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제품

Illumina 사전 제작 라이브러리

일루미나 시퀀싱 기술은 합성 기반 시퀀싱(Sequencing by Synthesis, SBS)을 기반으로 하며, 전 세계적으로 널리 사용되는 차세대 시퀀싱(NGS) 혁신 기술로, 전 세계 시퀀싱 데이터의 90% 이상을 생성하고 있습니다. SBS의 원리는 각 dNTP가 첨가될 때 형광 표지된 가역적 종결인자를 영상화하고, 이후 종결인자가 절단되어 다음 염기가 결합될 수 있도록 하는 것입니다. 각 시퀀싱 주기에서 4개의 가역적 종결인자가 모두 존재하므로, 자연적인 경쟁을 통해 염기 결합 편향을 최소화할 수 있습니다. 이 다재다능한 기술은 단일 판독 및 쌍말단 라이브러리를 모두 지원하여 다양한 유전체 연구에 활용됩니다. 일루미나 시퀀싱의 높은 처리량과 정밀도는 유전체 연구의 핵심 기술로서, 과학자들이 비교할 수 없는 수준의 정밀도와 효율성으로 유전체의 복잡성을 밝혀낼 수 있도록 지원합니다.

당사의 사전 제작 라이브러리 시퀀싱 서비스는 고객이 다양한 출처(mRNA, 전체 게놈, 앰플리콘, 10배 증폭 라이브러리 등)에서 시퀀싱 라이브러리를 준비할 수 있도록 지원합니다. 준비된 라이브러리는 당사의 시퀀싱 센터로 배송되어 품질 관리 및 Illumina 플랫폼에서의 시퀀싱을 거칩니다.


서비스 세부 정보

데모 결과

특징

●플랫폼:일루미나 노바시크 6000 및 노바시크 X 플러스

●시퀀싱 모드:PE150 및 PE250

●시퀀싱 전 라이브러리 품질 관리

●염기서열 데이터 품질 관리 및 전달:Q30 리드의 디멀티플렉싱 및 필터링 후 QC 보고서와 원시 데이터를 fastq 형식으로 제공합니다.

 

 

서비스 장점

●시퀀싱 서비스의 다재다능함:고객은 레인별, 플로우 셀별 또는 필요한 데이터 양별(부분 레인 시퀀싱)로 시퀀싱 순서를 선택할 수 있습니다.

●Illumina 시퀀싱 플랫폼에 대한 폭넓은 경험:수천 건의 다양한 종에 대한 완료된 프로젝트가 있습니다. 

●시퀀싱 품질 관리 보고서 전달:품질 지표, 데이터 정확도 및 시퀀싱 프로젝트의 전반적인 성능을 기준으로 평가합니다.

●성숙한 시퀀싱 프로세스:빠른 처리 시간으로.

●엄격한 품질 관리우리는 일관되게 높은 품질의 결과를 제공하기 위해 엄격한 품질 관리 요건을 시행합니다.

 

 

샘플 플랫폼

플랫폼

유동 셀

시퀀싱 모드

단위

예상 출력

노바시크 X

10B (8차선)

PE150

단일 차선

부분 차선

375Gb/레인

25B (8차선)

PE150

단일 차선

부분 차선

레인당 1000기가비트

노바시크 6000

SP 플로우 셀(2레인)

PE250

유동 셀

단일 차선

부분 차선

레인당 325~400M회 읽기

S4 플로우 셀(4레인)

PE150

유동 셀

단일 차선

부분 차선

레인당 약 800GB

샘플 요구 사항

 

데이터 용량(GB)

농도(qPCR) PE150

농도(qPCR) PE250

용량

부분 차선

 

 

G ≤ 10

≥ 1 nM

≥ 2nM

25μl 이상

10 < G ≤ 50

2 nM 이상

≥ 3nM

25μl 이상

50 < G ≤ 100

≥ 3 nM

≥ 4nM

25μl 이상

G > 100

≥ 4 nM

≥ 4nM

25μl 이상

단일 차선

차선당

≥ 1.5 nM/라이브러리 풀

≥ 2 nM/라이브러리 풀

≥ 25 µL/라이브러리 풀

농도와 총량 외에도 적절한 피크 패턴이 필요합니다.

참고: 다양성이 낮은 라이브러리의 레인 시퀀싱에는 정확한 염기 판독을 위해 PhiX 스파이크인이 필요합니다.

레인 시퀀싱을 위한 샘플로는 미리 풀링된 라이브러리를 제출하는 것을 권장합니다. BMKGENE에서 라이브러리 풀링을 수행해야 하는 경우, 부분 레인 시퀀싱을 위한 라이브러리 요구 사항을 참조하십시오.

라이브러리 크기(피크 맵)

PE150 시퀀싱의 경우 삽입 크기는 어댑터를 제외하고 300~400bp여야 하며, PE250 시퀀싱의 경우 삽입 크기는 어댑터를 제외하고 150~500bp여야 합니다.
라이브러리는 단일 주 피크를 가져야 하며, 어댑터 오염이나 프라이머 이합체가 없어야 합니다.

샘플이 출발 물질 요건을 충족하지 못하는 경우 당사로 연락해 주십시오.

서비스 워크플로우

시료 준비

라이브러리 품질 관리

시퀀싱

시퀀싱

데이터 분석

데이터 품질 관리

샘플 QC

프로젝트 제공


  • 이전의:
  • 다음:

  • 라이브러리 품질 관리 보고서

    시퀀싱 전에 라이브러리 품질에 대한 보고서가 제공되며, 여기에는 라이브러리 양과 단편화 정도가 평가됩니다.

     

    시퀀싱 QC 보고서

     

    표 1. 염기서열 분석 데이터 통계.

    샘플 ID

    BMKID

    원본 읽기

    원시 데이터(bp)

    깨끗한 판독률(%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    그림 1. 각 샘플에서 리드에 따른 품질 분포

    에이9

    그림 2. 기본 함량 분포

    A10

    그림 3. 시퀀싱 데이터에서 읽은 내용의 분포

    A11

     

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