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소형 RNA

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소형 RNA

소형 RNA(sRNA)는 miRNA, siRNA, piRNA를 포함하여 평균 길이가 18~30nt인 짧은 비코딩 RNA로, 조절 과정에서 중요한 역할을 합니다. BMKCloud sRNA 파이프라인은 miRNA 식별을 위한 표준 및 사용자 지정 분석 기능을 제공합니다. 리드 트리밍 및 품질 관리 후, 여러 데이터베이스에 리드를 정렬하여 sRNA를 분류하고 miRNA를 선별한 후 참조 게놈에 매핑합니다. miRNA는 알려진 miRNA 데이터베이스를 기반으로 식별되며, 2차 구조, miRNA 패밀리 및 표적 유전자에 대한 정보를 제공합니다. 차등 발현 분석을 통해 차등 발현 miRNA를 식별하고, 해당 표적 유전자에 기능적 주석을 달아 풍부하게 나타나는 범주를 찾습니다.

 

생물정보학 워크플로우

그림 107

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