Phân tích mRNA của sinh vật nhân chuẩn (có tài liệu tham khảo)
Dựa trên thông tin chú thích và trình tự bộ gen đã biết, một thế hệ dữ liệu giải trình tự thông lượng cao (RNA-Seq) mới được sử dụng làm đầu vào và các vị trí phiên mã mới (gen mới) cũng như các sự kiện ghép nối biến đổi mới được xác định.đánh giá chất lượng dữ liệu theo trình tự;dữ liệu giải trình tự và căn chỉnh trình tự của bộ gen tham chiếu đã chọn, xác định ranh giới exon/intron, phân tích sự ghép nối biến thể gen, khám phá các vùng gen và bản phiên mã mới, xác định vị trí SNP của vùng phiên mã, ranh giới giữa 3' và 5 ' các gen cũng như chú thích chức năng và phân tích làm giàu của các mẫu (nhóm) khác nhau.
RNA không mã hóa dài
RNA không mã hóa dài (lncRNA) là loại bản phiên mã có chiều dài hơn 200 nt, không có khả năng mã hóa protein.Bằng chứng tích lũy cho thấy hầu hết các lncRNA rất có khả năng hoạt động.Các công nghệ giải trình tự thông lượng cao và các công cụ phân tích tin sinh học cho phép chúng tôi tiết lộ trình tự lncRNA và thông tin định vị hiệu quả hơn, đồng thời giúp chúng tôi khám phá các lncRNA có chức năng điều tiết quan trọng.BMKCloud tự hào cung cấp cho khách hàng nền tảng phân tích trình tự lncRNA để đạt được phân tích lncRNA nhanh chóng, đáng tin cậy và linh hoạt.
Trình tự khuếch đại 16S/18S/ITS
Nền tảng phân tích đa dạng vi sinh vật được phát triển với nhiều năm kinh nghiệm trong phân tích dự án đa dạng vi sinh vật, bao gồm phân tích cơ bản được tiêu chuẩn hóa và phân tích cá nhân hóa: phân tích cơ bản bao gồm nội dung phân tích chính thống của nghiên cứu vi sinh vật hiện tại, nội dung phân tích phong phú và toàn diện và kết quả phân tích được trình bày dưới dạng báo cáo dự án;Nội dung phân tích được cá nhân hóa rất đa dạng.Các mẫu có thể được chọn và các tham số có thể được đặt linh hoạt theo báo cáo phân tích cơ bản và mục đích nghiên cứu để hiện thực hóa các yêu cầu được cá nhân hóa.Hệ điều hành Windows đơn giản và nhanh chóng.
Metagenomics súng ngắn (NGS)
Dữ liệu metagenomic được sử dụng để phân tích các vật liệu gen hỗn hợp được chiết xuất từ các mẫu môi trường, cung cấp thông tin chi tiết về sự đa dạng và phong phú của loài, cấu trúc quần thể, mối quan hệ phát sinh gen, gen chức năng và mạng lưới tương quan với các yếu tố môi trường.
NGS-WGS(Illumina/BGI)
Một quy trình phân tích tích hợp được phát triển cho các chuyên gia nghiên cứu không có kiến thức tin sinh học trước đó và chạy trên máy chủ hiệu suất cao.Nó tạo điều kiện hoàn thành nhanh chóng các nhiệm vụ như kiểm soát chất lượng dữ liệu, căn chỉnh trình tự, phát hiện biến thể SNP/InDel/SV, chú thích và gen đột biến.
GWAS
Sử dụng các phương pháp thống kê cụ thể, phân tích GWAS nhằm mục đích khám phá các biến thể nucleotide trên toàn bộ gen có liên quan đến sự khác biệt về kiểu hình.Nó đóng một vai trò quan trọng trong việc khám phá các gen chức năng liên quan đến các bệnh phức tạp ở người và các đặc điểm phức tạp ở thực vật và động vật.
BSA
Nền tảng phân tích tích hợp cung cấp giao diện thân thiện với người dùng để phân tích tính đa dạng được chuẩn hóa và cá nhân hóa.Phân tích BSA liên quan đến việc tập hợp các cá thể có đặc điểm kiểu hình cực đoan từ một quần thể tách biệt.Bằng cách so sánh các locus khác biệt giữa các mẫu gộp, phương pháp này nhanh chóng xác định các dấu hiệu phân tử liên kết chặt chẽ với gen mục tiêu.Được sử dụng rộng rãi trong lập bản đồ di truyền của thực vật và động vật, nó là một công cụ có giá trị để nhân giống và định vị gen được hỗ trợ bằng điểm đánh dấu.
Di truyền học tiến hóa
Đó là quy trình phân tích tích hợp được thiết kế dành cho các chuyên gia nghiên cứu có chuyên môn hạn chế về tin sinh học.Tận dụng kinh nghiệm sâu rộng của BMKGENE trong các dự án tiến hóa gen, nền tảng này chạy trên các máy chủ hiệu suất cao, đảm bảo thực hiện nhanh chóng và chính xác các phân tích được cá nhân hóa.Những nhiệm vụ này bao gồm các nhiệm vụ như xây dựng cây phát sinh gen, phân tích mất cân bằng liên kết, đánh giá đa dạng di truyền, nhận dạng quét chọn lọc, phân tích mối quan hệ họ hàng, phân tích thành phần chính và mô tả đặc điểm cấu trúc quần thể.
