ການວິເຄາະສະມາຄົມທົ່ວ Genome
1.ຂໍ້ດີດ້ານການບໍລິການ
● ກໍລະນີໂຄງການທີ່ອຸດົມສົມບູນ: ນັບຕັ້ງແຕ່ການສ້າງຕັ້ງໃນປີ 2009, BMKGENE ໄດ້ສໍາເລັດໂຄງການຫຼາຍຮ້ອຍຊະນິດໃນການຄົ້ນຄວ້າປະຊາກອນຂອງ GWAS, ຊ່ວຍໃຫ້ນັກຄົ້ນຄວ້າເຜີຍແຜ່ຫຼາຍກວ່າ 100 ບົດຄວາມ, ແລະປັດໄຈຜົນກະທົບສະສົມໄດ້ບັນລຸ 500.
● ນັກວິເຄາະມືອາຊີບ.
● ວົງຈອນການວິເຄາະສັ້ນ.
● ການຂຸດຄົ້ນຂໍ້ມູນທີ່ຖືກຕ້ອງ.
2. ຂໍ້ມູນຈໍາເພາະການບໍລິການ
| ປະເພດ | ຂະໜາດປະຊາກອນ | ການຈັດລໍາດັບຍຸດທະສາດແລະຄວາມເລິກ |
| SLAF-GWAS | ຈໍານວນຕົວຢ່າງ ≥200 | ຂະໜາດຂອງ Genome < 400M, ດ້ວຍ genome ref-genome, WGS ແມ່ນແນະນຳ |
| ຂະໜາດຂອງ Genome ≤ 1G, 100K Tags ແລະ 10X | ||
| 1G ≤ ຂະຫນາດ Genome ≤ 2G, 200K Tags ແລະ 10X | ||
| ຂະໜາດຂອງ Genome > 2G, 300K Tags ແລະ 10X | ||
| WGS-GWAS | ຈໍານວນຕົວຢ່າງ ≥200 | 10X ສໍາລັບແຕ່ລະຕົວຢ່າງ |
3. ການເລືອກວັດສະດຸ
ແນວພັນທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ຊະນິດຍ່ອຍ, landraces / genebanks / ຄອບຄົວປະສົມ / ຊັບພະຍາກອນທໍາມະຊາດ
ແນວພັນທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, subspecies, landraces
ຄອບຄົວເຄິ່ງທີ່ມີຊີວິດ / ຄອບຄົວເຕັມທີ່ມີຊີວິດ / ຊັບພະຍາກອນທໍາມະຊາດ
4. ການວິເຄາະຂໍ້ມູນຊີວະພາບ
● ການວິເຄາະສະມາຄົມທົ່ວພັນທຸກໍາ
● ການວິເຄາະແລະການກວດກາ SNP ທີ່ສໍາຄັນ
● ຄຳອະທິບາຍປະກອບທີ່ມີປະໂຫຍດຂອງ gene ຂອງຜູ້ສະໝັກ
5. ກະແສວຽກບໍລິການ
ການອອກແບບທົດລອງ
ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ
ການສະກັດເອົາ RNA
ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ
ການຈັດລໍາດັບ
ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ
ບໍລິການຫຼັງການຂາຍ
ກ.Phenotype QC
histogram ການກະຈາຍຄວາມຖີ່
ສະຖິຕິ Phenotype
ຂ.ການວິເຄາະສະມາຄົມ (ແບບ: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
ແຜນການ QQ
Manhattan ດິນຕອນ
| ປີ | ວາລະສານ | IF | ຫົວຂໍ້ |
| 2022 | NC | 17.69 | ພື້ນຖານພັນທຸກໍາຂອງ giga-chromosomes ແລະ giga-genome ຂອງຕົ້ນໄມ້ peony Paeonia ostii |
| 2015 | NP | 7.43 | ຮອຍຕີນກາພາຍໃນປະເທດໄດ້ຍຶດເອົາຂົງເຂດພັນທຸກໍາທີ່ມີຄວາມສໍາຄັນທາງດ້ານກະສິກໍາຢູ່ໃນຖົ່ວເຫຼືອງ |
| 2018 | MP | 9.32 | ການຈັດລຽງພັນທຸກໍາຂອງພັນທຸກໍາທົ່ວໂລກຂອງການເຂົ້າພັນພືດ rapeseed ສະແດງໃຫ້ເຫັນພື້ນຖານທາງພັນທຸກໍາຂອງຄວາມແຕກຕ່າງກັນ ecotype ຂອງເຂົາເຈົ້າ. |
| 2022 | HR | 7.29 | ການວິເຄາະສະມາຄົມທົ່ວພັນທຸກໍາໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈໂມເລກຸນກ່ຽວກັບການປ່ຽນແປງທໍາມະຊາດຂອງຂະຫນາດເມັດຫມາກໂມ. |
