条形ປ້າຍໂຄສະນາ-03

Omics ເຊນດຽວ

  • BMKMANU S3000_ການຖອດຂໍ້ຄວາມຈາກພື້ນທີ່

    BMKMANU S3000_ການຖອດຂໍ້ຄວາມຈາກພື້ນທີ່

    Transscriptomics ທາງດ້ານພື້ນທີ່ຢືນຢູ່ໃນແຖວຫນ້າຂອງການປະດິດສ້າງທາງວິທະຍາສາດ, ການສ້າງຄວາມເຂັ້ມແຂງໃຫ້ນັກຄົ້ນຄວ້າເພື່ອເຈາະເລິກເຂົ້າໄປໃນຮູບແບບການສະແດງອອກຂອງ gene intricate ພາຍໃນແພຈຸລັງໃນຂະນະທີ່ຮັກສາສະພາບການທາງພື້ນທີ່ຂອງເຂົາເຈົ້າ. ທ່າມກາງເວທີຕ່າງໆ, BMKGene ໄດ້ພັດທະນາ BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, ມີຄວາມສາມາດປັບປຸງຄວາມລະອຽດຂອງ 3.5µm, ເຖິງຂອບເຂດ subcellular, ແລະເຮັດໃຫ້ການຕັ້ງຄ່າຄວາມລະອຽດຫຼາຍລະດັບ. ຊິບ S3000, ປະກອບດ້ວຍປະມານ 4 ລ້ານຈຸດ, ໃຊ້ microwells ຊັ້ນດ້ວຍລູກປັດທີ່ບັນຈຸດ້ວຍ probes ຈັບ barcoded ພື້ນທີ່. ຫ້ອງສະໝຸດ cDNA, ອຸດົມດ້ວຍບາໂຄດທາງກວ້າງຂອງພື້ນທີ່, ໄດ້ຖືກກະກຽມຈາກຊິບ S3000 ແລະຕໍ່ມາໄດ້ຕາມລໍາດັບໃນເວທີ Illumina NovaSeq. ການປະສົມປະສານຂອງຕົວຢ່າງ barcoded spatially ແລະ UMIs ຮັບປະກັນຄວາມຖືກຕ້ອງແລະຄວາມສະເພາະຂອງຂໍ້ມູນທີ່ສ້າງຂຶ້ນ. ຊິບ BMKManu S3000 ແມ່ນມີຄວາມຫຼາກຫຼາຍທີ່ສຸດ, ສະເຫນີການຕັ້ງຄ່າຄວາມລະອຽດຫຼາຍລະດັບທີ່ສາມາດປັບລະອຽດກັບເນື້ອເຍື່ອທີ່ແຕກຕ່າງກັນແລະລະດັບທີ່ຕ້ອງການຂອງລາຍລະອຽດ. ຄວາມສາມາດໃນການປັບຕົວນີ້ຈັດວາງຊິບເປັນທາງເລືອກທີ່ໂດດເດັ່ນສໍາລັບການສຶກສາ transcriptomics spatial ຫຼາກຫຼາຍຊະນິດ, ຮັບປະກັນການກຸ່ມພື້ນທີ່ຊັດເຈນໂດຍມີສຽງລົບກວນຫນ້ອຍ. ການນໍາໃຊ້ເທກໂນໂລຍີການແບ່ງສ່ວນຂອງເຊນກັບ BMKManu S3000 ຊ່ວຍໃຫ້ການກໍານົດຂອບເຂດຂອງຂໍ້ມູນ transcriptional ກັບຂອບເຂດຂອງຈຸລັງ, ເຊິ່ງກໍ່ໃຫ້ເກີດການວິເຄາະທີ່ມີຄວາມຫມາຍທາງຊີວະພາບໂດຍກົງ. ຍິ່ງໄປກວ່ານັ້ນ, ການປັບປຸງການແກ້ໄຂຂອງ S3000 ສົ່ງຜົນໃຫ້ມີຈໍານວນ genes ແລະ UMIs ທີ່ສູງຂື້ນທີ່ກວດພົບຕໍ່ເຊນ, ເຮັດໃຫ້ການວິເຄາະທີ່ຖືກຕ້ອງຫຼາຍຂອງຮູບແບບການຖ່າຍທອດທາງກວ້າງຂອງພື້ນທີ່ແລະການເປັນກຸ່ມຂອງຈຸລັງ.

  • ການຈັດລໍາດັບ RNA ນິວເຄລຍດຽວ

    ການຈັດລໍາດັບ RNA ນິວເຄລຍດຽວ

    ການພັດທະນາຂອງການບັນທຶກຈຸລັງດຽວແລະເຕັກນິກການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດທີ່ກໍາຫນົດເອງ, ບວກໃສ່ກັບລໍາດັບຜ່ານສູງ, ໄດ້ປະຕິວັດການສຶກສາການສະແດງອອກຂອງ gene ໃນລະດັບຈຸລັງ. ບາດກ້າວບຸກທະລຸນີ້ຊ່ວຍໃຫ້ມີການວິເຄາະເລິກ ແລະ ຄົບຖ້ວນກວ່າຂອງປະຊາກອນຈຸລັງທີ່ສັບສົນ, ເອົາຊະນະຂໍ້ຈຳກັດທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການສະແດງອອກຂອງ gene ໂດຍສະເລ່ຍຕໍ່ເຊລທັງໝົດ ແລະ ຮັກສາມູນເຊື້ອທີ່ແທ້ຈິງພາຍໃນປະຊາກອນເຫຼົ່ານີ້. ໃນຂະນະທີ່ການຈັດລໍາດັບ RNA ເຊນດຽວ (scRNA-seq) ມີຂໍ້ດີທີ່ບໍ່ສາມາດປະຕິເສດໄດ້, ມັນພົບກັບສິ່ງທ້າທາຍໃນບາງເນື້ອເຍື່ອທີ່ການສ້າງ suspension ຈຸລັງດຽວພິສູດໄດ້ຍາກແລະຕ້ອງການຕົວຢ່າງສົດ. ທີ່ BMKGene, ພວກເຮົາແກ້ໄຂອຸປະສັກນີ້ໂດຍການສະເຫນີການຈັດລໍາດັບ RNA ນິວເຄລຍດຽວ (snRNA-seq) ໂດຍໃຊ້ເທກໂນໂລຍີ 10X Genomics Chromium ທີ່ທັນສະໄຫມ. ວິທີນີ້ຂະຫຍາຍຂອບເຂດຂອງຕົວຢ່າງທີ່ເໝາະສົມກັບການວິເຄາະການຖອດຂໍ້ຄວາມໃນລະດັບເຊລດຽວ.

    ການໂດດດ່ຽວຂອງນິວເຄລຍແມ່ນສໍາເລັດໂດຍຜ່ານຊິບ 10X Genomics Chromium ນະວັດຕະກໍາ, ປະກອບດ້ວຍລະບົບ microfluidics ແປດຊ່ອງທີ່ມີການຂ້າມສອງເທົ່າ. ພາຍໃນລະບົບນີ້, gel beads ປະກອບດ້ວຍ barcodes, primers, enzymes, ແລະ nucleus ດຽວຖືກຫຸ້ມຢູ່ໃນນ້ໍາຂະຫນາດ nanoliter, ປະກອບເປັນ Gel Bead-in-Emulsion (GEM). ປະຕິບັດຕາມການສ້າງ GEM, ຈຸລັງ lysis ແລະການປ່ອຍ barcode ເກີດຂື້ນພາຍໃນແຕ່ລະ GEM. ຕໍ່ມາ, ໂມເລກຸນ mRNA ໄດ້ຮັບການຖອດຂໍ້ຄວາມແບບປີ້ນກັບ cDNAs, ຮວມເອົາບາໂຄດ 10X ແລະຕົວລະບຸໂມເລກຸນທີ່ເປັນເອກະລັກ (UMIs). cDNAs ເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນຂຶ້ນກັບການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດຕາມລໍາດັບມາດຕະຖານ, ອໍານວຍຄວາມສະດວກໃນການສໍາຫຼວດທີ່ເຂັ້ມແຂງແລະທີ່ສົມບູນແບບຂອງໂປຣໄຟລ໌ການສະແດງອອກຂອງ gene ໃນລະດັບຈຸລັງດຽວ.

    ເວທີ: 10× Genomics Chromium ແລະ Illumina NovaSeq Platform

  • 10x Genomics Visium Spatial Transcriptome

    10x Genomics Visium Spatial Transcriptome

    Spatial transcriptomics ແມ່ນເຕັກໂນໂລຢີທີ່ທັນສະ ໄໝ ທີ່ຊ່ວຍໃຫ້ນັກຄົ້ນຄວ້າສືບສວນຮູບແບບການສະແດງອອກຂອງ gene ພາຍໃນເນື້ອເຍື່ອໃນຂະນະທີ່ຮັກສາສະພາບການທາງກວ້າງຂອງພວກມັນ. ຫນຶ່ງໃນເວທີທີ່ມີປະສິດທິພາບໃນໂດເມນນີ້ແມ່ນ 10x Genomics Visium ບວກໃສ່ກັບລໍາດັບ Illumina. ຫຼັກການຂອງ 10X Visium ແມ່ນຢູ່ໃນຊິບພິເສດທີ່ມີພື້ນທີ່ການຈັບພາບທີ່ກໍານົດໄວ້ບ່ອນທີ່ພາກສ່ວນເນື້ອເຍື່ອຖືກວາງໄວ້. ພື້ນທີ່ການຈັບພາບນີ້ມີຈຸດທີ່ມີບາໂຄດ, ແຕ່ລະຈຸດທີ່ສອດຄ້ອງກັບສະຖານທີ່ທາງກວ້າງຂອງພື້ນທີ່ເປັນເອກະລັກພາຍໃນເນື້ອເຍື່ອ. ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ໂມເລກຸນ RNA ທີ່ຈັບໄດ້ຈາກເນື້ອເຍື່ອຈະຖືກຕິດສະຫຼາກດ້ວຍຕົວລະບຸໂມເລກຸນທີ່ເປັນເອກະລັກ (UMIs) ໃນລະຫວ່າງຂະບວນການຖອດຂໍ້ຄວາມແບບປີ້ນກັບກັນ. ຈຸດ barcoded ແລະ UMIs ເຫຼົ່ານີ້ເຮັດໃຫ້ການສ້າງແຜນທີ່ທາງກວ້າງຂອງພື້ນທີ່ຊັດເຈນແລະປະລິມານການສະແດງອອກຂອງ gene ໃນຄວາມລະອຽດຂອງຈຸລັງດຽວ. ການປະສົມປະສານຂອງຕົວຢ່າງ barcoded spatially ແລະ UMIs ຮັບປະກັນຄວາມຖືກຕ້ອງແລະຄວາມສະເພາະຂອງຂໍ້ມູນທີ່ສ້າງຂຶ້ນ. ໂດຍການນໍາໃຊ້ເຕັກໂນໂລຢີ Spatial Transcriptomics ນີ້, ນັກຄົ້ນຄວ້າສາມາດເຂົ້າໃຈຢ່າງເລິກເຊິ່ງກ່ຽວກັບອົງການຈັດຕັ້ງທາງກວ້າງຂອງຈຸລັງແລະປະຕິສໍາພັນໂມເລກຸນທີ່ສັບສົນທີ່ເກີດຂື້ນພາຍໃນເນື້ອເຍື່ອ, ສະເຫນີຄວາມເຂົ້າໃຈທີ່ບໍ່ມີຄ່າກ່ຽວກັບກົນໄກທີ່ຕິດພັນກັບຂະບວນການທາງຊີວະພາບໃນຫຼາຍຂົງເຂດ, ລວມທັງ oncology, neuroscience, ຊີວະວິທະຍາການພັດທະນາ, immunology. , ແລະການສຶກສາດ້ານພືດສາດ.

    ເວທີ: 10X Genomics Visium ແລະ Illumina NovaSeq

ສົ່ງຂໍ້ຄວາມຂອງເຈົ້າຫາພວກເຮົາ: