참조 게놈을 사용한 mRNA-seq(NGS)
RNA-seq는 생명과학 및 작물과학 분야에서 널리 사용되는 표준 도구로, 유전체와 단백질체 간의 간극을 메워줍니다. RNA-seq의 강점은 새로운 전사체를 발견하고 단일 분석으로 발현량을 정량화할 수 있다는 점입니다. 돌연변이체와 야생형을 비교하거나 특정 조건에서의 유전자 발현을 밝히는 등 다양한 형질 또는 표현형과 관련된 유전자를 규명하는 비교 전사체 연구에 폭넓게 활용됩니다. BMKCloud mRNA(Reference) 앱은 발현량 정량화, 차등 발현 분석(DEG), 서열 구조 분석 기능을 mRNA-seq(NGS) 생물정보학 파이프라인에 통합하고, 유사 소프트웨어의 장점을 결합하여 편리하고 사용자 친화적인 환경을 제공합니다. 사용자는 RNA-seq 데이터를 클라우드에 업로드하여 앱에서 제공하는 포괄적인 원스톱 생물정보학 분석 솔루션을 이용할 수 있습니다. 또한, 고객 경험을 최우선으로 고려하여 사용자의 특정 요구에 맞춘 맞춤형 서비스를 제공합니다. 사용자는 매개변수를 설정하고 파이프라인 작업을 직접 제출할 수 있으며, 대화형 보고서를 확인하고, 데이터/다이어그램을 보고, 목표 유전자 선택, 기능 클러스터링, 다이어그램 작성 등과 같은 데이터 마이닝을 완료할 수 있습니다.
플랫폼:일루미나, MGI
전략:RNA-Seq
공들여 나열한 것: 짝을 이루고, 정리된 데이터.
라이브러리 유형:fr-가닥 없는, fr-첫 번째 가닥 또는 fr-두 번째 가닥
읽기 길이:150 bp
파일 형식:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz 또는 *.fq.gz. 시스템은파일 이름을 기준으로 .fastq 파일을 자동으로 짝짓습니다.예: *_1.fastq와 *._2.fastq가 쌍을 이룹니다.
샘플 수:수량에는 제한이 없습니다.샘플 수가 많아질수록 분석 시간도 늘어납니다.샘플 수가 증가합니다.
권장 데이터 용량:샘플당 6g
