곰팡이 게놈
서비스 장점
● 다양한 연구 목표에 사용할 수 있는 다양한 시퀀싱 전략
● 10,000개 이상의 pene-complete 게놈이 조립되어 곰팡이 게놈 조립에 대한 경험이 풍부합니다.
● 보다 구체적인 연구 요구 사항을 충족하는 전문 판매 후 기술 지원 팀.
서비스 사양
| 서비스 | 시퀀싱 전략 | 품질 보장 | 예상 처리 시간 |
| 곰팡이 미세 지도 | 일루미나 50X+나노포어 100X | Contig N50≥2Mb | 영업일 기준 35일 |
| 팩바이오 하이파이 30X | |||
| 곰팡이 페니스 완전 지도 | 일루미나 50X+나노포어 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | 염색체 고정 비율 >90% | 45 영업일 |
생물정보학 분석
● 원시 데이터 품질 관리
● 게놈 조립
● 게놈 구성요소 분석
● 유전자 기능 주석
● 비교유전체 분석
샘플 요구 사항 및 배송
샘플 요구사항:
을 위한DNA 추출물:
| 샘플 유형 | 양 | 집중 | 청정 |
| DNA 추출물 | ＞ 1.2μg | ＞ 20ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
조직 샘플의 경우:
| 샘플 유형 | 권장되는 시료 처리 | 샘플 보관 및 배송 |
| 단세포 곰팡이 | 현미경으로 효모를 관찰하고 기하급수적으로 수집하세요. 배양물(약 3-4.5e9 세포 포함)을 1.5 또는 2 ml eppendorf로 옮깁니다.(얼음에 보관) 튜브를 14000g에서 1분 동안 원심분리하여 박테리아를 수집하고 상등액을 조심스럽게 제거합니다. 튜브를 밀봉하고 박테리아를 액체 질소에서 적어도 1-3시간 동안 동결시킵니다.튜브를 -80℃ 냉장고에 보관하세요. | 샘플을 액체질소에서 3~4시간 동안 동결시킨 후 액체질소 또는 장기 보관을 위해 영하 80도에 보관하세요.드라이아이스를 이용한 샘플 배송이 필요합니다. |
| 매크로 곰팡이 | 활발하게 성장하는 단계의 조직을 권장합니다. 내독소가 없는 물로 조직을 헹구고 70% 에토날로 헹구십시오. 샘플을 저온 튜브에 저장합니다. |
서비스 작업 흐름
샘플 배송
도서관 건립
시퀀싱
데이터 분석
판매 후 서비스
1. 곰팡이 게놈 구성 요소에 대한 Circos 다이어그램
2.비교유전체 분석: 계통수
견적
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