-
Jednojezgreno sekvenciranje RNA
Napredak u hvatanju pojedinačnih stanica i tehnici konstrukcije pojedinačne biblioteke u kombinaciji s visokoproduktivnim sekvenciranjem omogućuje studije ekspresije gena na bazi stanica po stanica.Omogućuje dublju i cjelovitu analizu sustava na složenim staničnim populacijama, pri čemu se u velikoj mjeri izbjegava maskiranje njihove heterogenosti uzimanjem prosjeka svih stanica.
Međutim, neke stanice nisu prikladne za izradu jednostanične suspenzije, pa su potrebne druge metode pripreme uzorka – ekstrakcija jezgre iz tkiva, odnosno jezgra se izravno ekstrahira iz tkiva ili stanice i priprema u suspenziju jedne jezgre za jednostruku sekvenciranje stanica.
BMK pruža 10× Genomics ChromiumTM uslugu sekvenciranja RNK jedne stanice.Ova se usluga široko koristi u studijama o studijama vezanim uz bolesti, kao što su diferencijacija imunoloških stanica, heterogenost tumora, razvoj tkiva itd.
Čip prostornog transkriptoma: 10× Genomics
Platforma: Illumina NovaSeq platforma
-
BMKMANU S1000 prostorni transkriptom
Prostorna transkriptomika prednjači u znanstvenim inovacijama, osnažujući istraživače da istražuju zamršene obrasce ekspresije gena unutar tkiva, a istovremeno čuvaju njihov prostorni kontekst.Usred raznih platformi, BMKGene je razvio BMKManu S1000 čip za prostorni transkriptom, koji se može pohvalitipoboljšana razlučivostod 5µM, dosežući subcelularni raspon i omogućavajućivišerazinske postavke rezolucije.Čip S1000, koji ima otprilike 2 milijuna točaka, koristi mikrojažice preslojene zrncima napunjenim prostorno barkodiranim sondama za hvatanje.Knjižnica cDNA, obogaćena prostornim bar kodovima, priprema se iz S1000 čipa i zatim sekvencira na platformi Illumina NovaSeq.Kombinacija prostorno barkodiranih uzoraka i UMI-ja osigurava točnost i specifičnost generiranih podataka.Jedinstveni atribut BMKManu S1000 čipa leži u njegovoj svestranosti, nudeći višerazinske postavke razlučivosti koje se mogu fino prilagoditi različitim tkivima i razinama detalja.Ova prilagodljivost pozicionira čip kao izvanredan izbor za različite studije prostorne transkriptomije, osiguravajući precizno prostorno grupiranje uz minimalan šum.
Korištenjem BMKManu S1000 čipa i drugih tehnologija prostorne transkriptomije, istraživači mogu steći bolje razumijevanje prostorne organizacije stanica i složenih molekularnih interakcija koje se događaju unutar tkiva, pružajući neprocjenjiv uvid u mehanizme koji leže u osnovi bioloških procesa u širokom rasponu polja, uključujući onkologija, neuroznanost, razvojna biologija, imunologija i botaničke studije.
Platforma: BMKManu S1000 čip i Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium prostorni transkriptom
Prostorna transkriptomika vrhunska je tehnologija koja omogućuje istraživačima da istražuju obrasce ekspresije gena unutar tkiva uz očuvanje njihovog prostornog konteksta.Jedna moćna platforma u ovoj domeni je 10x Genomics Visium u kombinaciji s Illumina sekvenciranjem.Princip 10X Visiuma leži na specijaliziranom čipu s određenim područjem snimanja gdje se postavljaju dijelovi tkiva.Ovo područje snimanja sadrži točke s crtičnim kodom, od kojih svaka odgovara jedinstvenoj prostornoj lokaciji unutar tkiva.Uhvaćene molekule RNA iz tkiva zatim se obilježavaju jedinstvenim molekularnim identifikatorima (UMI) tijekom procesa obrnute transkripcije.Ove točke s crtičnim kodom i UMI omogućuju precizno prostorno mapiranje i kvantifikaciju ekspresije gena u rezoluciji jedne stanice.Kombinacija prostorno barkodiranih uzoraka i UMI-ja osigurava točnost i specifičnost generiranih podataka.Korištenjem ove tehnologije Spatial Transcriptomics, istraživači mogu steći dublje razumijevanje prostorne organizacije stanica i složenih molekularnih interakcija koje se događaju unutar tkiva, nudeći neprocjenjiv uvid u mehanizme koji leže u osnovi bioloških procesa u više područja, uključujući onkologiju, neuroznanost, razvojnu biologiju, imunologiju , i botaničke studije.
Platforma: 10X Genomics Visium i Illumina NovaSeq
