Illumina 사전 제작 라이브러리
특징
●플랫폼:Illumina NovaSeq 6000 및 NovaSeq X Plus
●시퀀싱 모드:PE150과 PE250
●시퀀싱 전 라이브러리 품질 관리
●시퀀싱 데이터 QC 및 전달:Q30 읽기를 디멀티플렉싱 및 필터링한 후 QC 보고서 및 원시 데이터를 fastq 형식으로 전달
서비스 장점
●시퀀싱 서비스의 다양성:고객은 레인, 플로우 셀 또는 필요한 데이터 양(부분 레인 시퀀싱)별로 시퀀싱을 선택할 수 있습니다.
●Illumina 시퀀싱 플랫폼에 대한 광범위한 경험:다양한 종을 대상으로 수천 개의 프로젝트가 종료되었습니다.
●시퀀싱 QC 보고서 전달:시퀀싱 프로젝트의 품질 지표, 데이터 정확도 및 전반적인 성과를 평가합니다.
●성숙한 시퀀싱 과정:처리 시간이 짧습니다.
●엄격한 품질 관리: 당사는 지속적으로 높은 품질의 결과를 제공하기 위해 엄격한 품질 관리 요건을 시행합니다.
샘플 플랫폼
| 플랫폼 | 유동 셀 | 시퀀싱 모드 | 단위 | 예상 출력 |
| 노바섹 X | 10B(8개 레인) | PE150 | 단일 차선 부분 차선 | 375Gb/레인 |
| 25B (8개 레인) | PE150 | 단일 차선 부분 차선 | 1000Gb/레인 | |
| 노바섹 6000 | SP Flow 셀(2레인) | PE250 | 유동 셀 단일 차선 부분 차선 | 325-400M 읽기/레인 |
| S4 플로우 셀(4레인) | PE150 | 유동 셀 단일 차선 부분 차선 | ~800Gb/레인 |
샘플 요구 사항
| 데이터 양(X) | 농도(qPCR/nM) | 용량 | |
| 부분 차선 시퀀싱
| X ≤ 10Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10Gb < X ≤ 50Gb | ≥ 2nM | ≥ 25 μl | |
| 50Gb < X ≤ 100Gb | ≥ 3nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100GB | ≥ 4nM | ≥ 25 μl | |
| 차선 순서 지정 | 퍼 레인 | ≥ 1.5 nM / 라이브러리 풀 | ≥ 25 μl / 라이브러리 풀 |
농도와 총량 외에도 적절한 피크 패턴도 필요합니다.
참고: 낮은 다양성 라이브러리의 레인 시퀀싱에는 강력한 베이스 콜링을 보장하기 위해 PhiX 스파이크인이 필요합니다.
미리 풀링된 라이브러리를 샘플로 제출하는 것이 좋습니다. BMKGENE에서 라이브러리 풀링을 수행해야 하는 경우 다음을 참조하세요.
부분적 레인 시퀀싱을 위한 라이브러리 요구 사항.
도서관 규모(피크 맵)
주요 피크는 300-450bp 내에 있어야 합니다.
라이브러리에는 단일 메인 피크가 있어야 하며, 어댑터 오염이 없고 프라이머 다이머가 없어야 합니다.
샘플이 시작 재료 요구 사항을 충족하지 못하는 경우 저희에게 문의해 주시기 바랍니다.
서비스 워크플로
도서관 품질 관리
시퀀싱
데이터 품질 관리
프로젝트 전달
도서관 QC 보고서
시퀀싱, 라이브러리 양 평가, 단편화에 앞서 라이브러리 품질에 대한 보고서가 제공됩니다.
시퀀싱 QC 보고서
표 1. 시퀀싱 데이터 통계.
| 샘플 ID | 비엠키드 | 원시 읽기 | 원시 데이터(bp) | 깨끗한 읽기(%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | 비엠케이_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
그림 1. 각 샘플의 읽기에 따른 품질 분포
그림 2. 기본 콘텐츠 분포
그림 3. 시퀀싱 데이터에서 읽은 내용의 분포
