DNA/RNA 시퀀싱 – 나노포어 시퀀서
서비스 세부 정보 및 특징
| 플랫폼 | 라이브러리 크기 | 이론적 데이터 수율(셀당) | 단일 베이스 정확도 | 응용 프로그램 |
| 나노포어 | 8KB, 10KB, 20KB, 초장쇄, cDNA-PCR | 셀당 70-90Gb | 85-92% | 구조변이 검출, 데노보 시퀀싱, 전체 길이 시퀀싱, 아이소 시퀀싱, 유전자 주석, DNA 메틸화 검출 |
서비스 장점
● PacBio 시퀀싱 플랫폼에서 5년 이상의 경력을 보유하고 있으며, 다양한 종을 대상으로 수천 건의 프로젝트를 완료했습니다.
● BMKGENE은 RNA/DNA 이중 플랫폼 인증을 획득한 Oxford Nanopore의 공식 파트너입니다.
● 시퀀서 중에는 장비가 완비되어 있고 충분한 시퀀싱 처리량을 갖춘 주류 모델들이 있습니다.
● 나노포어 플랫폼을 기반으로 10건 이상의 동물 및 식물 데노보 연구가 국제적으로 저명한 학술지에 발표되었습니다.
샘플 요구 사항
| 샘플 유형 | 양 | 집중(큐비트®) | 용량 | 청정 | 기타 |
| 게놈 DNA | 데이터 요구 사항에 따라 다릅니다. | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5； 260nm에서 뚜렷한 피크가 나타나고 오염 물질은 없다. | 농도는 큐비트(Qubit)로 측정해야 하며, 큐비트/나노포어 비율은 2 이하이어야 합니다. |
| 총 RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5; 오염 없음 | RIN 값 ≥7.5 |
서비스 워크플로우
시료 준비
도서관 건설
시퀀싱
데이터 분석
프로젝트 제공
DNA 샘플의 데이터 품질 평가
표 1. 정제된 데이터에 대한 통계.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | 클린N50렌즈 | 클린N90렌즈 | 클린미언렌 | 클린맥스렌 | 클린평균품질 |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
RNA 샘플의 데이터 품질 평가
표 1. 정제된 데이터에 대한 통계.
| 파일 이름 | 클라이언트 ID | ReadNum | 베이스넘 | N50 | 평균 길이 | 최대 길이 | MeanQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
그림 1. 읽기 길이 분포
그림 2. 정제된 데이터의 품질 점수 분포
그림 3. 정제된 데이터의 길이 및 품질 점수 분포
