Duga nekodirajuća sekvenciranje-ilumina
Prednosti usluge
●Zajednička analiza mRNA i lncRNA: Kombinirajući kvantifikaciju transkripata mRNA s proučavanjem lncRNA i njihovih ciljeva, moguće je dobiti detaljni pregled regulatornog mehanizma koji je na temelju staničnog odgovora.
●Opsežna stručnost: Naš tim donosi mnoštvo iskustava svakom projektu, s evidencijom obrade preko 23 000 uzoraka na BMK koji obuhvaća različite vrste uzoraka i lncRNA projekti.
●Rigorozna kontrola kvalitete: Provodimo temeljne kontrolne točke u svim fazama, od uzoraka i pripreme knjižnice do sekvenciranja i bioinformatike. Ovo pažljivo praćenje osigurava davanje dosljedno visokokvalitetnih rezultata.
●Podrška nakon prodaje: Naša predanost proteže se izvan završetka projekta s 3-mjesečnom razdoblju nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i Q&A sjednice za rješavanje bilo kakvih upita vezanih za rezultate.
Uzorak zahtjeva i isporuka
| Knjižnica | Platforma | Preporučeni podaci | Qc |
| rRNA iscrpljena biblioteka usmjerene | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nukleotidi:
| Conc. (Ng/μl) | Količina (μg) | Čistoća | Integritet |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ograničena ili bez kontaminacije proteina ili DNA prikazana na gelu. | Rin≥6.0; 5,0≥28S/18S≥1,0; Ograničeno ili nema osnovne visine |
● Biljke:
Korijen, stabljika ili latica: 450 mg
List ili sjeme: 300 mg
Voće: 1,2 g
● životinja:
Srce ili crijevo: 450 mg
Viscera ili mozak: 240 mg
Mišić: 600 mg
Kosti, kosa ili koža: 1,5 g
● Arthropods:
Insekti: 9G
Crustacea: 450 mg
● Cijela krv:2 cijevi
● Stanice: 106 stanice
● Serum i plazma: 6 ml
Preporučena isporuka uzorka
Kontejner: 2 ml cijev za centrifugu (limena folija se ne preporučuje)
Oznaka uzoraka: grupa+replicirati npr. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pošiljka:
1. Suhi led: Uzorci se moraju spakirati u vrećice i zakopani u suhi led.
2. RNASTable Epruvete: Uzorci RNA mogu se sušiti u cijevi za stabilizaciju RNA (npr. RNastable®) i isporučuju se na sobnoj temperaturi.
Servisni rad protoka
Eksperiment dizajn
Dostava uzorka
Vađenje RNA
Konstrukcija knjižnice
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Bioinformatika
Analiza diferencijalne ekspresije gena (DEGS)
Kvantifikacija ekspresije lncRNA - grupiranje
Obogaćivanje ciljanih gena lncRNA
Analiza položaja zajedničke mRNA i lncRNA - Circos crtež (srednji krug je mRNA, a unutarnji cikrorlce je lncRNA)
Istražite napredovanje koje je omogućilo BMKGENE -ove službe za vađenje LNCRNA kroz kuriranu zbirku publikacija.
Ji, H. i sur. (2020) 'Identifikacija, funkcionalno predviđanje i ključna LNCRNA Provjera LNCRNA povezanih s hladnim stresom u jetri štakora', Znanstvena izvješća 2020. 10: 1, 10 (1), str. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. i sur. (2021) 'Integrativna transkriptomska analiza otkriva imunološki mehanizam za soj CYHV-3 rezistentnog na uobičajeni šaran', Frontiers in Immunology, 12, str. 687151. Doi: 10.3389/fimmu.2021.687151/Bibtex.
Wang, XJ i sur. (2022) 'Multi-Omics integracija temeljena na prioritetima konkurentskih mreža za regulaciju RNA u raku pluća u malim stanicama: molekularne karakteristike i kandidata za lijekove', Frontiers in Oncology, 12, str. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/Bibtex.
Xiao, L. i sur. (2020) 'Genetska disekcija mreže gena koekspresije koja je u osnovi fotosinteze u Populusu', Plant Biotechnology Journal, 18 (4), str. 1015–1026. doi: 10.1111/pbi.13270.
Zheng, H. i sur. (2022) 'Globalna regulatorna mreža za disreguliranu ekspresiju gena i nenormalnu metaboličku signalizaciju u imunološkim stanicama u mikrookolju Gravesove bolesti i Hashimotovog tiroiditisa', Frontiers in Immunology, 13, str. 879824. Doi: 10.3389/fimmu.2022.879824/Bibtex.
