Акценти
В този двучасов уебинар за нас е голяма чест да поканим шестима експерти в областта на геномиката на културите.Нашите лектори ще дадат задълбочена интерпретация на две геномни проучвания на ръжта, които бяха публикувани наскоро наПриродна генетика:
1. Сглобяването на генома в хромозомен мащаб дава представа за биологията, еволюцията и агрономическия потенциал на ръжта
2. Висококачественият геномен комплект подчертава геномните характеристики на ръжта и агрономически важните гени
Освен това се радваме, че имаме старши научноизследователски и развойен специалист от Biomarker Technologies, който да сподели своя опит в сглобяването на генома de novo.
Дневен ред
09:00 CET
Поздравителни бележки
Джън Хонг-кун
Основател и главен изпълнителен директор на Biomarker Technologies
Дън Син-уанг
Президент, Училище за напреднали селскостопански науки към Пекинския университет
09:15 сутринта
Подобряване на подобряването на ръж, тритикале и пшеница чрез използване на висококачествена референтна геномна последователност
В този уебинар проф. Уанг ни даде цялостна актуална информация за текущото състояние на геномните изследвания на triticeae и демонстрира успеха и пробива на двете изключителни работи върху изследванията на генома на ръжта, които наскоро бяха публикувани в Nature Genetics и представят цялото изследване групи, водещи и допринасящи за работата.
09:25 сутринта
Геномика на зърнени култури @ IPK Gatersleben
Зърнените треви от племето Triticeae са били основен източник на храна в умерените региони, които отдавна са смятани за гореща точка в подобряването и развъждането на културите.Сред всички култивирани видове, това племе е известно със своите изключително сложни геномни характеристики, включително големи размери на генома, високо съдържание на TE, полиплоидия и т.н. В тази сесия проф. Нилс Щайн ни даде цялостно въведение за IPK Gatersleben и текущото състояние на зърнените култури геномни изследвания@IPK Gatersleben.
09:35 сутринта
Сглобяването на генома в хромозомен мащаб дава представа за биологията, еволюцията и агрономическия потенциал на ръжта
Д-р М. Тимъти Рабанус-Уолъс, Институт по генетика на растенията и планове за изследване на културите Лайбниц (IPK)Ръжта (Secale cereale L.) е изключително устойчива на климата зърнена култура, използвана широко за производство на подобрени сортове пшеница чрез интрогресивна хибридизация и притежаваща целия репертоар от гени, необходими за позволяване на хибридно развъждане.Ръжта е алогамна и едва наскоро опитомена, което дава на култивираната ръж достъп до разнообразен и използваем див генофонд.За по-нататъшно подобряване на агрономическия потенциал на ръжта, ние създадохме анотирана сглобка в хромозомен мащаб от 7,9 Mbp генома на ръжта и широко валидирахме качеството му, използвайки набор от молекулярни генетични ресурси.Ние демонстрираме приложения на този ресурс с широк набор от изследвания.Представяме констатации за непълната генетична изолация на култивираната ръж от диви роднини, механизми на структурна еволюция на генома, устойчивост на патогени, толерантност към ниска температура, системи за контрол на плодовитостта за хибридно развъждане и ползите от добива на интрогресии ръж-пшеница.
10:05 сутринта
Висококачественият геномен комплект подчертава геномните характеристики на ръжта и агрономически важните гени
Ръжта е ценна хранителна и фуражна култура, важен генетичен ресурс за подобряване на пшеницата и тритикалето и незаменим материал за ефективни сравнителни геномни изследвания на треви.Тук секвенирахме генома на ръж Weining, елитен китайски сорт ръж.Сглобените контиги (7,74 Gb) представляват 98,47% от очаквания размер на генома (7,86 Gb), като 93,67% от контигите (7,25 Gb) са присвоени на седем хромозоми.Повтарящите се елементи представляват 90,31% от сглобения геном.В сравнение с предишни секвенирани геноми на Triticeae, ретротранспозоните на Daniela, Sumaya и Sumana показват силна експанзия в ръжта.По-нататъшните анализи на сглобяването на Weining хвърлят нова светлина върху дублиранията на гени в целия геном и тяхното въздействие върху гените за биосинтеза на нишесте, физическите организации на сложните проламинови локуси, характеристиките на генната експресия, лежащи в основата на ранната заглавна черта, и предполагаемите свързани с опитомяването хромозомни региони и локуси в ръжта.Тази последователност на генома обещава да ускори геномичните и размножителните изследвания на ръж и свързани зърнени култури.
10:35 сутринта
Предизвикателства, решения и бъдеще за сглобяването на генома de novo
Геномът с високо качество е в основата на геномното изследване.Въпреки че бързото развитие на секвенирането и алгоритъма даде възможност за много по-просто и по-ефективно сглобяване на генома, изискванията за точност и пълнота на сглобяване също се повишават със задълбочаването на изследователските цели.В тази лекция ще обсъдя настоящите популярни технологии в сглобяването на генома с няколко успешни случая и ще хвърля поглед върху бъдещото развитие.
Време на публикуване: 8 януари 2022 г