●플랫폼:일루미나 노바시크 6000 및 노바시크 X 플러스
●시퀀싱 모드:PE150 및 PE250
●시퀀싱 전 라이브러리 품질 관리
●염기서열 데이터 품질 관리 및 전달:Q30 리드의 디멀티플렉싱 및 필터링 후 QC 보고서와 원시 데이터를 fastq 형식으로 제공합니다.
●시퀀싱 서비스의 다재다능함:고객은 레인별, 플로우 셀별 또는 필요한 데이터 양별(부분 레인 시퀀싱)로 시퀀싱 순서를 선택할 수 있습니다.
●Illumina 시퀀싱 플랫폼에 대한 폭넓은 경험:수천 건의 다양한 종에 대한 완료된 프로젝트가 있습니다.
●시퀀싱 품질 관리 보고서 전달:품질 지표, 데이터 정확도 및 시퀀싱 프로젝트의 전반적인 성능을 기준으로 평가합니다.
●성숙한 시퀀싱 프로세스:빠른 처리 시간으로.
●엄격한 품질 관리우리는 일관되게 높은 품질의 결과를 제공하기 위해 엄격한 품질 관리 요건을 시행합니다.
| 플랫폼 | 유동 셀 | 시퀀싱 모드 | 단위 | 예상 출력 |
| 노바시크 X | 10B (8차선) | PE150 | 단일 차선 부분 차선 | 375Gb/레인 |
| 25B (8차선) | PE150 | 단일 차선 부분 차선 | 레인당 1000기가비트 | |
| 노바시크 6000 | SP 플로우 셀(2레인) | PE250 | 유동 셀 단일 차선 부분 차선 | 레인당 325~400M회 읽기 |
| S4 플로우 셀(4레인) | PE150 | 유동 셀 단일 차선 부분 차선 | 레인당 약 800GB |
| 데이터 용량(GB) | 농도(qPCR) PE150 | 농도(qPCR) PE250 | 용량 | |
| 부분 차선
| G ≤ 10 | ≥ 1 nM | ≥ 2nM | 25μl 이상 |
| 10 < G ≤ 50 | 2 nM 이상 | ≥ 3nM | 25μl 이상 | |
| 50 < G ≤ 100 | ≥ 3 nM | ≥ 4nM | 25μl 이상 | |
| G > 100 | ≥ 4 nM | ≥ 4nM | 25μl 이상 | |
| 단일 차선 | 차선당 | ≥ 1.5 nM/라이브러리 풀 | ≥ 2 nM/라이브러리 풀 | ≥ 25 µL/라이브러리 풀 |
농도와 총량 외에도 적절한 피크 패턴이 필요합니다.
참고: 다양성이 낮은 라이브러리의 레인 시퀀싱에는 정확한 염기 판독을 위해 PhiX 스파이크인이 필요합니다.
레인 시퀀싱을 위한 샘플로는 미리 풀링된 라이브러리를 제출하는 것을 권장합니다. BMKGENE에서 라이브러리 풀링을 수행해야 하는 경우, 부분 레인 시퀀싱을 위한 라이브러리 요구 사항을 참조하십시오.
PE150 시퀀싱의 경우 삽입 크기는 어댑터를 제외하고 300~400bp여야 하며, PE250 시퀀싱의 경우 삽입 크기는 어댑터를 제외하고 150~500bp여야 합니다.
라이브러리는 단일 주 피크를 가져야 하며, 어댑터 오염이나 프라이머 이합체가 없어야 합니다.
시퀀싱 전에 라이브러리 품질에 대한 보고서가 제공되며, 여기에는 라이브러리 양과 단편화 정도가 평가됩니다.
표 1. 염기서열 분석 데이터 통계.
| 샘플 ID | BMKID | 원본 읽기 | 원시 데이터(bp) | 깨끗한 판독률(%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
그림 1. 각 샘플에서 리드에 따른 품질 분포
그림 2. 기본 함량 분포
그림 3. 시퀀싱 데이터에서 읽은 내용의 분포