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게놈 전체 연관 분석
GWAS(게놈 연관 연구)는 특정 특성(표현형)과 관련된 유전적 변이(유전자형)를 식별하는 것을 목표로 합니다.GWAS 연구는 다수 개인의 전체 게놈에 걸친 유전적 마커를 조사하고 인구 수준에서의 통계 분석을 통해 유전자형-표현형 연관성을 예측합니다.이는 인간 질병 연구 및 동물이나 식물의 복잡한 특성에 대한 기능적 유전자 마이닝에 널리 적용되었습니다.
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단일핵 RNA 서열 분석
단일 세포 포획 및 높은 처리량 시퀀싱과 결합된 개별 라이브러리 구축 기술의 발전으로 세포별 유전자 발현 연구가 가능해졌습니다.이를 통해 복잡한 세포 집단에 대한 더 깊고 완전한 시스템 분석이 가능하며, 모든 세포의 평균을 취하여 이질성이 가려지는 것을 대부분 방지합니다.
그러나 일부 세포는 단세포 현탁액으로 만들기에 적합하지 않으므로 다른 시료 준비 방법, 즉 조직에서 핵 추출이 필요합니다. 세포 시퀀싱.
BMK는 10× Genomics ChromiumTM 기반 단일 세포 RNA 시퀀싱 서비스를 제공합니다.본 서비스는 면역세포 분화, 종양 이질성, 조직 발달 등 질병 관련 연구에 널리 활용되어 왔습니다.
공간 전사체 칩: 10× Genomics
플랫폼: Illumina NovaSeq 6000
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식물/동물 전체 게놈 시퀀싱
WGS라고도 알려진 전체 게놈 재시퀀싱을 통해 SNP(단일 염기 다형성), InDel(삽입 결실), SV(구조 변이) 및 CNV를 포함하여 전체 게놈에서 공통 돌연변이와 희귀 돌연변이를 모두 밝힐 수 있습니다. ).SV는 SNP보다 변이 기반의 더 큰 부분을 차지하고 게놈에 더 큰 영향을 미치며 이는 살아있는 유기체에 중요한 영향을 미칩니다.긴 읽기를 사용하면 직렬 반복, GC/AT가 풍부한 영역 및 초가변 영역과 같은 복잡한 영역에 대한 염색체 교차가 훨씬 쉬워지기 때문에 긴 읽기 재배열을 통해 큰 단편과 복잡한 변이를 보다 정확하게 식별할 수 있습니다.
플랫폼: Illumina, PacBio, Nanopore
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BMKMANU S1000 공간 전사체
세포의 공간 구성은 면역 침투, 배아 발달 등과 같은 다양한 생물학적 과정에서 중요한 역할을 합니다. 공간 위치 정보를 유지하면서 유전자 발현 프로파일링을 나타내는 공간 전사체 시퀀싱은 전사체 수준 조직 구조에 대한 훌륭한 통찰력을 제공합니다.기술의 발전에 따라 매우 선명한 조직 형태와 공간 분자 발현의 실제 구조적 차이를 더 높은 해상도로 연구해야 합니다.BMKGENE은 샘플부터 생물학적 통찰력까지 포괄적인 원스톱 공간 전사체 시퀀싱 서비스를 제공합니다.
공간 전사체학 기술은 이질적인 샘플의 공간 콘텐츠로 유전자 발현 프로파일을 해결함으로써 다양한 연구 분야에서 새로운 관점을 제시합니다.
공간 전사체 칩: BMKMANU S1000
플랫폼: Illumina NovaSeq 6000
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10x Genomics Visium 공간 전사체
Visium Spatial Gene Expression은 전체 mRNA를 기반으로 조직을 분류하기 위한 주류 공간 전사체 시퀀싱 기술입니다.전체 전사체를 형태학적 맥락으로 매핑하여 정상적인 발달, 질병 병리학 및 임상 중개 연구에 대한 새로운 통찰력을 발견합니다.BMKGENE은 샘플부터 생물학적 통찰력까지 포괄적인 원스톱 공간 전사체 시퀀싱 서비스를 제공합니다.
공간 전사체학 기술은 이질적인 샘플의 공간 콘텐츠로 유전자 발현 프로파일을 해결함으로써 다양한 연구 분야에서 새로운 관점을 제시합니다..
공간 전사체 칩: 10x Genomics Visium
플랫폼:일루미나 NovaSeq 6000
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전장 mRNA 서열분석-나노포어
RNA 서열분석은 포괄적인 전사체 분석을 위한 귀중한 도구였습니다.의심할 바 없이 전통적인 짧은 읽기 순서는 여기서 수많은 중요한 발전을 이루었습니다.그럼에도 불구하고 전체 길이의 isoform 식별, 정량화, PCR 편향에 한계가 있는 경우가 많습니다.
Nanopore 시퀀싱은 DNA 합성 없이 뉴클레오티드를 직접 읽고 수십 킬로베이스의 긴 판독을 생성한다는 점에서 다른 시퀀싱 플랫폼과 구별됩니다.이를 통해 전체 길이의 성적표를 직접 읽고 동형 수준 연구의 과제를 해결할 수 있습니다.
플랫폼：나노포어 프로메트ION
도서관:cDNA-PCR
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전장 mRNA 시퀀싱 -PacBio
드 노보전장 전사체 시퀀싱(전사체 서열 분석이라고도 함)드 노보Iso-Seq은 읽기 길이 측면에서 PacBio 시퀀서의 장점을 활용하므로 중단 없이 전체 길이의 cDNA 분자를 시퀀싱할 수 있습니다.이는 전사체 조립 단계에서 생성된 오류를 완전히 방지하고 이소형 수준 분해능으로 고유 유전자 세트를 구성합니다.이 고유 유전자 세트는 전사체 수준에서 "참조 게놈"으로서 강력한 유전 정보를 제공합니다.또한 이 서비스는 차세대 염기서열분석 데이터와 결합하여 이소형 수준 발현의 정확한 정량화를 지원합니다.
플랫폼: PacBio 속편 II라이브러리: SMRT 벨 라이브러리 -
진핵생물 mRNA 서열분석-Illumina
mRNA 서열 분석을 통해 특정 조건 하에서 세포에서 전사된 모든 mRNA의 프로파일링이 가능합니다.이는 특정 생물학적 과정의 유전자 발현 프로파일, 유전자 구조 및 분자 메커니즘을 밝히는 강력한 기술입니다.현재까지 mRNA 염기서열 분석은 기초 연구, 임상 진단, 약물 개발 등에 널리 활용되어 왔습니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq 6000
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비참조 기반 mRNA 시퀀싱-Illumina
mRNA 시퀀싱은 일부 특수 기능이 활성화되는 특정 기간에 진핵생물 형태의 메신저 RNA(mRNA)를 포착하기 위해 차세대 시퀀싱 기술(NGS)을 채택합니다.스플라이싱된 가장 긴 전사체는 'Unigene'이라고 불리며 후속 분석을 위한 참조 서열로 사용되었으며, 이는 참조 없이 종의 분자 메커니즘과 조절 네트워크를 연구하는 효과적인 수단입니다.
전사체 데이터 조립 및 unigene 기능 주석 후
(1)SSR 분석, CDS 예측 및 유전자 구조가 수행됩니다.
(2) 각 샘플의 고유 유전자 발현 정량을 수행합니다.
(3)Unigene 발현을 기반으로 샘플(또는 그룹) 간에 차별적으로 발현되는 unigene을 발견합니다.
(4)차이적으로 발현된 고유 유전자의 클러스터링, 기능적 주석 및 농축 분석이 수행됩니다.
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긴 비코딩 시퀀싱 -Illumina
긴 비코딩 RNA(lncRNA)는 길이가 200nt를 초과하는 RNA 분자 유형으로, 코딩 가능성이 매우 낮은 것이 특징입니다.비암호화 RNA의 핵심 구성원인 LncRNA는 주로 핵과 혈장에서 발견됩니다.시퀀싱 기술과 생물정보학의 발전으로 수많은 새로운 lncRNA를 식별하고 이를 생물학적 기능과 연관시킬 수 있습니다.누적된 증거는 lncRNA가 후생적 조절, 전사 조절 및 전사 후 조절에 광범위하게 관여한다는 것을 시사합니다.
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소형 RNA 시퀀싱-Illumina
소형 RNA는 마이크로 RNA(miRNA), 소형 간섭 RNA(siRNA) 및 피위 상호작용 RNA(piRNA)를 포함하여 일반적으로 길이가 200nt 미만인 비암호화 RNA 분자 클래스를 의미합니다.
마이크로RNA(miRNA)는 길이가 약 20~24nt인 내인성 소형 RNA의 일종으로 세포에서 다양한 중요한 조절 역할을 합니다.miRNA는 조직 특이적 및 단계 특이적 발현을 드러내고 다양한 종에서 고도로 보존되는 많은 생명 과정에 관여합니다.
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circRNA 시퀀싱-Illumina
전체 전사체 시퀀싱은 특정 시간에 특정 세포에 의해 전사되는 코딩(mRNA) 및 비코딩 RNA(lncRNA, circRNA 및 miRNA 포함)를 포함하여 모든 유형의 RNA 분자를 프로파일링하도록 설계되었습니다."전체 RNA 시퀀싱"이라고도 알려진 전체 전사체 시퀀싱은 전사체 수준에서 포괄적인 조절 네트워크를 밝히는 것을 목표로 합니다.NGS 기술을 활용하면 전체 전사체 산물의 서열을 ceRNA 분석 및 공동 RNA 분석에 사용할 수 있으며 이는 기능적 특성 분석을 위한 첫 번째 단계를 제공합니다.circRNA-miRNA-mRNA 기반 ceRNA의 조절 네트워크 공개.
