진핵세포 mRNA 시퀀싱-NGS
특징
● 선택적으로 방향성 mRNA 라이브러리 준비를 통해 가닥 특이적 시퀀싱 데이터를 얻을 수 있습니다.
● 다양한 BI 분석을 통해 모든 고객의 요구 사항을 충족합니다.
장점
●폭넓은 전문 지식저희는 세포 배양, 조직, 체액 등 다양한 유형의 샘플을 포함하여 60만 건 이상의 샘플을 처리해 왔습니다. 모든 프로젝트에 풍부한 전문 지식을 제공합니다.
●엄격한 품질 관리우리는 시료 준비부터 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 생물정보학 분석에 이르기까지 모든 단계에 걸쳐 핵심 관리 지점을 구축합니다. 이러한 세심한 모니터링을 통해 일관되게 높은 품질의 결과를 제공합니다.
●종합 주석저희는 여러 데이터베이스를 활용하여 차등 발현 유전자(DEG)의 기능을 분석하고, 이에 상응하는 유전자 발현량 분석을 수행합니다. 이러한 포괄적인 접근 방식을 통해 전사체 반응의 기저에 있는 세포 및 분자 과정에 대한 통찰력을 얻을 수 있으며, 실험 데이터에 대한 모든 정보를 확보할 수 있도록 지원합니다.
●판매 후 지원저희는 고객과의 지속적인 소통이 얼마나 중요한지 잘 알고 있습니다. daarom 저희는 프로젝트 완료 후에도 3개월간의 사후 관리 서비스를 제공합니다. 이 기간 동안 프로젝트 진행 상황 점검, 문제 해결 지원, 그리고 결과 관련 문의 사항에 대한 질의응답 시간을 제공합니다.
샘플 요구사항 및 납품
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 데이터 권장 사항 | 품질 관리 |
| 폴리 A 강화 | 일루미나 PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10GB | Q30≥85% |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
최소 샘플 요구 사항:
| 농도(ng/μl) | 양(μg) | 청정 | 진실성 | |
| 표준 라이브러리 | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
| 방향 라이브러리 | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 젤 분석 결과 단백질이나 DNA 오염이 거의 또는 전혀 나타나지 않았습니다. | 식물의 경우: RIN≥4.0; 동물의 경우: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; 기저선 상승이 제한적이거나 없음 |
| 식물 | 동물 | 절지동물 | 전혈 | 세포 |
| 뿌리, 줄기 또는 꽃잎: 450mg 잎 또는 씨앗: 300mg 과일: 1.2g | 심장 또는 장: 300mg 내장 또는 뇌: 240mg 근육: 450mg 뼈, 머리카락 또는 피부: 1g | 곤충: 6g 갑각류: 300mg | 튜브 1개 | 106개의 세포 |
권장 샘플 배송
용기: 2ml 원심분리 튜브 (알루미늄 호일은 권장하지 않습니다)
샘플 라벨링: 그룹+반복 샘플 (예: A1, A2, A3; B1, B2, B3...)
선적:
1. 드라이아이스: 시료는 봉투에 담아 드라이아이스 속에 묻어야 합니다.
2. RNA 안정화 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에 넣어 건조시킨 후 실온에서 운송할 수 있습니다.
샘플 요구사항 및 납품
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
참조 게놈을 사용할 수 있는 샘플의 경우 BI 분석은 다음과 같습니다.
Ø원시 데이터 품질 관리
Ø참조 게놈 정렬
Ø전사 구조 분석
Ø발현량 정량화
Ø차등 발현 분석
Ø함수 주석 및 보강
참조 게놈이 없는 샘플의 경우, 사용 가능한 옵션은 다음과 같습니다.
• 원시 데이터 품질 관리
•구조 최적화를 통한 조립
•차등 발현 분석
•함수 주석 및 보강
참조 게놈 정렬
데이터 포화
샘플 상관관계 및 생물학적 반복 평가
차등 발현 유전자(DEGs)
차등 발현 유전자(DEGs)의 기능적 주석
차등 발현 유전자(DEGs)의 기능적 풍부도
BMKGene의 진핵세포 NGS mRNA 시퀀싱 서비스가 가져온 발전상을 엄선된 논문 모음을 통해 살펴보세요.
Huang, L. et al. (2023) '트리클로산과 트리클로카르반은 냄새 인식을 제한하고, 후각 신호 전달을 방해하고, 후각 정보 처리를 교란함으로써 금붕어의 후각 능력을 약화시킨다'물 연구, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus는 인간 p11을 이용하여 곰팡이를 포함하는 식세포를 비분해 경로로 전환합니다',세포 숙주 및 미생물, 31(3), pp. 373-388.e10. 도이: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) '마대나무(Dendrocalamus latiflorus Munro) 순 발달에 관여하는 TCP 전사 인자',식물 과학의 최첨단 분야, 13, p. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) '국화(Chrysanthemum lavandulifolium) 게놈과 다양한 꽃차례 유형을 뒷받침하는 분자 메커니즘',원예 연구, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'ROS 증강 및 자가포식 차단의 시너지 효과를 통해 대장암에 대한 초음파역동치료를 향상시키는 계단식 나노반응기',나노 투데이, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
