lncrna

Duge nekodirajuće RNA (lncRNA) su RNA dulje od 200 nukleotida s niskim potencijalom kodiranja, ali s kritičnim regulatornim funkcijama. BMKCloud lncRNA cjevovod dizajniran je za analizu biblioteka osiromašenih rRNA s visokokvalitetnim, dobro označenim referentnim genomom, analizom ekspresije lncRNA i mRNA zajedno. Nakon skraćivanja očitavanja i kontrole kvalitete, očitavanja se poravnavaju s referentnim genomom kako bi se sastavili transkripti, a naknadna analiza strukture gena otkriva alternativno spajanje i nove gene. Transkripti se identificiraju kao mRNA ili lncRNA, a analiza diferencijalne ekspresije identificira različito eksprimirane lncRNA, njihove ciljeve i različito eksprimirane gene (DEGS). I DEG i različito eksprimirani ciljevi lncRNA funkcionalno su označeni kako bi se pronašle obogaćene funkcionalne kategorije.