Naglasci
Na ovaj dvosatni webinar velika nam je čast što smo pozvali šest stručnjaka u području genomike usjeva.Naši govornici dat će detaljnu interpretaciju dviju genomskih studija raži, koje su nedavno objavljene naNature Genetics:
1. Sklapanje genoma na razini kromosoma pruža uvid u biologiju, evoluciju i agronomski potencijal raži
2. Visokokvalitetni sklop genoma naglašava genomske karakteristike raži i agronomski važne gene
Također, drago nam je što imamo starijeg istraživača i razvojnog znanstvenika Biomarker Technologies koji će podijeliti svoje iskustvo u de novo sklapanju genoma.
Dnevni red
09:00 CET
Pozdravne riječi
Zheng Hong-kun
Osnivač i izvršni direktor Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Predsjednik Fakulteta za napredne poljoprivredne znanosti Pekinškog sveučilišta
09:15 ujutro
Poboljšanje poboljšanja raži, tritikalea i pšenice korištenjem visokokvalitetne referentne sekvence genoma
U ovom webinaru, prof. Wang nam je dao sveukupne novosti o trenutnom statusu istraživanja genoma triticeae i pokazao uspjeh i napredak dva izvanredna rada na studijama genoma raži, koji su nedavno objavljeni na Nature Genetics i predstavljaju cijelo istraživanje skupine koje vode i pridonose radovima.
09:25 ujutro
Genomika žitarica @ IPK Gatersleben
Žitne trave iz plemena Triticeae bile su glavni izvor hrane u umjerenim regijama, koje su se dugo smatrale žarišnom točkom u poboljšanju usjeva i uzgoju.Među svim kultiviranim vrstama, ovo je pleme poznato po svojim iznimno složenim genomskim značajkama uključujući velike veličine genoma, visok sadržaj TE, poliploidiju, itd. U ovoj sesiji, prof. Nils Stein dao nam je opći uvod o IPK Gaterslebenu i trenutnom statusu žitarica genomsko istraživanje@IPK Gatersleben.
09:35 ujutro
Sklapanje genoma na razini kromosoma pruža uvid u biologiju raži, evoluciju i agronomski potencijal
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institut za biljnu genetiku i istraživanje planova usjeva (IPK)Raž (Secale cereale L.) iznimno je otporna na klimatske uvjete žitarica, koja se intenzivno koristi za proizvodnju poboljšanih sorti pšenice introgresivnom hibridizacijom, a posjeduje cijeli repertoar gena potrebnih za omogućavanje uzgoja hibrida.Raž je alogamna i tek nedavno udomaćena, što kultiviranoj raži daje pristup raznolikom divljem genskom fondu koji se može iskoristiti.Kako bismo dodatno poboljšali agronomski potencijal raži, proizveli smo označeni sklop genoma raži od 7,9 Mbp na razini kromosoma i opsežno potvrdili njegovu kvalitetu korištenjem skupa molekularnih genetskih izvora.Demonstriramo primjene ovog izvora u širokom rasponu istraživanja.Predstavljamo nalaze o nepotpunoj genetskoj izolaciji kultivirane raži od divljih srodnika, mehanizmima evolucije strukture genoma, otpornosti na patogene, toleranciji na niske temperature, sustavima kontrole plodnosti za uzgoj hibrida i prednostima prinosa introgresije raži i pšenice.
10:05 sati
Visokokvalitetni sklop genoma ističe genomske karakteristike raži i agronomski važne gene
Raž je vrijedan prehrambeni i krmni usjev, važan genetski resurs za poboljšanje pšenice i tritikalea te nezamjenjiv materijal za učinkovita komparativna genomska istraživanja trava.Ovdje smo sekvencirali genom Weining raži, elitne kineske sorte raži.Skupljeni kontigi (7,74 Gb) činili su 98,47% procijenjene veličine genoma (7,86 Gb), s 93,67% kontiga (7,25 Gb) dodijeljenih sedam kromosoma.Ponavljajući elementi činili su 90,31% sastavljenog genoma.U usporedbi s prethodno sekvenciranim genomima Triticeae, retrotranspozoni Daniela, Sumaya i Sumana pokazali su snažnu ekspanziju u raži.Daljnje analize Weiningovog sklopa bacaju novo svjetlo na umnožavanje gena na cijelom genomu i njihov utjecaj na gene za biosintezu škroba, fizičke organizacije složenih prolaminskih lokusa, značajke genske ekspresije koje leže u osnovi osobine ranog rasta i navodne kromosomske regije i lokuse u raži povezane s pripitomljavanjem.Ova sekvenca genoma obećava da će ubrzati genomiku i studije uzgoja raži i srodnih žitarica.
10:35 ujutro
Izazovi, rješenja i budućnost za de novo sklapanje genoma
Genom visoke kvalitete temelj je genomskog proučavanja.Iako je brzi razvoj sekvenciranja i algoritama omogućio mnogo jednostavnije i učinkovitije sklapanje genoma, zahtjevi u točnosti i potpunosti sklapanja također rastu s produbljivanjem istraživačkih ciljeva.U ovom govoru raspravljat ću o trenutno popularnim tehnologijama u sastavljanju genoma s nekoliko uspješnih slučajeva i baciti pogled na budući razvoj.
Vrijeme objave: 8. siječnja 2022