진핵생물 mRNA 시퀀싱-Illumina
장점
Ø고도의 경험: BMK에서 세포 배양, 조직, 체액 등을 포함한 다양한 샘플 유형을 다루는 200,000개 이상의 샘플이 처리되었으며 다양한 연구 영역을 포함하는 7,000개 이상의 mRNA-Seq 프로젝트가 마감되었습니다.
Ø엄격한 품질 관리 시스템: 고품질 결과를 제공하기 위해 샘플 준비, 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 생물 정보학을 포함한 모든 단계의 핵심 품질 관리 지점을 면밀히 모니터링합니다.
Ø다양한 연구 목표를 달성하기 위해 기능 주석 및 강화 연구에 사용할 수 있는 여러 데이터베이스.
Ø애프터 서비스: 프로젝트 후속 조치, 문제 해결, 결과 Q&A 등 프로젝트 완료 후 3개월 동안 유효한 애프터 서비스
샘플 요구 사항 및 배송
| 도서관 | 시퀀싱 전략 | 권장 데이터 | 품질 관리 |
| 폴리 A 강화 | 일루미나 PE150 | 6Gb | Q30≥85% |
샘플 요구 사항:
뉴클레오티드:
| 청정 | 진실성 | 양 |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5겔에 단백질 또는 DNA 오염이 제한되거나 전혀 표시되지 않습니다. | 식물의 경우: RIN≥6.5; 동물의 경우: RIN≥7;28S/18S≥1.0; 기준치 상승이 제한적이거나 없음 | 농도≥30ng/μl;볼륨 ≥ 10μl;총 ≥ 1.5μg |
조직: 무게(건조):≥1g
*5mg 미만 조직의 경우 급속 냉동(액체 질소) 조직 샘플을 보내는 것이 좋습니다.
세포 현탁액:세포 수 = 3×106- 1×107
*냉동 세포 용해물을 배송하는 것이 좋습니다.세포수가 5×105보다 작은 경우에는 액체질소에서 급속동결하는 것이 좋으며 이는 미세추출에 적합하다.
혈액 샘플:부피≥1 ml
미생물:질량 ≥ 1g
권장 샘플 전달
용기: 2 ml 원심분리기 튜브(주석 호일은 권장하지 않음)
샘플 라벨링: 그룹+복제(예: A1, A2, A3);B1, B2, B3.....
선적:
- 드라이아이스: 샘플은 백에 포장되어 드라이아이스에 묻혀야 합니다.
- RNAstable 튜브: RNA 샘플은 RNA 안정화 튜브(예: RNAstable®)에서 건조되고 실온에서 배송될 수 있습니다.
서비스 작업 흐름
실험 설계
샘플 배송
RNA 추출
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
생물정보학
진핵생물 mRNA 시퀀싱 분석 워크플로
생물정보학
Ø원시 데이터 품질 관리
Ø참조 게놈 정렬
Ø성적표 구조 분석
Ø발현 정량화
Ø미분식 분석
Ø함수 주석 및 보강
1.mRNA 데이터 포화 곡선
2.미분식 분석-화산 플롯
3.DEG의 KEGG 주석
4.DEG의 GO 분류
