메타게놈 분석(NGS)

일루미나(Illumina)를 이용한 샷건 메타게놈 분석은 복잡한 샘플에서 DNA를 직접 시퀀싱하여 미생물군집을 연구하는 데 널리 사용되는 도구로, 분류학적 다양성과 기능적 다양성 모두를 연구할 수 있게 해줍니다. BMKCloud의 차세대 염기서열 분석(NGS) 파이프라인은 품질 관리 및 메타게놈 어셈블리로 시작하며, 이를 통해 유전자를 예측하고 중복되지 않는 데이터셋으로 클러스터링한 후 여러 데이터베이스를 활용하여 기능 및 분류학적 정보를 주석 처리합니다. 이 정보는 샘플 내 분류학적 다양성(알파 다양성)과 샘플 간 다양성(베타 다양성)을 분석하는 데 사용됩니다. 그룹 간 차이 분석은 모수적 및 비모수적 검정을 모두 사용하여 두 그룹 간에 차이가 있는 OTU와 생물학적 기능을 찾아내고, 상관 분석은 이러한 차이와 환경 요인 간의 관계를 분석합니다.