-
Phân tích hiệp hội trên toàn bộ bộ gen
Nghiên cứu kết hợp trên toàn bộ bộ gen (GWAS) nhằm mục đích xác định các biến thể di truyền (kiểu gen) liên quan đến các đặc điểm cụ thể (kiểu hình).Nghiên cứu của GWAS điều tra các dấu hiệu di truyền trên toàn bộ bộ gen của một số lượng lớn cá thể và dự đoán mối liên hệ giữa kiểu gen-kiểu hình bằng phân tích thống kê ở cấp độ quần thể.Nó đã được áp dụng rộng rãi trong nghiên cứu về bệnh tật ở người và khai thác gen chức năng trên các đặc điểm phức tạp của động vật hoặc thực vật.
-
Trình tự RNA đơn nhân
Sự tiến bộ trong kỹ thuật thu thập tế bào đơn lẻ và kỹ thuật xây dựng thư viện riêng lẻ kết hợp với giải trình tự thông lượng cao cho phép nghiên cứu biểu hiện gen trên cơ sở từng tế bào.Nó cho phép phân tích hệ thống sâu hơn và đầy đủ hơn trên các quần thể tế bào phức tạp, trong đó nó tránh được phần lớn việc che giấu tính không đồng nhất của chúng bằng cách lấy trung bình của tất cả các tế bào.
Tuy nhiên, một số tế bào không phù hợp để tạo thành huyền phù đơn tế bào, vì vậy cần có các phương pháp chuẩn bị mẫu khác – tách nhân từ mô, nghĩa là nhân được chiết xuất trực tiếp từ mô hoặc tế bào và chuẩn bị thành huyền phù đơn nhân cho đơn trình tự tế bào.
BMK cung cấp dịch vụ giải trình tự RNA đơn bào dựa trên 10× Genomics ChromiumTM.Dịch vụ này đã được sử dụng rộng rãi trong các nghiên cứu về các nghiên cứu liên quan đến bệnh tật, chẳng hạn như sự biệt hóa tế bào miễn dịch, sự không đồng nhất của khối u, sự phát triển của mô, v.v.
Chip phiên mã không gian: 10× Genomics
Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
-
Trình tự bộ gen toàn bộ thực vật/động vật
Sắp xếp lại toàn bộ bộ gen, còn được gọi là WGS, cho phép tiết lộ cả các đột biến phổ biến và hiếm trên toàn bộ bộ gen bao gồm Đa hình Nucleotide đơn (SNP), Xóa chèn (InDel), Biến thể cấu trúc (SV) và Biến thể số lượng bản sao (CNV) ).RAT chiếm một phần lớn hơn trong cơ sở biến thể so với SNP và có tác động lớn hơn đến bộ gen, điều này có ảnh hưởng đáng kể đến các sinh vật sống.Việc đọc lại trình tự dài cho phép xác định chính xác hơn các đoạn lớn và các biến thể phức tạp bởi vì các lần đọc dài giúp việc di chuyển nhiễm sắc thể qua các vùng phức tạp như lặp lại song song, vùng giàu GC/AT và vùng siêu biến đổi dễ dàng hơn nhiều.
Nền tảng: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Bộ sao chép không gian BMKMANU S1000
Tổ chức không gian của các tế bào đóng vai trò quan trọng trong các quá trình sinh học khác nhau, chẳng hạn như xâm nhập miễn dịch, phát triển phôi, v.v. Giải trình tự phiên mã không gian, biểu thị biểu hiện gen trong khi lưu giữ thông tin về vị trí không gian, đã cung cấp những hiểu biết sâu sắc về kiến trúc mô ở cấp độ phiên mã.Với sự phát triển của công nghệ, hình thái mô cực kỳ rõ ràng và sự khác biệt về cấu trúc thực sự của biểu hiện phân tử không gian cần được nghiên cứu với độ phân giải cao hơn.BMKGENE cung cấp dịch vụ giải trình tự phiên mã không gian toàn diện, một lần từ các mẫu đến thông tin chi tiết về sinh học.
Các công nghệ phiên mã không gian đã trao quyền cho các quan điểm mới trong lĩnh vực nghiên cứu đa dạng bằng cách giải quyết hồ sơ biểu hiện gen với nội dung không gian trong các mẫu không đồng nhất.
Chip phiên mã không gian: BMKMANU S1000
Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
-
Bản sao không gian 10x Genomics Visium
Visium Spatial Gene Expression là một công nghệ giải trình tự phiên mã không gian chủ đạo để phân loại mô dựa trên tổng số mRNA.Lập bản đồ toàn bộ bảng điểm với bối cảnh hình thái để khám phá những hiểu biết mới về sự phát triển bình thường, bệnh lý bệnh và nghiên cứu tịnh tiến lâm sàng.BMKGENE cung cấp dịch vụ giải trình tự phiên mã không gian toàn diện, một lần từ các mẫu đến thông tin chi tiết về sinh học.
Các công nghệ phiên mã không gian trao quyền cho các quan điểm mới trong lĩnh vực nghiên cứu đa dạng bằng cách giải quyết hồ sơ biểu hiện gen với nội dung không gian trong các mẫu không đồng nhất.
Chip phiên mã không gian: 10x Genomics Visium
Nền tảng:Illumina NovaSeq 6000
-
Trình tự mRNA có độ dài đầy đủ-Nanopore
Giải trình tự RNA là một công cụ vô giá để phân tích phiên mã toàn diện.Không còn nghi ngờ gì nữa, trình tự đọc ngắn truyền thống đã đạt được nhiều bước phát triển quan trọng ở đây.Tuy nhiên, nó thường gặp phải những hạn chế trong nhận dạng, định lượng, sai lệch PCR có độ dài đầy đủ.
Giải trình tự nanopore tự phân biệt với các nền tảng giải trình tự khác, ở chỗ các nucleotide được đọc trực tiếp mà không cần tổng hợp DNA và tạo ra thời gian đọc dài ở hàng chục kilobase.Điều này cho phép khả năng đọc trực tiếp vượt qua các bản ghi có độ dài đầy đủ và giải quyết các thách thức trong các nghiên cứu ở cấp độ đồng dạng.
Nền tảng：Nanopore PromethION
Thư viện:cDNA-PCR
-
Trình tự mRNA có độ dài đầy đủ -PacBio
De novotrình tự phiên mã đầy đủ độ dài, còn được gọi làDe novoIso-Seq tận dụng lợi thế của trình sắp xếp chuỗi PacBio về độ dài đọc, cho phép giải trình tự các phân tử cDNA có độ dài đầy đủ mà không bị gián đoạn.Điều này hoàn toàn tránh được bất kỳ lỗi nào được tạo ra trong các bước lắp ráp bản phiên mã và xây dựng các bộ unigene với độ phân giải ở mức đồng dạng.Bộ unigene này cung cấp thông tin di truyền mạnh mẽ dưới dạng “bộ gen tham chiếu” ở cấp độ phiên mã.Ngoài ra, kết hợp với dữ liệu giải trình tự thế hệ tiếp theo, dịch vụ này cho phép định lượng chính xác biểu thức ở cấp độ đồng dạng.
Nền tảng： PacBio Phần tiếp theo IIThư viện: Thư viện chuông SMRT -
Giải trình tự mRNA của sinh vật nhân chuẩn-Illumina
trình tự mRNA cho phép định hình tất cả các mRNA được sao chép từ các tế bào trong các điều kiện cụ thể.Đây là một công nghệ mạnh mẽ để tiết lộ hồ sơ biểu hiện gen, cấu trúc gen và cơ chế phân tử của các quá trình sinh học nhất định.Cho đến nay, giải trình tự mRNA đã được sử dụng rộng rãi trong nghiên cứu cơ bản, chẩn đoán lâm sàng, phát triển thuốc, v.v.
Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
-
Giải trình tự mRNA không dựa trên tham chiếu-Illumina
giải trình tự mRNA áp dụng kỹ thuật giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) để nắm bắt dạng RNA thông tin (mRNA) Eukaryote ở giai đoạn cụ thể mà một số chức năng đặc biệt đang kích hoạt.Bản phiên mã dài nhất được ghép nối được gọi là 'Unigene' và được sử dụng làm trình tự tham chiếu cho phân tích tiếp theo, đây là một phương tiện hiệu quả để nghiên cứu cơ chế phân tử và mạng lưới điều hòa của loài mà không cần tham chiếu.
Sau khi lắp ráp dữ liệu phiên mã và chú thích chức năng unigene
(1)Phân tích SSR, dự đoán CDS và cấu trúc gen sẽ được định hình sẵn.
(2) Định lượng biểu hiện unigene trong mỗi mẫu sẽ được thực hiện.
(3) Các gen gốc được biểu hiện khác nhau giữa các mẫu (hoặc nhóm) sẽ được phát hiện dựa trên biểu hiện gen gốc
(4) Việc phân cụm, chú thích chức năng và phân tích làm giàu của những người bản địa được thể hiện khác nhau sẽ được thực hiện
-
Trình tự dài không mã hóa-Illumina
RNA dài không mã hóa (lncRNA) là một loại phân tử RNA có chiều dài vượt quá 200 nt, được đặc trưng bởi tiềm năng mã hóa cực thấp.LncRNA, với tư cách là thành viên chủ chốt trong RNA không mã hóa, chủ yếu được tìm thấy trong nhân và huyết tương.Sự phát triển trong công nghệ giải trình tự và tin sinh học cho phép xác định nhiều lncRNA mới và liên kết chúng với các chức năng sinh học.Bằng chứng tích lũy cho thấy lncRNA có liên quan rộng rãi đến quy định biểu sinh, quy định phiên mã và quy định sau phiên mã.
