esu'eina o kenera galue e feso'ota'i ma fa'ama'i lavelave o tagata ma uiga lavelave i la'au ma manu.
Su'esu'ega Tu'ufa'atasiga Tele (BSA)
O le su'esu'ega a le BSA e aofia ai le tu'ufa'atasia o tagata ta'ito'atasi o lo'o iai uiga tu'ufa'atasiga mai le faitau aofa'i o tagata. I le fa'atusatusaina o loci 'ese'ese i le va o fa'ata'ita'iga tu'ufa'atasia, o lenei faiga e vave fa'ailoa ai fa'ailoga mole mole feso'ota'i vavalalata ma kenera fa'atatau. Fa'aaoga lautele i fa'afanua fa'a kenera o la'au ma manu, ose meafaigaluega taua mo fa'ailoga-fesoasoani fa'ato'aga.
Evolutionary Genetics Analysis
Ole su'esu'ega ole su'esu'ega ole Evolutionary Genetics e fa'aaogaina ai le poto masani a le BMKGENE i galuega fa'atupu fa'atupu fa'atupuina ma e aofia ai le fausiaina o la'au phylogenetic, su'esu'ega fa'aletonu o feso'ota'iga, su'esu'ega fa'ale-aganu'u, su'esu'ega salu filifilia, su'esu'ega fa'auiga, su'esu'ega autu, ma le fa'avasegaina o tagata.
