Sekvenciranje imunoprecipitacijom kromatina (ChIP-seq)
Prednosti usluge
●Napredna bioinformatička analiza i sveobuhvatna anotacija:Koristimo više baza podataka za funkcionalno označavanje gena povezanih s regijama vezanja proteina i DNK, pružajući uvid u stanične i molekularne procese koji su u osnovi interakcije.
●Postprodajna podrška:Naša predanost proteže se i nakon završetka projekta, uz 3-mjesečno postprodajno razdoblje. Tijekom tog vremena nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i sesije s pitanjima i odgovorima kako bismo odgovorili na sva pitanja vezana uz rezultate.
●Opsežno iskustvo:S iskustvom u uspješnom završetku brojnih ChIP-Seq projekata, naša tvrtka donosi više od desetljeća stručnosti. Naš visokokvalificirani analitički tim, u kombinaciji s opsežnom podrškom u pružanju sadržaja i postprodajnom podrškom, osigurava uspjeh vaših projekata.
● Stroga kontrola kvaliteteU svim fazama primjenjujemo ključne kontrolne točke, od pripreme uzoraka i biblioteke do sekvenciranja i bioinformatike. Ovo pedantno praćenje osigurava dosljedno visokokvalitetne rezultate.
Specifikacije usluge
| Knjižnica | Strategija sekvenciranja | Preporučeni izlaz podataka | Kontrola kvalitete |
| Pročišćena DNA nakon imunoprecipitacije | Illumina PE150 | 10 GB | Q30≥85% |
Zahtjevi za uzorak
Ukupna količina: ≥10 ng
Raspodjela veličine fragmenata: 100-750 bps
Tijek rada usluge
Dostava uzorka
Izgradnja knjižnice
Sekvenciranje
Analiza podataka
Postprodajne usluge
Uključuje sljedeću analizu:
● Kontrola kvalitete sirovih podataka
● Određivanje vršnih vrijednosti na temelju mapiranja na referentni genom
● Označavanje gena povezanih s vrhom
● Analiza motiva: identifikacija mjesta vezanja transkripcijskih faktora (TFBS)
● Analiza diferencijalnih vrhova i označavanje
Evaluacija obogaćivanja u blizini mjesta početka transkripcije (TSS)
Raspodjela CHIP vrhova na razini cijelog genoma
Klasifikacija vršnih područja
Funkcionalno obogaćivanje gena povezanih s vrhom (KEGG)
