●ບັນທຶກຄວາມຊ່ຽວຊານແລະການພິມເຜີຍແຜ່ຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ດ້ວຍປະສົບການທີ່ສະສົມຢູ່ໃນ GWAS, BMKGene ໄດ້ສໍາເລັດໂຄງການຫຼາຍຮ້ອຍຊະນິດໃນການຄົ້ນຄວ້າ GWAS ປະຊາກອນ, ຊ່ວຍໃຫ້ນັກຄົ້ນຄວ້າເຜີຍແຜ່ຫຼາຍກວ່າ 100 ບົດຄວາມ, ແລະປັດໄຈຜົນກະທົບສະສົມໄດ້ບັນລຸ 500.
● ການວິເຄາະທາງດ້ານຊີວະວິທະຍາທີ່ສົມບູນ: workflow ປະກອບມີການວິເຄາະສະມາຄົມ SNP-trait, ສົ່ງຊຸດຂອງ genes ຜູ້ສະຫມັກແລະຄໍາບັນຍາຍທີ່ເປັນປະໂຫຍດທີ່ສອດຄ້ອງກັນຂອງພວກເຂົາ.
●ທີມງານ bioinformatics ຊໍານິຊໍານານສູງແລະວົງຈອນການວິເຄາະສັ້ນ: ດ້ວຍປະສົບການອັນດີໃນການວິເຄາະ genomics ຂັ້ນສູງ, ທີມງານຂອງ BMKGene ສະຫນອງການວິເຄາະທີ່ສົມບູນແບບດ້ວຍເວລາການປ່ຽນແປງທີ່ໄວ.
●ສະຫນັບສະຫນູນການຂາຍຫລັງ:ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍອອກໄປນອກເຫນືອການສໍາເລັດໂຄງການດ້ວຍໄລຍະເວລາການບໍລິການຫລັງການຂາຍ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການຊ່ວຍເຫຼືອການແກ້ໄຂບັນຫາ, ແລະກອງປະຊຸມ Q&A ເພື່ອແກ້ໄຂຄໍາຖາມໃດໆທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.
ປະເພດຂອງການຈັດລໍາດັບ | ຂະໜາດປະຊາກອນທີ່ແນະນຳ | ຍຸດທະສາດການຈັດລໍາດັບ | ຂໍ້ກໍານົດ Nucleotide |
ການຈັດລໍາດັບພັນທຸກໍາທັງໝົດ | 200 ຕົວຢ່າງ | 10x | ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ: ≥ 1 ng / µL ຈໍານວນທັງຫມົດ≥ 30ng ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ |
Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) | ຄວາມເລິກແທັກ: 10x ຈຳນວນແທັກ: < 400 Mb: WGS ຖືກແນະນຳ < 1Gb: 100K tags 1 Gb > 2Gb: 300K tags ສູງສຸດ 500k tags | ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ ≥ 5 ng/µL ຈໍານວນທັງຫມົດ ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Agarose gel: ບໍ່ມີຫຼືຈໍາກັດການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ
|
ແນວພັນທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ຊະນິດຍ່ອຍ, landraces / genebanks / ຄອບຄົວປະສົມ / ຊັບພະຍາກອນທໍາມະຊາດ
ແນວພັນທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, subspecies, landraces
ຄອບຄົວເຄິ່ງທີ່ມີຊີວິດ / ຄອບຄົວເຕັມທີ່ມີຊີວິດ / ຊັບພະຍາກອນທໍາມະຊາດ
ລວມມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:
ການວິເຄາະສະມາຄົມລັກສະນະ SNP – ດິນຕອນ Manhattan
ການວິເຄາະ SNP-trait ສະມາຄົມ – ແຜນ QQ
ສຳຫຼວດຄວາມກ້າວໜ້າທີ່ອຳນວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການຂອງ BMKGene de GWAS ໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາສິ່ງພິມທີ່ຄັດສັນມາ:
Lv, L. et al. (2023) 'ຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບພື້ນຖານພັນທຸກໍາຂອງຄວາມທົນທານຕໍ່ແອມໂມເນຍໃນ razor clam Sinonovacula constricta ໂດຍການສຶກສາສະມາຄົມທົ່ວ genome',ການລ້ຽງສັດນ້ຳ, 569, ໜ້າ. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Multi-omics ການວິເຄາະຂອງ 398 foxtail millet accessions ເປີດເຜີຍພາກພື້ນ genomic ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບພາຍໃນປະເທດ, ລັກສະນະ metabolite, ແລະຜົນກະທົບຕ້ານການອັກເສບ',ພືດໂມເລກຸນ, 15(8), ໜ້າ 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'ການສ້າງແຜນທີ່ສະມາຄົມທົ່ວພັນທຸກໍາຂອງປະກົດການຫຍໍ້ທໍ້ໃນສະພາບແວດລ້ອມແຫ້ງແລ້ງ',ຊາຍແດນໃນວິທະຍາສາດພືດ, 13, ຫນ້າ. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, ເຊິ່ງເຂົ້າລະຫັດ sulfotransferase, ໃຫ້ຄວາມຕ້ານທານຕໍ່ເຊື້ອໄວຣັດຖົ່ວເຫຼືອງ mosaic ສາຍພັນ G2 ແລະ G3',ພືດ, ຈຸລັງ ແລະສິ່ງແວດລ້ອມ, 44(8), ໜ້າ 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.