-
Phân tích hiệp hội toàn bộ bộ gen
Nghiên cứu kết hợp trên toàn bộ gen (GWAS) nhằm mục đích xác định các biến thể di truyền (kiểu gen) liên quan đến các đặc điểm cụ thể (kiểu hình).Nghiên cứu của GWAS điều tra các dấu hiệu di truyền trên toàn bộ bộ gen của một số lượng lớn các cá thể và dự đoán mối liên hệ kiểu hình-kiểu gen bằng phân tích thống kê ở cấp độ quần thể.Nó đã được ứng dụng rộng rãi trong nghiên cứu bệnh tật ở người và khai thác gen chức năng trên các đặc điểm phức tạp của động vật hoặc thực vật.
-
Trình tự RNA đơn nhân
Sự tiến bộ trong kỹ thuật thu thập tế bào đơn lẻ và kỹ thuật xây dựng thư viện riêng lẻ kết hợp với giải trình tự thông lượng cao cho phép nghiên cứu biểu hiện gen trên cơ sở từng tế bào.Nó cho phép phân tích hệ thống sâu hơn và đầy đủ hơn về các quần thể tế bào phức tạp, trong đó nó phần lớn tránh được việc che giấu tính không đồng nhất của chúng bằng cách lấy giá trị trung bình của tất cả các tế bào.
Tuy nhiên, một số tế bào không thích hợp để tạo thành huyền phù tế bào đơn, do đó cần có các phương pháp chuẩn bị mẫu khác - tách nhân từ mô, nghĩa là tách nhân trực tiếp từ mô hoặc tế bào và chuẩn bị thành huyền phù đơn nhân cho huyền phù đơn nhân. giải trình tự tế bào.
BMK cung cấp dịch vụ giải trình tự RNA đơn bào dựa trên Genomics 10×.Dịch vụ này đã được sử dụng rộng rãi trong các nghiên cứu liên quan đến bệnh tật như biệt hóa tế bào miễn dịch, tính không đồng nhất của khối u, phát triển mô, v.v.
Chip phiên mã không gian: 10× Genomics
Nền tảng: Nền tảng Illumina NovaSeq
-
Giải trình tự toàn bộ bộ gen thực vật/động vật
Việc sắp xếp lại trình tự toàn bộ bộ gen, còn được gọi là WGS, cho phép phát hiện cả đột biến phổ biến và đột biến hiếm trên toàn bộ bộ gen bao gồm Đa hình Nucleotide đơn (SNP), Xóa chèn (InDel), Biến thể cấu trúc (SV) và Biến thể số sao chép (CNV) ).SV chiếm phần lớn cơ sở biến thể so với SNP và có tác động lớn hơn đến bộ gen, điều này có ảnh hưởng đáng kể đến các sinh vật sống.Việc sắp xếp lại trình tự đọc dài cho phép xác định chính xác hơn các đoạn lớn và các biến thể phức tạp vì việc đọc dài giúp việc vượt qua nhiễm sắc thể dễ dàng hơn nhiều trên các vùng phức tạp như lặp lại song song, vùng giàu GC/AT và vùng siêu biến.
Nền tảng: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Bản phiên mã không gian BMKMANU S1000
Tổ chức không gian của các tế bào đóng vai trò quan trọng trong các quá trình sinh học khác nhau, chẳng hạn như xâm nhập miễn dịch, phát triển phôi, v.v. Trình tự phiên mã không gian, cho biết hồ sơ biểu hiện gen trong khi vẫn giữ lại thông tin về vị trí không gian, đã cung cấp những hiểu biết sâu sắc về cấu trúc mô ở cấp độ phiên mã.Với sự phát triển của công nghệ, hình thái mô siêu rõ và sự khác biệt về cấu trúc thực sự của biểu hiện phân tử trong không gian cần được nghiên cứu với độ phân giải cao hơn.BMKGENE cung cấp dịch vụ giải trình tự phiên mã không gian toàn diện, một cửa từ mẫu đến hiểu biết sinh học.
Các công nghệ phiên mã không gian đã trao quyền cho các quan điểm mới trong lĩnh vực nghiên cứu đa dạng bằng cách giải quyết hồ sơ biểu hiện gen với nội dung không gian trong các mẫu không đồng nhất.
Chip phiên mã không gian: BMKMANU S1000
Nền tảng: Nền tảng Illumina NovaSeq
-
Bản phiên mã không gian Visium 10x Genomics
Biểu hiện gen không gian Visium là công nghệ giải trình tự phiên mã không gian chính thống để phân loại mô dựa trên tổng số mRNA.Ánh xạ toàn bộ bảng điểm với bối cảnh hình thái để khám phá những hiểu biết mới về sự phát triển bình thường, bệnh lý bệnh và nghiên cứu tịnh tiến lâm sàng.BMKGENE cung cấp dịch vụ giải trình tự phiên mã không gian toàn diện, một cửa từ mẫu đến hiểu biết sinh học.
Các công nghệ phiên mã không gian đã trao quyền cho các quan điểm mới trong lĩnh vực nghiên cứu đa dạng bằng cách giải quyết hồ sơ biểu hiện gen với nội dung không gian trong các mẫu không đồng nhất.
Chip phiên mã không gian: 10x Genomics Visium
Nền tảng:Nền tảng Illumina NovaSeq
-
Trình tự mRNA có chiều dài đầy đủ-Nanopore
Giải trình tự RNA là một công cụ vô giá để phân tích bản phiên mã toàn diện.Không còn nghi ngờ gì nữa, trình tự đọc ngắn truyền thống đã đạt được nhiều bước phát triển quan trọng ở đây.Tuy nhiên, nó thường gặp phải những hạn chế trong việc nhận dạng đồng dạng có độ dài đầy đủ, định lượng, sai lệch PCR.
Giải trình tự Nanopore khác biệt với các nền tảng giải trình tự khác, ở chỗ các nucleotide được đọc trực tiếp mà không cần tổng hợp DNA và tạo ra thời gian đọc dài ở mức hàng chục kilobase.Điều này cho phép đọc trực tiếp các bản ghi có độ dài đầy đủ và giải quyết các thách thức trong các nghiên cứu ở cấp độ isoform.
Nền tảng：Nanopore PromethION
Thư viện:cDNA-PCR
-
Trình tự mRNA có độ dài đầy đủ -PacBio
Mới bắt đầugiải trình tự phiên mã có độ dài đầy đủ, còn được gọi làMới bắt đầuIso-Seq tận dụng các ưu điểm của trình sắp xếp chuỗi PacBio về độ dài đọc, cho phép giải trình tự các phân tử cDNA có độ dài đầy đủ mà không bị gián đoạn.Điều này hoàn toàn tránh được bất kỳ lỗi nào được tạo ra trong các bước lắp ráp bản ghi và xây dựng các bộ unigene với độ phân giải ở mức isoform.Bộ unigene này cung cấp thông tin di truyền mạnh mẽ dưới dạng “bộ gen tham chiếu” ở cấp độ phiên mã.Ngoài ra, kết hợp với dữ liệu giải trình tự thế hệ tiếp theo, dịch vụ này cho phép định lượng chính xác biểu thức ở cấp độ isoform.
Nền tảng: PacBio Sequel IIThư viện: Thư viện chuông SMRT -
Trình tự mRNA của sinh vật nhân chuẩn-Illumina
Giải trình tự mRNA cho phép lập hồ sơ tất cả các mRNA được phiên mã từ các tế bào trong các điều kiện cụ thể.Đây là một công nghệ mạnh mẽ để tiết lộ hồ sơ biểu hiện gen, cấu trúc gen và cơ chế phân tử của các quá trình sinh học nhất định.Cho đến nay, giải trình tự mRNA đã được sử dụng rộng rãi trong nghiên cứu cơ bản, chẩn đoán lâm sàng, phát triển thuốc, v.v..
Nền tảng: Nền tảng Illumina NovaSeq
-
Trình tự mRNA không dựa trên tham chiếu-Illumina
Giải trình tự mRNA áp dụng kỹ thuật giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) để thu giữ RNA thông tin (mRNA) ở dạng Eukaryote ở giai đoạn cụ thể mà một số chức năng đặc biệt đang kích hoạt.Bản phiên mã dài nhất được ghép nối được gọi là 'Unigene' và được sử dụng làm trình tự tham chiếu cho phân tích tiếp theo, đây là phương tiện hiệu quả để nghiên cứu cơ chế phân tử và mạng lưới điều hòa của loài mà không cần tham khảo.
Sau khi tập hợp dữ liệu phiên mã và chú thích chức năng unigene
(1) Phân tích SSR, dự đoán CDS và cấu trúc gen sẽ được hình thành trước.
(2) Việc định lượng biểu hiện unigene trong mỗi mẫu sẽ được thực hiện.
(3) Các gen không đồng nhất được biểu hiện khác nhau giữa các mẫu (hoặc nhóm) sẽ được phát hiện dựa trên biểu hiện đồng nhất
(4) Phân cụm, chú thích chức năng và phân tích làm giàu của các gen bản địa được biểu hiện khác nhau sẽ được thực hiện
-
Trình tự dài không mã hóa-Illumina
RNA không mã hóa dài (lncRNA) là một loại phân tử RNA có chiều dài vượt quá 200 nt, được đặc trưng bởi tiềm năng mã hóa cực thấp.LncRNA, với tư cách là thành viên chính trong các RNA không mã hóa, chủ yếu được tìm thấy trong nhân và huyết tương.Sự phát triển trong công nghệ giải trình tự và tin sinh học cho phép xác định nhiều lncRNA mới và liên kết chúng với các chức năng sinh học.Bằng chứng tích lũy cho thấy lncRNA có liên quan rộng rãi đến việc điều hòa biểu sinh, điều hòa phiên mã và điều hòa sau phiên mã.
-
Trình tự RNA nhỏ-Illumina
RNA nhỏ dùng để chỉ một nhóm phân tử RNA không mã hóa thường có chiều dài dưới 200nt, bao gồm micro RNA (miRNA), RNA can thiệp nhỏ (siRNA) và RNA tương tác piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) là một loại RNA nhỏ nội sinh có chiều dài khoảng 20-24nt, đóng nhiều vai trò điều tiết quan trọng trong tế bào.miRNA tham gia vào nhiều quá trình sống biểu hiện biểu hiện cụ thể của mô - cụ thể và giai đoạn - và được bảo tồn cao ở các loài khác nhau.
-
giải trình tự CircRNA-Illumina
CircRNA (RNA vòng) là một loại phân tử RNA không mã hóa, có đầu 5′ ở đầu và đuôi poly(A) có đầu 3′.CircRNA thực hiện cấu trúc vòng bằng liên kết cộng hóa trị, trạng thái chống lại quá trình tiêu hóa exonuclease RNA.CircRNA đóng vai trò quan trọng trong sự sinh trưởng, phát triển của sinh vật và khả năng chống chịu của chúng với môi trường bên ngoài.
CircRNA có nhiều chức năng, có thể liên kết cạnh tranh với miRNA, phát huy chức năng điều hòa của ceRNA, điều hòa biểu hiện gen.Trong những năm gần đây, người ta cũng phát hiện ra rằng nó có liên quan chặt chẽ đến sự xuất hiện và phát triển của bệnh tật, đồng thời có triển vọng ứng dụng lớn theo hướng các dấu hiệu chẩn đoán bệnh, v.v.
