条形 Banner-03

Proizvodi

Metagenomsko sekvenciranje -ngs

图片 62

Metagenom je skup ukupnog genetskog materijala miješane zajednice organizama, poput okolišnih i ljudskih metagenoma. Sadrži genome i mikroorganizama koji se mogu kultivirati i nekultivatativni. Metagenomsko sekvenciranje sačmarice s NGS -om omogućava proučavanje ovih zamršenih genomskih pejzaža ugrađenih u uzorke okoliša pružajući više od taksonomskog profiliranja, dajući i granularne uvide u raznolikost vrsta, dinamiku obilja i složene populacijske strukture. Osim taksonomskih studija, metagenomika sačmarice također nudi perspektivu funkcionalne genomike, omogućujući istraživanje kodiranih gena i njihove pretpostavljene uloge u ekološkim procesima. Konačno, uspostavljanje korelacijskih mreža između genetskih elemenata i okolišnih čimbenika doprinosi holističkom razumijevanju zamršene interakcije mikrobnih zajednica i njihove ekološke pozadine. Zaključno, metagenomsko sekvenciranje stoji kao ključni instrument za otkrivanje genomskih zamršenosti različitih mikrobnih zajednica, osvjetljavajući višestruke odnose između genetike i ekologije unutar ovih složenih ekosustava.

Platforme: Illumina Novaseq i DNBSEQ-T7


Pojedinosti o usluzi

Bioinformatika

Demo rezultati

Izdvojene publikacije

Prednosti usluge

Izolacija i metoda bez uzgoja za profiliranje mikrobne zajednice: Omogućavanje sekvenciranja genetskog materijala iz neobradivih organizama.

Visoka rezolucija: Otkrivanje vrsta s malim obiljem u uzorcima okoliša.

Sveobuhvatna analiza bioinformatike:Usredotočen ne samo na taksonomsku raznolikost, već i na funkcionalnu raznolikost zajednice.

Opsežno iskustvo:Uz uspješno zatvaranje višestrukih metagenomijskih projekata u različitim istraživačkim domenama i obrade preko 200 000 uzoraka, naš tim donosi mnoštvo iskustava svakom projektu.

Specifikacije usluge

Platforma za sekvenciranje

Strategija sekvenciranja

Podaci preporučeni

Kontrola kvalitete

Illumina Novaseq ili DNBSEQ-T7

PE150

6-20 GB

Q30≥85%

Zahtjevi za uslugu

Koncentracija (ng/µL)

Ukupni iznos (NG)

Volumen (µl)

≥1

≥30

≥20

● Tlo/mulj: 2-3G
● Crijevni sadržaj-životinja: 0,5-2G
● Insect Crijevni sadržaj: 0,1-0,25G
● Površina biljaka (obogaćena sedimenta): 0,5-1G
● Fermentacijska juha obogaćena sedimentom): 0,2-0,5G
● Feeces (velike životinje): 0,5-2G
● Feeces (miš): 3-5Grains
● Tekućina za lavage od plućnog alveolara: filtrirani papir
● Vaginalni bris: 5-6 brisa
● Koža/genitalni bris/slina/oralno meko tkivo/faringealni bris/rektalni bris: 2-3 brisa
● Površinski mikroorganizam: 5-6 brisa
● Waterbody/Air/Biofilm: Filter Papir
● Endofiti: 2-3G
● Zubna ploča: 0,5-1G

Servisni rad protoka

Dostava uzorka

Dostava uzorka

Priprema knjižnice

Konstrukcija knjižnice

Sekvenciranje

Sekvenciranje

Analiza podataka

Analiza podataka

Nakon prodajnih usluga

Usluge nakon prodaje


  • Prethodno:
  • Sljedeći:

  • 流程图 贝贝第三版 -01

    Uključuje sljedeću analizu:

    ● Kontrola kvalitete sekvenciranja podataka

    ● Sastavljanje metagenoma i predviđanje gena

    ● Napomena gena

    ● Analiza taksonomske alfa raznolikosti

    ● Funkcionalna analiza zajednice: biološka funkcija, metabolička, otpornost na antibiotike

    ● Analiza i funkcionalne i taksonomske raznolikosti:

    Analiza beta raznolikosti

    Analiza među skupinama

    Analiza korelacije: između čimbenika okoliša i sastava i raznolikosti

    Funkcionalna analiza: rezistencija na antibiotike s karticama

    图片 63

    Diferencijalna analiza metaboličkih puteva KEGG -a: toplotna mapa značajnih putova

     

    图片 64

     Alfa raznolikost taksonomske distribucije: ACE indeks

    图片 65

     

    Beta raznolikost taksonomske distribucije: PCOA

    图片 66

    Istražite napredovanje koje je omogućilo BMKGENE -ove usluge sekvenciranja metagenoma s Illuminom kroz kuriranu zbirku publikacija.

    Hai, Q. i sur. (2023.) 'Metagenomska i metabolomska analiza promjena u crijevnom sadržaju duge pastrve (oncorhynchus mykiss) zaražena virusom zaraznih hematopoetskih nekroza na različitim temperaturama vode u kulturi',Granice u mikrobiologiji, 14, str. 1275649. Doi: 10.3389/fMICB.2023.1275649.

    Mao, C. i sur. (2023.) 'Mikrobne zajednice, geni otpornosti i otporni rizici u urbanim jezerima različitih trofičkih stanja: unutarnje veze i vanjski utjecaji',Časopis za napredak opasnih materijala, 9, str. 100233. Doi: 10.1016/j.hazadv.2023.100233.

    Su, M. i sur. (2022) 'Metagenomska analiza otkrila je razlike u sastavu i funkciji između tekućine povezanih i čvrsto povezanih mikroorganizama ovčjih rumena',Granice u mikrobiologiji, 13, str. 851567. Doi: 10.3389/fMICB.2022.851567.

    Yin, J. i sur. (2023.) 'Pretilo Ningxiang Microbiota izvedena iz svinjskog rewira metabolizam karnitina za promicanje taloženja mišićnih masnih kiselina kod mršavih dly svinja',Inovacija, 4 (5), str. 100486. Doi: 10.1016/j.xinn.2023.100486.

    Zhao, X. i sur. (2023.) 'Metagenomski uvid u potencijalne rizike reprezentativnih bio/ne-razgradljivih plastičnih i neplastičnih krhotina u gornjem i donjem toku ušća Haihe, Kina',Znanost o ukupnom okruženju, 887, str. 164026. Doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026.

    Nabavite citat

    Napišite svoju poruku ovdje i pošaljite nam je

    Pošaljite nam svoju poruku: