Giải trình tự metagenomics (NGS)

Giải trình tự metagenomics bằng hệ thống Illumina là một công cụ phổ biến để nghiên cứu hệ vi sinh vật bằng cách giải trình tự trực tiếp DNA từ các mẫu phức tạp, cho phép nghiên cứu cả sự đa dạng về phân loại và chức năng. Quy trình metagenomics (NGS) của BMKCloud bắt đầu bằng việc kiểm soát chất lượng và lắp ráp metagenome, từ đó các gen được dự đoán và nhóm lại thành các tập dữ liệu không trùng lặp, được chú thích về chức năng và phân loại bằng cách sử dụng nhiều cơ sở dữ liệu. Thông tin này được sử dụng để phân tích sự đa dạng phân loại trong mẫu (đa dạng alpha) và sự đa dạng giữa các mẫu (đa dạng beta). Phân tích khác biệt giữa các nhóm tìm ra các OTU và chức năng sinh học khác nhau giữa hai nhóm bằng cách sử dụng cả các phép thử tham số và phi tham số, trong khi phân tích tương quan liên hệ những khác biệt này với các yếu tố môi trường.