메타게놈 시퀀싱 -NGS
메타게놈은 환경 및 인간 메타게놈과 같은 유기체의 혼합 공동체의 전체 유전 물질의 모음입니다. 여기에는 재배 가능한 미생물과 재배 불가능한 미생물의 게놈이 모두 포함되어 있습니다. NGS를 사용한 Shotgun 메타게놈 시퀀싱을 사용하면 분류학적 프로파일링 이상의 기능을 제공하고 종 다양성, 풍부한 역학 및 복잡한 개체군 구조에 대한 세부적인 통찰력을 제공하여 환경 샘플에 포함된 복잡한 게놈 지형을 연구할 수 있습니다. 분류학 연구 외에도 샷건 메타유전체학은 기능적 유전체학 관점을 제공하여 암호화된 유전자와 생태학적 과정에서 추정되는 역할을 탐구할 수 있게 해줍니다. 마지막으로, 유전적 요소와 환경적 요소 사이의 상관관계 네트워크의 확립은 미생물 군집과 그들의 생태적 배경 사이의 복잡한 상호작용에 대한 전체적인 이해에 기여합니다. 결론적으로, 메타게놈 시퀀싱은 다양한 미생물 군집의 게놈 복잡성을 밝히고 이러한 복잡한 생태계 내에서 유전학과 생태학 간의 다각적인 관계를 조명하는 중추적인 도구입니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq 및 DNBSEQ-T7
서비스 장점
●미생물 군집 프로파일링을 위한 분리 및 무배양 방법: 재배 불가능한 유기체로부터 유전 물질의 서열 분석을 가능하게 합니다.
●고해상도: 환경 시료 중 미량종을 검출합니다.
●종합적인 생물정보학 분석:분류학적 다양성뿐만 아니라 공동체의 기능적 다양성에도 초점을 맞췄습니다.
●광범위한 경험:다양한 연구 영역에서 여러 메타게노믹스 프로젝트를 성공적으로 마무리하고 200,000개 이상의 샘플을 처리한 실적을 바탕으로 우리 팀은 모든 프로젝트에 풍부한 경험을 제공합니다.
서비스 사양
| 시퀀싱 플랫폼 | 시퀀싱 전략 | 권장되는 데이터 | 품질 관리 |
| Illumina NovaSeq 또는 DNBSEQ-T7 | PE150 | 6~20GB | Q30≥85% |
서비스 요구 사항
| 농도(ng/μL) | 총 금액(ng) | 볼륨(μL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● 토양/슬러지 : 2~3g
● 장내용물-동물 : 0.5-2g
● 장내용물-곤충 : 0.1~0.25g
● 식물 표면(농축된 퇴적물): 0.5-1g
● 발효액 농축 침전물) : 0.2-0.5g
● 대변(대형동물) : 0.5~2g
● 대변(쥐) : 3~5알
● 폐포 세척액: 여과지
● 질 면봉: 면봉 5~6개
● 피부/생식기 면봉/타액/구강 연조직/인두 면봉/직장 면봉: 2~3개
● 표면 미생물: 면봉 5~6개
● 수체/공기/생물막: 여과지
● 내생식물 : 2-3g
● 치석 : 0.5-1g
서비스 작업 흐름
샘플 배송
도서관 건립
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
다음 분석이 포함됩니다.
● 시퀀싱 데이터 품질 관리
● 메타게놈 조립 및 유전자 예측
● 유전자 주석
● 분류학적 알파 다양성 분석
● 지역사회 기능 분석: 생물학적 기능, 대사, 항생제 내성
● 기능적, 분류학적 다양성에 대한 분석:
베타 다양성 분석
그룹 간 분석
상관관계 분석 : 환경요인과 OUT 구성 및 다양성 간의 상관관계 분석
기능 분석: CARD 항생제 내성
KEGG 대사 경로의 차등 분석: 중요한 경로의 히트맵
분류학적 분포의 알파 다양성: ACE 지수
분류학적 분포의 베타 다양성: PCoA
엄선된 출판물 컬렉션을 통해 Illumina와 함께 BMKGene의 메타게놈 시퀀싱 서비스를 통해 촉진된 발전을 살펴보세요.
Hai, Q. et al. (2023) '다른 배양 수온에서 감염성 조혈괴사 바이러스에 감염된 무지개 송어(Oncorhynchus mykiss)의 장내 함량 변화에 대한 메타게놈 및 대사체 분석',미생물학의 개척지, 14, p. 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
Mao, C.et al. (2023) '다양한 영양 상태의 도시 호수에서 미생물 군집, 저항성 유전자 및 저항성 위험: 내부 연결 및 외부 영향',위험 물질 발전 저널, 9, p. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
Su, M. et al. (2022) 'Metagenomic 분석을 통해 양 반추위의 액체 관련 미생물과 고체 관련 미생물 간의 구성 및 기능 차이가 밝혀졌습니다.',미생물학의 개척지, 13, p. 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
Yin, J.et al. (2023) '비만 Ningxiang 돼지 유래 미생물군은 마른 DLY 돼지의 근육 지방산 침착을 촉진하기 위해 카르니틴 대사를 재구성합니다',혁신, 4(5), p. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
Zhao, X. et al. (2023) '중국 하이허 하구 상류 및 하류의 대표적인 생/비분해성 플라스틱 및 비플라스틱 잔해의 잠재적 위험에 대한 메타게놈 통찰',종합환경과학, 887, p. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.
