Metagenomics (NGS)

Illumina를 가진 Shotgun Metagenomics는 복잡한 샘플로부터 DNA를 직접 시퀀싱함으로써 미생물을 연구하는 데 인기있는 도구이며, 분류 및 기능적 다양성에 대한 연구를 가능하게합니다. BMKCLOUD METAGENOMIC (NGS) 파이프 라인은 품질 관리 및 메타 게놈 어셈블리로 시작하여 유전자가 예측되고 여러 데이터베이스를 사용하여 기능 및 분류에 대해 주석이 달린 비 중복 데이터 세트로 클러스터링됩니다. 이 정보는 샘플 내 분류 학적 다양성 (알파 다양성)과 샘플 간 다양성 (베타 다양성)을 분석하는 데 사용됩니다. 그룹 간의 차별 분석은 파라 메트릭 및 비모수 적 시험을 사용하여 두 그룹간에 다른 OTU 및 생물학적 기능을 발견하는 반면, 상관 관계 분석은 이러한 차이를 환경 적 요인과 관련시킵니다.