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BMKMANU S3000_공간 전사체
공간 전사체학은 조직 내 유전자 발현을 포착하고 시각화할 수 있는 기술입니다. 이는 세포 간 상호작용을 이해하는 데 매우 중요할 수 있습니다.
이러한 접근 방식을 위한 다양한 플랫폼이 있습니다. 이와 관련하여 BMKGene은 세포 소기관 수준의 해상도를 달성하고 다단계 해상도 설정을 가능하게 하는 기술 성능 향상 플랫폼인 BMKManu 3000 공간 전사체 칩을 개발했습니다.
이 칩은 특허받은 마이크로웰 기술을 사용하여 공간적으로 바코드화된 프로브가 탑재된 비드를 층층이 쌓아 420만 개의 스팟을 포함하고 있습니다. 이 방법을 통해 포획 및 증폭 후, 일루미나(Illumina)와 호환되는 바코드화된 샘플이 풍부하게 함유된 cDNA 라이브러리를 얻을 수 있습니다.
데이터에서 공간 바코드와 UMI의 조합은 생성된 데이터의 정확성과 특수성을 보장합니다. 이 모든 것을 종합하여 BMKManu는 매우 다재다능한 데이터 설정을 제공합니다.
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단일 핵 RNA 시퀀싱
단일 세포 포획 및 맞춤형 라이브러리 구축 기술의 발전과 고처리량 시퀀싱 기술의 결합은 세포 수준에서의 유전자 발현 연구에 혁명을 일으켰습니다. 이러한 혁신을 통해 복잡한 세포 집단에 대한 더욱 심층적이고 포괄적인 분석이 가능해졌으며, 모든 세포의 유전자 발현을 평균화하는 기존의 한계를 극복하고 세포 집단 내의 진정한 이질성을 보존할 수 있게 되었습니다. 단일 세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)은 분명한 장점을 가지고 있지만, 단일 세포 현탁액 제조가 어렵고 신선한 샘플이 필요한 특정 조직에서는 어려움이 있습니다. BMKGene은 최첨단 10X Genomics Chromium 기술을 활용한 단일 핵 RNA 시퀀싱(snRNA-seq)을 제공함으로써 이러한 문제를 해결합니다. 이 접근 방식을 통해 단일 세포 수준에서 전사체 분석이 가능한 샘플의 범위가 넓어졌습니다.
핵 분리는 이중 교차 구조를 갖춘 8채널 미세유체 시스템을 특징으로 하는 혁신적인 10X Genomics Chromium 칩을 통해 이루어집니다. 이 시스템 내에서 바코드, 프라이머, 효소 및 단일 핵을 포함하는 젤 비드는 나노리터 크기의 오일 방울에 캡슐화되어 젤 비드-인-에멀젼(GEM)을 형성합니다. GEM 형성 후, 각 GEM 내에서 세포 용해 및 바코드 방출이 일어납니다. 이어서 mRNA 분자는 역전사 과정을 거쳐 10X 바코드와 고유 분자 식별자(UMI)를 포함하는 cDNA로 전환됩니다. 이 cDNA는 표준 시퀀싱 라이브러리 구축 과정을 거쳐 단일 세포 수준에서 유전자 발현 프로파일을 강력하고 포괄적으로 탐색할 수 있도록 합니다.
플랫폼: 10× Genomics Chromium 및 Illumina NovaSeq 플랫폼
