진핵생물 mRNA 서열분석-Illumina
장점
● 풍부한 경험: 세포 배양, 조직, 체액 등 다양한 샘플 유형을 포괄하는 200,000개 이상의 샘플이 BMK에서 처리되었으며 다양한 연구 분야를 포괄하는 7,000개 이상의 mRNA-Seq 프로젝트가 종료되었습니다.
● 엄격한 품질 관리 시스템: 고품질의 결과를 제공하기 위해 샘플 준비, 라이브러리 준비, 시퀀싱, 생물정보학 등 모든 단계의 핵심 품질 관리 지점을 면밀히 모니터링하고 있습니다.
● 다양한 연구 목표를 달성하기 위해 기능 주석 및 강화 연구에 사용할 수 있는 여러 데이터베이스.
● 애프터 서비스: 프로젝트 후속 조치, 문제 해결, 결과 Q&A 등을 포함하여 프로젝트 완료 후 3개월 동안 유효한 애프터 서비스입니다.
샘플 요구 사항 및 배송
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장되는 데이터 | 품질 관리 |
| 폴리A 농축 | 일루미나 PE150 | 6GB | Q30≥85% |
샘플 요구사항:
뉴클레오티드:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 |
| ≥ 20 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤에 단백질이나 DNA 오염이 제한되거나 전혀 표시되지 않습니다. | 식물의 경우: RIN≥6.5; 동물의 경우: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기준선 고도가 제한되거나 없음 |
조직: 무게(건조):≥1g
*5mg 미만의 조직의 경우, 급속 냉동(액체질소)된 조직 샘플을 보내는 것이 좋습니다.
세포 현탁액:세포수 = 3×106- 1×107
*냉동된 세포 용해물을 배송하는 것이 좋습니다.셀 개수가 5×105보다 작은 경우.
혈액 샘플:용량≥1ml
미생물:질량 ≥ 1g
권장 샘플 배송
용기: 2 ml 원심분리 튜브 (Tin Foil은 권장하지 않음)
샘플 라벨링: 그룹+복제(예: A1, A2, A3);B1, B2, B3... ...
선적:
- 드라이아이스: 샘플을 가방에 포장하고 드라이아이스에 묻어야 합니다.
- RNAstable 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에서 건조되고 실온에서 배송될 수 있습니다.
서비스 작업 흐름
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건립
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
진핵생물 mRNA 서열분석 분석 워크플로우
생물정보학
Ø원시 데이터 품질 관리
Ø참조 게놈 정렬
Ø성적 증명서 구조 분석
Ø발현 정량화
Ø미분 표현 분석
Ø함수 주석 및 강화
1.mRNA 데이터 포화 곡선
2.미분 표현 분석 - 화산 플롯
3.DEG에 대한 KEGG 주석
4.DEG에 대한 GO 분류
