앰플리콘 시퀀싱(16S/18S/ITS)

Illumina를 이용한 앰플리콘(16S/18S/ITS) 시퀀싱은 서열을 기반으로 미생물 프로파일을 식별하고 각 샘플 내 및 샘플 간 군집의 풍부도와 다양성을 분석하는 미생물 다양성 분석 방법입니다. BMKCloud 앰플리콘(NGS) 파이프라인은 16S, 18S, ITS 및 여러 기능 유전자를 분석할 수 있도록 지원합니다. 이 파이프라인은 리드 트리밍, 페어드 엔드 리드 어셈블리 및 품질 평가로 시작하여 유사한 리드를 클러스터링하여 6개의 분석 단계에 사용되는 작동 분류 단위(OTU)를 생성합니다. 분류학적 주석은 각 샘플의 상대적 풍부도와 구성에 대한 정보를 제공하며, 알파 및 베타 다양성 분석은 각각 샘플 내 및 샘플 간 미생물 다양성에 초점을 맞춥니다. 그룹 간 차이 분석은 모수적 및 비모수적 검정을 모두 사용하여 차이가 있는 OTU를 찾고, 상관 분석은 이러한 차이와 환경 요인 간의 관계를 분석합니다. 마지막으로, 마커 유전자 풍부도를 기반으로 기능 유전자 풍부도를 예측하여 각 샘플의 기능과 생태에 대한 통찰력을 제공합니다.